More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0555 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  100 
 
 
177 aa  352  1e-96  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  68.16 
 
 
180 aa  253  8e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  52.63 
 
 
179 aa  176  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  49.14 
 
 
180 aa  174  5e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  50 
 
 
183 aa  171  3.9999999999999995e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  51.48 
 
 
176 aa  168  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  48.85 
 
 
180 aa  167  6e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  50.9 
 
 
182 aa  167  9e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  46.33 
 
 
194 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  47.27 
 
 
196 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  48.5 
 
 
177 aa  161  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  47.27 
 
 
196 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  47.27 
 
 
196 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3241  NUDIX hydrolase  44.58 
 
 
200 aa  161  6e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.021012  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  47.31 
 
 
196 aa  161  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  47.31 
 
 
196 aa  160  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  47.27 
 
 
196 aa  160  7e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  47.88 
 
 
196 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1076  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  47.27 
 
 
196 aa  160  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1305  NUDIX family hydrolase  46.67 
 
 
196 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9435  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1814  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  46.67 
 
 
196 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  44.05 
 
 
185 aa  159  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1314  NUDIX family hydrolase  46.67 
 
 
196 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.861294  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0428  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  46.67 
 
 
196 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0722  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  46.67 
 
 
196 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  48.57 
 
 
179 aa  159  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1145  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  46.67 
 
 
196 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107087  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  45.73 
 
 
204 aa  158  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  45.24 
 
 
178 aa  158  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1451  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  46.06 
 
 
196 aa  157  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1439  NUDIX hydrolase  44.64 
 
 
204 aa  157  9e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  47.31 
 
 
194 aa  156  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  46.71 
 
 
194 aa  156  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  46.11 
 
 
199 aa  156  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1572  NUDIX hydrolase  53.8 
 
 
179 aa  155  3e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  43.83 
 
 
184 aa  155  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  45.78 
 
 
184 aa  154  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  45.51 
 
 
199 aa  154  7e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
179 aa  153  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  43.11 
 
 
205 aa  152  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  41.14 
 
 
178 aa  152  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  43.11 
 
 
281 aa  152  2.9999999999999998e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  46.11 
 
 
190 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  44.38 
 
 
180 aa  151  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1418  ADP-ribose pyrophosphatase  40.12 
 
 
207 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.656759  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1876  NUDIX hydrolase  42.51 
 
 
203 aa  150  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.48572 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  46.99 
 
 
184 aa  150  8e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  44.31 
 
 
177 aa  150  8.999999999999999e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  44.91 
 
 
196 aa  149  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  42.61 
 
 
199 aa  150  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
186 aa  149  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  43.64 
 
 
211 aa  149  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  43.11 
 
 
204 aa  149  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  44.31 
 
 
176 aa  149  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2199  NUDIX hydrolase  42.51 
 
 
203 aa  148  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  41.71 
 
 
189 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  42.94 
 
 
186 aa  145  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1515  NUDIX hydrolase  36.53 
 
 
208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1507  NUDIX hydrolase  40.83 
 
 
201 aa  143  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.694951  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  41.57 
 
 
173 aa  141  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  51.35 
 
 
178 aa  141  4e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  40.96 
 
 
173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  40.83 
 
 
175 aa  137  7.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  42.68 
 
 
185 aa  136  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  46.99 
 
 
180 aa  135  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  46.99 
 
 
180 aa  135  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  43.29 
 
 
214 aa  131  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  40.91 
 
 
179 aa  131  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 
179 aa  131  6e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 
212 aa  130  6.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  38.99 
 
 
173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  44.31 
 
 
176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  34.73 
 
 
201 aa  129  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0176  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
173 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0982781  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  40.34 
 
 
179 aa  127  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  40.34 
 
 
179 aa  127  6e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  40.34 
 
 
179 aa  127  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  40.34 
 
 
179 aa  127  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  40.34 
 
 
179 aa  127  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  42.07 
 
 
171 aa  127  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  38.92 
 
 
180 aa  127  6e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  40.34 
 
 
179 aa  127  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  39.77 
 
 
179 aa  127  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
208 aa  127  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  39.77 
 
 
179 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  36.65 
 
 
172 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  35.88 
 
 
210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  39.77 
 
 
179 aa  125  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  43.11 
 
 
176 aa  124  5e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  36.78 
 
 
199 aa  124  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  41.42 
 
 
180 aa  124  8.000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
215 aa  124  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  41.32 
 
 
183 aa  123  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  43.14 
 
 
187 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 
192 aa  123  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  41.4 
 
 
176 aa  123  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0238  NUDIX hydrolase  38.73 
 
 
186 aa  122  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0600  NUDIX hydrolase  40.59 
 
 
183 aa  123  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 
175 aa  122  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 
164 aa  122  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>