More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1222 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1222  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 166 aa  330  6e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5000  NUDIX hydrolase  53.01 
 
 		 180 aa  181  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3586  NUDIX hydrolase  36.2 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1424  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 		 188 aa  102  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.884669  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3069  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3605  NUDIX hydrolase  37.28 
 
 		 181 aa  98.2  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1544  NUDIX hydrolase  37.18 
 
 		 186 aa  96.7  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2771  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 		 192 aa  97.1  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1221  NUDIX hydrolase  30.49 
 
 		 190 aa  95.5  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  37.18 
 
 		 181 aa  95.1  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3899  NUDIX hydrolase  33.74 
 
 		 187 aa  95.1  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1344  hypothetical protein  35.26 
 
 		 265 aa  94.4  7e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.321071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3513  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 184 aa  92.8  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.200164 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0055  NUDIX hydrolase  35.06 
 
 		 196 aa  89  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0982  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 		 177 aa  88.6  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.76015  normal  0.0931916 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1495  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 		 182 aa  87  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.403846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0039  NUDIX hydrolase  41.84 
 
 		 183 aa  84.7  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6545  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 		 188 aa  84.7  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1677  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.855535  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  32.68 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0673  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  36.03 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  31.51 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0471  NUDIX hydrolase  32.1 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  33.97 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5882  NUDIX hydrolase  35.17 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  30.38 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2029  NUDIX hydrolase  31.68 
 
 		 184 aa  67.4  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  34.36 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0157  NUDIX hydrolase  34.87 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0179624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  27.33 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4146  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  26.11 
 
 		 179 aa  64.3  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6699  NUDIX hydrolase  32.05 
 
 		 215 aa  63.9  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.121967 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  29.33 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  33.54 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  26.03 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15030  NTP pyrophosphohydrolase  34.21 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  28 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1662  NUDIX hydrolase  29.94 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3458  NUDIX hydrolase  44.05 
 
 		 215 aa  62  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.185858  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2474  MutT/nudix family protein  28.21 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.131904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0978  NUDIX hydrolase  30.14 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0176  NUDIX hydrolase  34.92 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0982781  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0604  NUDIX hydrolase  33.55 
 
 		 187 aa  60.8  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0701215  normal  0.289612 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0271  NUDIX hydrolase  29.11 
 
 		 180 aa  61.2  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.443042  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0219  NUDIX hydrolase  27.5 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3745  NUDIX hydrolase  37.86 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  26.21 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0621  hypothetical protein  34.92 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0180  NUDIX hydrolase  33.11 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195159 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  27.21 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  30.67 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  32.28 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02241  hypothetical protein  33.77 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0727099  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  26.21 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  26.17 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  28.81 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1092  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0217104  hitchhiker  0.00264715 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  26.21 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  26.21 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  26.21 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  26.21 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  26.21 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2209  NUDIX hydrolase  27.81 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.022301  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  26.21 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  26.21 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  26.67 
 
 		 204 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 		 210 aa  57.4  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1429  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 		 176 aa  57.4  0.00000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.742876  normal  0.0486947 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  29.05 
 
 		 180 aa  57  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  27.81 
 
 		 186 aa  57  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  31.41 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1066  NUDIX hydrolase  32.3 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.133388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0105  NUDIX hydrolase  31.69 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2486  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.253943  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  31.41 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5916  ADP-ribose diphosphatase NudE  32.81 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4737  NUDIX hydrolase  30.14 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68380  ADP-ribose diphosphatase NudE  32.81 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000374463  normal  0.555558 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4523  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  30.86 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  27.85 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1336  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.723792 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2896  NUDIX hydrolase  28.06 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26230  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  25.37 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3598  NUDIX hydrolase  40.23 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1238  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0804984  hitchhiker  0.0000559773 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  31.41 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  30.65 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  28.03 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>