More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1912 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  100 
 
 
201 aa  391  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  87.56 
 
 
201 aa  323  8.000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1755  NUDIX hydrolase  59.39 
 
 
207 aa  190  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0106102  hitchhiker  0.000762275 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1519  NUDIX hydrolase  52.63 
 
 
220 aa  185  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000389624 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  57.22 
 
 
210 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1133  NUDIX hydrolase  51.47 
 
 
225 aa  183  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3156  NUDIX hydrolase  55 
 
 
207 aa  181  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.38817  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  55.25 
 
 
209 aa  181  7e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  54.7 
 
 
209 aa  178  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1520  NUDIX hydrolase  51.89 
 
 
220 aa  178  4.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234445  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  54.7 
 
 
209 aa  178  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  50.51 
 
 
212 aa  175  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4431  NUDIX hydrolase  57.14 
 
 
188 aa  174  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.212401  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2348  NUDIX hydrolase  53.51 
 
 
210 aa  174  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00912328  normal  0.0106592 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  51.76 
 
 
210 aa  172  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  54.49 
 
 
211 aa  171  9e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3140  NUDIX hydrolase  51.09 
 
 
225 aa  170  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511935  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  52.81 
 
 
211 aa  169  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  49.49 
 
 
215 aa  167  7e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  55.62 
 
 
213 aa  166  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1348  NUDIX hydrolase  56.7 
 
 
217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.841772  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22070  NTP pyrophosphohydrolase  53.55 
 
 
219 aa  165  5e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  49.44 
 
 
199 aa  160  9e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2991  NUDIX hydrolase  52.3 
 
 
208 aa  154  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  49.44 
 
 
208 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1665  NUDIX hydrolase  55.68 
 
 
203 aa  152  4e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0528877  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  48 
 
 
207 aa  151  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2835  NUDIX hydrolase  49.49 
 
 
210 aa  149  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0310181  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4063  NUDIX hydrolase  46.7 
 
 
228 aa  149  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0818284  normal  0.284545 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1242  NUDIX hydrolase  48.04 
 
 
216 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.141201  normal  0.571829 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14200  NUDIX family protein  43.3 
 
 
235 aa  144  8.000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0659704  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13740  NTP pyrophosphohydrolase  49.44 
 
 
215 aa  142  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1200  hypothetical protein  52.75 
 
 
207 aa  137  7.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.552549  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  44.89 
 
 
178 aa  136  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 
180 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0970  NUDIX hydrolase  47.94 
 
 
220 aa  129  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  34.73 
 
 
177 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
179 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 
180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  44.31 
 
 
177 aa  125  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  38.69 
 
 
176 aa  122  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  39.55 
 
 
180 aa  121  5e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  40 
 
 
182 aa  122  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  38.41 
 
 
178 aa  121  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 
176 aa  121  9e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  41.28 
 
 
179 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
177 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  44.1 
 
 
281 aa  118  7e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  36.02 
 
 
179 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  38.07 
 
 
192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  34.78 
 
 
179 aa  111  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  34.78 
 
 
179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  34.78 
 
 
179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  34.78 
 
 
179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  34.78 
 
 
179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  34.78 
 
 
179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  34.78 
 
 
179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  36.78 
 
 
186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  35.57 
 
 
179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
183 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  40.25 
 
 
184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  33.52 
 
 
176 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  36.93 
 
 
172 aa  108  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  34.94 
 
 
184 aa  108  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1886  NUDIX hydrolase  41.21 
 
 
172 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.556059 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 
190 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  34.16 
 
 
179 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  42.01 
 
 
171 aa  107  9.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  36.41 
 
 
199 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  35.76 
 
 
199 aa  106  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 
179 aa  105  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 
199 aa  105  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 
194 aa  104  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  38.15 
 
 
173 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1418  ADP-ribose pyrophosphatase  39.11 
 
 
207 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.656759  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 
180 aa  102  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 
180 aa  102  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 
189 aa  102  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 
186 aa  102  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  44.7 
 
 
204 aa  102  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  34.1 
 
 
185 aa  100  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1439  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
204 aa  100  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  40.49 
 
 
175 aa  100  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1515  NUDIX hydrolase  35.26 
 
 
208 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  39.76 
 
 
181 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  31.36 
 
 
176 aa  99.8  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1429  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 
176 aa  100  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.742876  normal  0.0486947 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1076  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.84 
 
 
196 aa  99.4  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  35.84 
 
 
194 aa  99.4  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0830  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 
177 aa  99  4e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.66661  normal  0.255619 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 
183 aa  99  4e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2078  NUDIX family hydrolase  33.14 
 
 
194 aa  98.6  6e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2896  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 
166 aa  98.2  7e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1134  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 
200 aa  97.8  9e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12410  NUDIX family protein  44.63 
 
 
227 aa  97.8  9e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.274172  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0176  NUDIX hydrolase  37.36 
 
 
173 aa  97.8  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0982781  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1336  NUDIX hydrolase  40.49 
 
 
171 aa  97.4  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.723792 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  36.99 
 
 
173 aa  97.8  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  33.15 
 
 
211 aa  97.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>