More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1677 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1677  NUDIX hydrolase  100 
 
 
192 aa  398  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.855535  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1544  NUDIX hydrolase  71.35 
 
 
186 aa  271  5.000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1344  hypothetical protein  64.25 
 
 
265 aa  257  7e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.321071  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1495  NUDIX hydrolase  62.43 
 
 
182 aa  253  1.0000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.403846  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0982  NUDIX hydrolase  58.06 
 
 
177 aa  228  4e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.76015  normal  0.0931916 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6545  NUDIX hydrolase  53.89 
 
 
188 aa  201  5e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3605  NUDIX hydrolase  44.71 
 
 
181 aa  143  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3069  NUDIX hydrolase  39.05 
 
 
188 aa  139  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1424  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 
188 aa  123  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.884669  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2771  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 
192 aa  112  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1221  NUDIX hydrolase  33.92 
 
 
190 aa  111  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3586  NUDIX hydrolase  34.16 
 
 
186 aa  111  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5000  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 
180 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3513  NUDIX hydrolase  38.13 
 
 
184 aa  106  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.200164 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3899  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 
187 aa  103  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0039  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 
183 aa  97.4  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0055  NUDIX hydrolase  26.67 
 
 
196 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
178 aa  87.4  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  29.41 
 
 
210 aa  87  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  35.93 
 
 
177 aa  85.5  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  31.32 
 
 
181 aa  84  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  32.94 
 
 
210 aa  84  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 
211 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  30.86 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  28.25 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  29.89 
 
 
209 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1242  NUDIX hydrolase  29.35 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.141201  normal  0.571829 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  29.89 
 
 
209 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4063  NUDIX hydrolase  30.94 
 
 
228 aa  81.6  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0818284  normal  0.284545 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  29.32 
 
 
212 aa  81.3  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1222  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 
166 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524014  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  28.73 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  30.59 
 
 
177 aa  79.7  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  29.31 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0673  NUDIX hydrolase  32.68 
 
 
191 aa  79.3  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  34.84 
 
 
177 aa  79  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5882  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 
191 aa  79  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  30.72 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 
199 aa  77.8  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2835  NUDIX hydrolase  28.42 
 
 
210 aa  77.8  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0310181  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2467  NUDIX hydrolase  29.07 
 
 
181 aa  77.4  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0271  NUDIX hydrolase  30.59 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.443042  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2672  NUDIX hydrolase  28.83 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.687973  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  29.61 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 
178 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0722  NUDIX hydrolase  29.45 
 
 
184 aa  75.1  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  27.91 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  31.48 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2153  NUDIX hydrolase  30.11 
 
 
176 aa  73.6  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.399297 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  28.02 
 
 
207 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  30.51 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 
281 aa  72.4  0.000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0157  NUDIX hydrolase  31.87 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0179624  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2429  NUDIX hydrolase  30.68 
 
 
182 aa  72  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0180  NUDIX hydrolase  33.79 
 
 
183 aa  71.6  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195159 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  28.65 
 
 
180 aa  70.9  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 
195 aa  70.5  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  31.17 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2826  pyrophosphohydrolase related protein  28.16 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  27.75 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3049  NUDIX hydrolase  30.11 
 
 
182 aa  68.9  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3745  NUDIX hydrolase  27.81 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6699  NUDIX hydrolase  25.14 
 
 
215 aa  68.2  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.121967 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13740  NTP pyrophosphohydrolase  29.41 
 
 
215 aa  67  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  30.41 
 
 
186 aa  67.4  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2991  NUDIX hydrolase  27.46 
 
 
208 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  29.87 
 
 
187 aa  67.4  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 
199 aa  67.8  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1520  NUDIX hydrolase  27.91 
 
 
220 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234445  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  29.7 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  29.09 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0471  NUDIX hydrolase  29.05 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115783  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  29.52 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0237  NUDIX hydrolase  29.52 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373824  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2211  NUDIX hydrolase  31.17 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0010  MutT/nudix family protein  33.33 
 
 
188 aa  65.1  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4251  NUDIX hydrolase  29.27 
 
 
181 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.0489284 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4021  NUDIX hydrolase  29.27 
 
 
181 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  25.93 
 
 
187 aa  65.5  0.0000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4096  NUDIX hydrolase  29.27 
 
 
181 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.196207  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03661  NUDIX hydrolase  26.78 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  27.85 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0970  NUDIX hydrolase  25.41 
 
 
220 aa  65.1  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0333  MutT/nudix family protein  28.57 
 
 
189 aa  64.7  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0452702  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1652  NUDIX hydrolase  26.78 
 
 
186 aa  64.7  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.568517  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0219  NUDIX hydrolase  26.55 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1418  ADP-ribose pyrophosphatase  31.74 
 
 
207 aa  64.7  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.656759  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2486  NUDIX hydrolase  27.72 
 
 
193 aa  64.7  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.253943  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  29.19 
 
 
194 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2029  NUDIX hydrolase  28.32 
 
 
184 aa  64.3  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40025  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  29.22 
 
 
187 aa  64.3  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  28.18 
 
 
183 aa  63.9  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  32 
 
 
184 aa  63.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  28.74 
 
 
196 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  30.41 
 
 
186 aa  64.3  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  27.5 
 
 
176 aa  64.3  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1444  NUDIX hydrolase  24.56 
 
 
181 aa  64.3  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.9766  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
187 aa  64.3  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>