More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1662 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1662  NUDIX hydrolase  100 
 
 
201 aa  409  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0471  NUDIX hydrolase  67.22 
 
 
184 aa  263  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115783  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2826  pyrophosphohydrolase related protein  61.76 
 
 
192 aa  233  1.0000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2029  NUDIX hydrolase  57.65 
 
 
184 aa  212  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40025  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2474  MutT/nudix family protein  57.76 
 
 
182 aa  200  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.131904  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0333  MutT/nudix family protein  55.81 
 
 
189 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0452702  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0219  NUDIX hydrolase  53.85 
 
 
184 aa  193  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2928  NUDIX hydrolase  50 
 
 
189 aa  185  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3753  NUDIX hydrolase  44.69 
 
 
206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.641661  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1066  NUDIX hydrolase  45.98 
 
 
201 aa  161  5.0000000000000005e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.133388  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0271  NUDIX hydrolase  41.95 
 
 
180 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.443042  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3049  NUDIX hydrolase  37.43 
 
 
182 aa  123  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2429  NUDIX hydrolase  35.75 
 
 
182 aa  118  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2209  NUDIX hydrolase  35.93 
 
 
184 aa  116  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.022301  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 
184 aa  111  8.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  34.5 
 
 
180 aa  106  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  37.72 
 
 
177 aa  106  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0180  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
183 aa  104  9e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4251  NUDIX hydrolase  37.99 
 
 
181 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.0489284 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4021  NUDIX hydrolase  37.99 
 
 
181 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  34.32 
 
 
178 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4096  NUDIX hydrolase  37.99 
 
 
181 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.196207  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6125  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
178 aa  101  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0176  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 
173 aa  99.8  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0982781  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15030  NTP pyrophosphohydrolase  40.96 
 
 
181 aa  99.4  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202896  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2006  NUDIX hydrolase  34.46 
 
 
186 aa  99.4  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00276085  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2174  NUDIX hydrolase  36.9 
 
 
190 aa  98.2  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0334323  normal  0.0698698 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0157  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 
180 aa  98.2  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0179624  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
173 aa  97.8  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6699  NUDIX hydrolase  31.61 
 
 
215 aa  97.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.121967 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  36.99 
 
 
173 aa  96.7  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4146  NUDIX hydrolase  31.64 
 
 
180 aa  97.1  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 
181 aa  96.7  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02241  hypothetical protein  35.03 
 
 
179 aa  96.3  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0727099  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  35.44 
 
 
178 aa  95.9  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4737  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
174 aa  95.1  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000782  ADP-ribose pyrophosphatase  32.93 
 
 
179 aa  95.1  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  35.26 
 
 
177 aa  94  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  33.53 
 
 
177 aa  93.6  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4523  NUDIX hydrolase  39.35 
 
 
178 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 
176 aa  93.2  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2018  NUDIX hydrolase  37.64 
 
 
192 aa  92.4  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  30.11 
 
 
192 aa  92  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  31.84 
 
 
209 aa  91.7  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3065  hypothetical protein  35.59 
 
 
181 aa  90.9  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194764 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  35.67 
 
 
210 aa  91.3  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  31.28 
 
 
209 aa  89  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  31.28 
 
 
209 aa  89  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  32.4 
 
 
215 aa  88.2  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 
180 aa  87.8  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  30.54 
 
 
183 aa  87  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 
180 aa  86.3  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0978  NUDIX hydrolase  32.53 
 
 
189 aa  85.9  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  30.41 
 
 
185 aa  85.5  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
182 aa  85.1  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4016  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 
183 aa  85.1  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.298866 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2192  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 
179 aa  85.1  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.349846  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  33.53 
 
 
199 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1523  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 
180 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 
172 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29440  NUDIX family protein  32.16 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  29.61 
 
 
199 aa  83.6  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 
179 aa  82.4  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 
173 aa  82  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 
194 aa  82  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  33.54 
 
 
214 aa  81.6  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  29.57 
 
 
201 aa  81.6  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6067  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
193 aa  81.6  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0114891  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  32.63 
 
 
199 aa  81.3  0.000000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  33.13 
 
 
164 aa  80.9  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  34.16 
 
 
171 aa  80.9  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  37.16 
 
 
281 aa  80.5  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  29.65 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 
196 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  35.81 
 
 
213 aa  79.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  33.52 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  29.65 
 
 
176 aa  78.6  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  39.6 
 
 
186 aa  78.2  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2078  NUDIX family hydrolase  32.04 
 
 
194 aa  78.2  0.00000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  32.47 
 
 
187 aa  78.2  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  37.86 
 
 
187 aa  77.8  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  30.73 
 
 
211 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  37.3 
 
 
178 aa  77.4  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 
199 aa  76.6  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3458  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 
215 aa  76.3  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.185858  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2211  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0185  hypothetical protein  30.77 
 
 
335 aa  75.9  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.533354  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  29.59 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  30 
 
 
211 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  28.65 
 
 
175 aa  75.5  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1489  NUDIX hydrolase  33.54 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1652  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 
186 aa  75.1  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.568517  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03121  NUDIX hydrolase  34 
 
 
189 aa  75.1  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  29.14 
 
 
207 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  31.68 
 
 
194 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1314  NUDIX family hydrolase  30.43 
 
 
196 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.861294  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0428  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.43 
 
 
196 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03661  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0722  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.43 
 
 
196 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>