More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0176 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0176  NUDIX hydrolase  100 
 
 
173 aa  349  1e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0982781  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  72.25 
 
 
173 aa  255  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  68.82 
 
 
173 aa  248  3e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  68.24 
 
 
173 aa  246  8e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3354  mutT/nudix family protein  71.35 
 
 
173 aa  239  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  44.79 
 
 
171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
177 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  37.27 
 
 
178 aa  125  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 
180 aa  122  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
176 aa  122  3e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  33.95 
 
 
182 aa  121  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  40.59 
 
 
186 aa  120  8e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  38.92 
 
 
186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  36.81 
 
 
180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
179 aa  118  4.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 
184 aa  117  7.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  37.42 
 
 
180 aa  117  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 
178 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  42.45 
 
 
172 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  38.97 
 
 
183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  35.37 
 
 
179 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  36.48 
 
 
179 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  37.87 
 
 
281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  36.48 
 
 
179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  36.48 
 
 
179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  36.48 
 
 
179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  36.48 
 
 
179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  36.48 
 
 
179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  36.48 
 
 
179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  36.48 
 
 
179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  39.87 
 
 
194 aa  112  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  36.48 
 
 
179 aa  112  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  35.85 
 
 
179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2896  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 
166 aa  107  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 
179 aa  105  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  36.59 
 
 
171 aa  105  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 
179 aa  103  8e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 
175 aa  104  8e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03661  NUDIX hydrolase  41.55 
 
 
186 aa  104  8e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  36.42 
 
 
185 aa  103  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2211  NUDIX hydrolase  40.72 
 
 
164 aa  103  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  40.24 
 
 
192 aa  103  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  35.44 
 
 
190 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  29.3 
 
 
184 aa  103  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  33.54 
 
 
180 aa  102  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  34.76 
 
 
176 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 
177 aa  102  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  34.73 
 
 
177 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  39.01 
 
 
214 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1652  NUDIX hydrolase  40.85 
 
 
186 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.568517  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  33.33 
 
 
176 aa  102  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  37.89 
 
 
184 aa  101  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 
182 aa  100  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  34.76 
 
 
184 aa  100  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0212  NUDIX hydrolase  38.99 
 
 
186 aa  100  9e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.465676  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0471  NUDIX hydrolase  32.95 
 
 
184 aa  100  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115783  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2271  ADP-ribose pyrophosphatase  42.34 
 
 
183 aa  100  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  35.12 
 
 
199 aa  100  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  33.33 
 
 
176 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03121  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 
189 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25181  NUDIX hydrolase  39.74 
 
 
189 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  37.2 
 
 
180 aa  99.4  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0238  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
186 aa  99.4  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2474  MutT/nudix family protein  40.94 
 
 
182 aa  99.4  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.131904  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1662  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 
201 aa  99.8  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  33.13 
 
 
195 aa  99.4  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 
169 aa  99  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  39.57 
 
 
185 aa  99  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  40.14 
 
 
187 aa  99  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  35.62 
 
 
184 aa  99  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  44.78 
 
 
164 aa  98.6  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1876  NUDIX hydrolase  37.34 
 
 
203 aa  98.2  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.48572 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  37.36 
 
 
201 aa  97.8  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 
175 aa  97.4  8e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  39.44 
 
 
187 aa  97.4  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  41.13 
 
 
181 aa  95.9  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  38.81 
 
 
204 aa  95.1  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2029  NUDIX hydrolase  40.15 
 
 
184 aa  94.7  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40025  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  38.73 
 
 
187 aa  94.7  6e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2834  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 
169 aa  93.6  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  26.38 
 
 
183 aa  94  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  31.1 
 
 
180 aa  93.6  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  31.1 
 
 
180 aa  93.6  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  37.72 
 
 
201 aa  93.2  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  35.9 
 
 
205 aa  92.8  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 
211 aa  92.8  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2199  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 
203 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_398  MutT/nudix, ADP-ribose pyrophosphatase  32.73 
 
 
176 aa  91.7  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.148699  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 
189 aa  90.5  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  35.03 
 
 
196 aa  90.1  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0433  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 
176 aa  90.1  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00447599  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1134  NUDIX hydrolase  41.3 
 
 
200 aa  90.5  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0268  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 
165 aa  90.1  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.880251  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2826  pyrophosphohydrolase related protein  37.98 
 
 
192 aa  89.4  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0271  NUDIX hydrolase  35.17 
 
 
180 aa  89.7  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.443042  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  32.94 
 
 
199 aa  89  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 
204 aa  88.6  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  31.41 
 
 
176 aa  88.6  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
196 aa  88.6  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03191  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 
186 aa  88.6  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.798424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>