More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1924 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 340 aa  663    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2563  NUDIX hydrolase  50.31 
 
 		 347 aa  233  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2095  NUDIX hydrolase  45.96 
 
 		 327 aa  226  5.0000000000000005e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3833  NUDIX hydrolase  49.39 
 
 		 347 aa  224  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604823  normal  0.0662029 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12628  hypothetical protein  50.15 
 
 		 351 aa  222  6e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2247  NUDIX hydrolase  53.46 
 
 		 337 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2294  NUDIX hydrolase  53.46 
 
 		 337 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2286  NUDIX hydrolase  53.46 
 
 		 337 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  45.05 
 
 		 341 aa  182  9.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2292  hypothetical protein  54 
 
 		 177 aa  143  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 		 200 aa  108  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1663  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 184 aa  107  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.141747  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1372  NUDIX hydrolase  40.28 
 
 		 172 aa  105  9e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241238  normal  0.0421052 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17470  ADP-ribose pyrophosphatase  42.14 
 
 		 205 aa  100  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.580494  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0331  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 		 148 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3059  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 174 aa  95.1  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0446727  normal  0.591536 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1987  NUDIX hydrolase  43.57 
 
 		 204 aa  91.3  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587721 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0654  NUDIX hydrolase  36.31 
 
 		 164 aa  88.6  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14980  hypothetical protein  53.47 
 
 		 170 aa  86.7  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6519  NUDIX hydrolase  40.58 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.052102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2348  hypothetical protein  37.65 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3183  hypothetical protein  39.44 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3061  hypothetical protein  37.21 
 
 		 177 aa  75.1  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.035322  normal  0.205092 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7098  NUDIX hydrolase  37.24 
 
 		 166 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191544  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1789  hypothetical protein  37.5 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3529  hypothetical protein  37.61 
 
 		 149 aa  72  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6123  hypothetical protein  36.22 
 
 		 179 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.491402 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4799  nudix hydrolase  30.82 
 
 		 159 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1776  hypothetical protein  36.9 
 
 		 168 aa  70.5  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574343 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4022  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5151  hypothetical protein  39.33 
 
 		 199 aa  67  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0394065  decreased coverage  0.0000949613 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  36.8 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  36.8 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  36.8 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3815  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 		 151 aa  65.5  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2052  NUDIX hydrolase  30.32 
 
 		 153 aa  64.7  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1373  hypothetical protein  31.9 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.133284  normal  0.0713902 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1257  NUDIX hydrolase  41.83 
 
 		 146 aa  64.3  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1365  hypothetical protein  48.1 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.394746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2103  hypothetical protein  34.29 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409744  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1661  hypothetical protein  34.09 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.161543  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1352  secreted protein  39.77 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.117285  normal  0.456923 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5641  NUDIX hydrolase  36.15 
 
 		 146 aa  62.4  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2912  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 149 aa  62  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2607  NUDIX hydrolase  39.01 
 
 		 157 aa  61.6  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  34.4 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  34.4 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  36.73 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  36.73 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  34.4 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0747  hypothetical protein  32.73 
 
 		 153 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  37.31 
 
 		 156 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  37.31 
 
 		 157 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  35.83 
 
 		 134 aa  58.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1382  NUDIX hydrolase  37.31 
 
 		 156 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162154 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  38.06 
 
 		 157 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3352  NUDIX hydrolase  30.34 
 
 		 170 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  36.6 
 
 		 173 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  38.06 
 
 		 160 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  38.06 
 
 		 160 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  38.06 
 
 		 160 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2445  NUDIX hydrolase  36.99 
 
 		 169 aa  57.4  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.123324  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3480  NUDIX hydrolase  30.34 
 
 		 151 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4504  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2448  NUDIX hydrolase  27.35 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0479485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  45.59 
 
 		 141 aa  55.5  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  38.04 
 
 		 153 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  42.71 
 
 		 180 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2288  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 		 456 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 		 167 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6631  NUDIX hydrolase  32.9 
 
 		 169 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2071  hypothetical protein  38.78 
 
 		 181 aa  54.7  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.261498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  36.11 
 
 		 160 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  34.72 
 
 		 158 aa  55.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  29.6 
 
 		 156 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0463  NUDIX hydrolase  34.83 
 
 		 135 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0645  NUDIX hydrolase  34.92 
 
 		 153 aa  54.7  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0664584 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0464  MutT/nudix family protein  39.44 
 
 		 135 aa  54.3  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2406  NUDIX hydrolase  32.62 
 
 		 148 aa  54.3  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1788  hypothetical protein  33.15 
 
 		 225 aa  54.3  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0158619  normal  0.0636281 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  49.28 
 
 		 142 aa  54.3  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1103  NUDIX hydrolase  37.96 
 
 		 169 aa  54.3  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  39.8 
 
 		 160 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4004  NUDIX hydrolase  39.22 
 
 		 166 aa  53.9  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1305  NUDIX family hydrolase  35.16 
 
 		 149 aa  53.9  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1680  hypothetical protein  33.57 
 
 		 269 aa  53.5  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  35.79 
 
 		 156 aa  53.5  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  35.06 
 
 		 156 aa  53.5  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  37.38 
 
 		 336 aa  53.1  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0490  NUDIX/MutT family protein  43.53 
 
 		 168 aa  53.1  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000225283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2100  hypothetical protein  36.36 
 
 		 184 aa  52.8  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.301548  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1264  NUDIX hydrolase  47.83 
 
 		 146 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.879303 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2830  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 		 149 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282197  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2057  NUDIX hydrolase  42.35 
 
 		 168 aa  51.6  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169928  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 152 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0439  NUDIX hydrolase  36.62 
 
 		 145 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  32.91 
 
 		 155 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>