More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2153 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2153  NUDIX hydrolase  100 
 
 
176 aa  350  5.9999999999999994e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.399297 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2439  NUDIX hydrolase  61.76 
 
 
181 aa  208  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1579  NUDIX hydrolase  45.88 
 
 
172 aa  155  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.904804  normal  0.0162238 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0341  NUDIX hydrolase  44.64 
 
 
186 aa  151  5e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0703  putative ADP-ribose pyrophosphatase  44.51 
 
 
186 aa  149  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0896  NUDIX hydrolase  47.65 
 
 
208 aa  142  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.22169  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1278  NUDIX hydrolase  44.77 
 
 
185 aa  142  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4804  NUDIX hydrolase  45.61 
 
 
188 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.483514 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14240  ADP-ribose pyrophosphatase  46.47 
 
 
182 aa  138  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336684  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4483  NUDIX hydrolase  39.16 
 
 
176 aa  102  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1544  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 
186 aa  74.7  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2928  NUDIX hydrolase  28.82 
 
 
189 aa  74.7  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  26.35 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0333  MutT/nudix family protein  36.59 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0452702  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1677  NUDIX hydrolase  30.11 
 
 
192 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.855535  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  27.81 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  29.59 
 
 
179 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  29.59 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  27.88 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2771  NUDIX hydrolase  31.79 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2672  NUDIX hydrolase  31.79 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.687973  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2474  MutT/nudix family protein  29.31 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.131904  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8603  transcriptional regulator, GntR family  28.65 
 
 
268 aa  70.9  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195942  normal  0.233283 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2896  NUDIX hydrolase  22.5 
 
 
166 aa  70.5  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3049  NUDIX hydrolase  26.9 
 
 
182 aa  70.9  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  27.22 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  27.22 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  27.22 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  27.22 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  28.02 
 
 
179 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  27.22 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2826  pyrophosphohydrolase related protein  28.65 
 
 
192 aa  70.5  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  27.22 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  28.4 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2209  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 
184 aa  69.7  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.022301  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  30 
 
 
179 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1242  NUDIX hydrolase  30.41 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  31.01 
 
 
179 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  31.48 
 
 
171 aa  68.6  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2429  NUDIX hydrolase  25.58 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0471  NUDIX hydrolase  26.63 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115783  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  26.95 
 
 
176 aa  67.4  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  30 
 
 
173 aa  67.8  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  30 
 
 
173 aa  67  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  28.73 
 
 
212 aa  67  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 
164 aa  67.4  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  23.64 
 
 
178 aa  66.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1886  NUDIX hydrolase  40 
 
 
172 aa  66.6  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.556059 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  31.08 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  25.3 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0830  NUDIX hydrolase  40 
 
 
177 aa  66.6  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.66661  normal  0.255619 
 
 
-
 
NC_002936  DET0456  MutT/nudix family protein  30.28 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0404799  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  25.79 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2467  NUDIX hydrolase  29.65 
 
 
181 aa  65.5  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  29.84 
 
 
187 aa  65.1  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  23.03 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0227  NUDIX hydrolase  34.56 
 
 
185 aa  65.1  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.282406  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  30.61 
 
 
281 aa  65.1  0.0000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  23.64 
 
 
176 aa  64.7  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0433  NUDIX hydrolase  26.44 
 
 
176 aa  64.7  0.0000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00447599  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1444  NUDIX hydrolase  30.29 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.9766  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 
187 aa  64.3  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13740  NTP pyrophosphohydrolase  31.58 
 
 
215 aa  64.3  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1716  NUDIX hydrolase  26.06 
 
 
171 aa  63.9  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0743315 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  29.75 
 
 
177 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1066  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 
201 aa  63.5  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.133388  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2192  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 
179 aa  63.2  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.349846  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  32.41 
 
 
185 aa  63.2  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  24.42 
 
 
187 aa  63.5  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  25.62 
 
 
177 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  28.23 
 
 
187 aa  63.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1336  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
171 aa  63.2  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.723792 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1429  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 
176 aa  62.4  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.742876  normal  0.0486947 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_398  MutT/nudix, ADP-ribose pyrophosphatase  26.44 
 
 
176 aa  62.8  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.148699  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3069  NUDIX hydrolase  27.75 
 
 
188 aa  62  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  27.33 
 
 
180 aa  61.6  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  23.9 
 
 
180 aa  61.6  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0271  NUDIX hydrolase  26.79 
 
 
180 aa  61.2  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.443042  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0745  NUDIX hydrolase  29.88 
 
 
175 aa  61.2  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3605  NUDIX hydrolase  23.84 
 
 
181 aa  61.2  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1662  NUDIX hydrolase  27.22 
 
 
201 aa  60.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
180 aa  59.7  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 
147 aa  60.1  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4063  NUDIX hydrolase  32.24 
 
 
228 aa  59.7  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0818284  normal  0.284545 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2271  ADP-ribose pyrophosphatase  30.07 
 
 
183 aa  60.1  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  27.71 
 
 
171 aa  60.1  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0237  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 
183 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373824  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1424  NUDIX hydrolase  26.86 
 
 
188 aa  59.7  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.884669  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  27.33 
 
 
172 aa  59.3  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  23.46 
 
 
176 aa  58.5  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  26.71 
 
 
178 aa  58.2  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  27.92 
 
 
184 aa  57.8  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  27.65 
 
 
180 aa  57.8  0.00000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  26.32 
 
 
175 aa  57.8  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2211  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 
164 aa  57.8  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1572  NUDIX hydrolase  29.34 
 
 
179 aa  57.4  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1344  hypothetical protein  28.57 
 
 
265 aa  57.8  0.00000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.321071  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0722  NUDIX hydrolase  26.9 
 
 
184 aa  57.4  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  26.44 
 
 
183 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>