More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2052 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2052  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 153 aa  310  5.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3529  hypothetical protein  59.06 
 
 		 149 aa  166  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3815  NUDIX hydrolase  47.55 
 
 		 151 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4022  NUDIX hydrolase  48.25 
 
 		 153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4799  nudix hydrolase  43.15 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2448  NUDIX hydrolase  44.03 
 
 		 137 aa  133  7.000000000000001e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0479485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2912  NUDIX hydrolase  38.17 
 
 		 149 aa  87  9e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0331  NUDIX hydrolase  35.21 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7098  NUDIX hydrolase  35.86 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191544  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3352  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 		 170 aa  77  0.00000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3480  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6519  NUDIX hydrolase  31.69 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.052102 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  35.03 
 
 		 200 aa  72  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1372  NUDIX hydrolase  31.29 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241238  normal  0.0421052 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6631  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17470  ADP-ribose pyrophosphatase  30.14 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.580494  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1987  NUDIX hydrolase  32.19 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587721 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  30.32 
 
 		 340 aa  64.7  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  33.56 
 
 		 173 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2288  NUDIX hydrolase  33.8 
 
 		 456 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7377  NUDIX hydrolase  33.57 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2095  NUDIX hydrolase  31.61 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3059  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0446727  normal  0.591536 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1525  NUDIX hydrolase  34.25 
 
 		 441 aa  62  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103483 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  32.05 
 
 		 341 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1805  NUDIX hydrolase  34.25 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1663  NUDIX hydrolase  34.69 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.141747  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3833  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 		 347 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604823  normal  0.0662029 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1525  NUDIX hydrolase  33.56 
 
 		 179 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2695  normal  0.533617 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0654  NUDIX hydrolase  29.05 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2563  NUDIX hydrolase  31.61 
 
 		 347 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2607  NUDIX hydrolase  30.12 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2445  NUDIX hydrolase  30.52 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.123324  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2664  NUDIX hydrolase family protein  32.97 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.472799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3231  NUDIX hydrolase  55.36 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  30.16 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  30.16 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  30.16 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  45 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  30.16 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0576  NUDIX hydrolase  25.69 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  29.51 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  29.51 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  30.16 
 
 		 155 aa  50.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  36.46 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12628  hypothetical protein  29.41 
 
 		 351 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0502  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  29.36 
 
 		 181 aa  50.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0414588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  42.37 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 		 158 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  44.07 
 
 		 156 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2460  NUDIX hydrolase  28.19 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00334111  normal  0.173261 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  37.7 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  37.7 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2686  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  46.3 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310131  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2765  NUDIX hydrolase  46.3 
 
 		 151 aa  48.1  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000522672  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0631  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 144 aa  48.1  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1522  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  46.3 
 
 		 151 aa  48.1  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.596031  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2047  NUDIX hydrolase  74.19 
 
 		 156 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26314  predicted protein  34.69 
 
 		 243 aa  47.4  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1383  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 		 193 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4004  NUDIX hydrolase  33.54 
 
 		 166 aa  47.4  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  42.37 
 
 		 158 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  43.33 
 
 		 158 aa  46.2  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3198  dinucleoside polyphosphate hydrolase  44.26 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00084868  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3017  dinucleoside polyphosphate hydrolase  44.26 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000442704  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1119  dinucleoside polyphosphate hydrolase  30.1 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0904  dinucleoside polyphosphate hydrolase  42.62 
 
 		 177 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000367518  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3901  MutT/Nudix family protein  38.98 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267829  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0439  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4178  hydrolase, NUDIX family  38.98 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0036026 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3399  dinucleoside polyphosphate hydrolase  42.62 
 
 		 178 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  37.65 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5556  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.239043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3895  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3822  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4018  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 		 180 aa  45.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4063  mutT/nudix family protein  38.98 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000339826  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4380  mutT/nudix family protein  38.98 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000407544  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1755  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 		 161 aa  45.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0638574  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616693  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2153  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 		 176 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399297 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  39 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  32.52 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  49.18 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0234  NUDIX hydrolase  59.38 
 
 		 163 aa  44.7  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.425088  normal  0.397447 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0533  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0228598  normal  0.521082 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2125  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 143 aa  44.7  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1206  NUDIX hydrolase  65.62 
 
 		 154 aa  44.7  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.483034 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2145  dinucleoside polyphosphate hydrolase  30.91 
 
 		 172 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.69652 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  38.55 
 
 		 329 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>