More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1358 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 194 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  96.39 
 
 		 194 aa  390  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  83.25 
 
 		 196 aa  340  5e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0722  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  81.25 
 
 		 196 aa  338  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1314  NUDIX family hydrolase  81.25 
 
 		 196 aa  338  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.861294  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1814  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  81.25 
 
 		 196 aa  338  2e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1305  NUDIX family hydrolase  81.25 
 
 		 196 aa  338  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9435  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0428  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  81.25 
 
 		 196 aa  338  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1145  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  81.25 
 
 		 196 aa  338  2e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107087  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  83.25 
 
 		 196 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  82.72 
 
 		 196 aa  338  4e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  82.72 
 
 		 196 aa  338  4e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1451  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  80.73 
 
 		 196 aa  337  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  82.72 
 
 		 196 aa  337  9e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  80.93 
 
 		 196 aa  336  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1076  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  81.68 
 
 		 196 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  82.72 
 
 		 196 aa  335  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  82.72 
 
 		 196 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1876  NUDIX hydrolase  69.95 
 
 		 203 aa  277  7e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.48572 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  69.4 
 
 		 205 aa  276  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2199  NUDIX hydrolase  69.95 
 
 		 203 aa  274  7e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  67.55 
 
 		 204 aa  272  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  66.31 
 
 		 211 aa  263  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1439  NUDIX hydrolase  61.38 
 
 		 204 aa  239  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3241  NUDIX hydrolase  60.56 
 
 		 200 aa  231  7.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.021012  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  59.68 
 
 		 204 aa  226  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1515  NUDIX hydrolase  51.85 
 
 		 208 aa  222  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  53.37 
 
 		 199 aa  209  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1507  NUDIX hydrolase  52.94 
 
 		 201 aa  205  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.694951  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1418  ADP-ribose pyrophosphatase  51.08 
 
 		 207 aa  202  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.656759  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  52.17 
 
 		 199 aa  201  5e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  52.81 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 199 aa  190  9e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 194 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  46.33 
 
 		 180 aa  171  3.9999999999999995e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  46.71 
 
 		 177 aa  156  2e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  43.2 
 
 		 189 aa  155  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  43.29 
 
 		 183 aa  144  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  46.11 
 
 		 180 aa  142  2e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  44.17 
 
 		 184 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  40.12 
 
 		 178 aa  139  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  41.52 
 
 		 177 aa  138  6e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 178 aa  136  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  39.08 
 
 		 180 aa  136  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  39.51 
 
 		 179 aa  134  8e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 		 182 aa  130  9e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  40.11 
 
 		 281 aa  129  2.0000000000000002e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  40.83 
 
 		 176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  38.15 
 
 		 176 aa  127  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  40.23 
 
 		 190 aa  127  9.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  37.06 
 
 		 176 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  38.69 
 
 		 179 aa  125  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  40.45 
 
 		 180 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  38.73 
 
 		 177 aa  124  7e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 178 aa  124  1e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 		 184 aa  123  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  36 
 
 		 179 aa  121  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  36 
 
 		 179 aa  121  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  36 
 
 		 179 aa  121  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  36 
 
 		 179 aa  121  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  36 
 
 		 179 aa  121  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  37.64 
 
 		 186 aa  121  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  36 
 
 		 179 aa  122  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  36 
 
 		 179 aa  121  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  36.99 
 
 		 176 aa  121  6e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  38.73 
 
 		 186 aa  121  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 179 aa  121  8e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 180 aa  120  8e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 179 aa  120  9e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  37.35 
 
 		 180 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  35.43 
 
 		 179 aa  119  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  36 
 
 		 179 aa  119  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1572  NUDIX hydrolase  41.36 
 
 		 179 aa  118  6e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  35.56 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  35.44 
 
 		 171 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  36.71 
 
 		 184 aa  111  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  34.81 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  35.39 
 
 		 179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0227  NUDIX hydrolase  40.4 
 
 		 185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.282406  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 180 aa  109  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 180 aa  109  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  35.15 
 
 		 171 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  34.18 
 
 		 214 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 176 aa  106  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  38.42 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  34.18 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1716  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 		 171 aa  103  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0743315 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  33.7 
 
 		 215 aa  101  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  33.52 
 
 		 192 aa  101  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0600  NUDIX hydrolase  32.95 
 
 		 183 aa  101  8e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  31.79 
 
 		 183 aa  99.4  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  31.79 
 
 		 183 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 		 175 aa  98.2  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  35.75 
 
 		 199 aa  98.2  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 209 aa  97.8  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 209 aa  97.8  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  42.52 
 
 		 213 aa  97.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2078  NUDIX family hydrolase  34.27 
 
 		 194 aa  97.4  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  37.7 
 
 		 208 aa  97.1  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>