More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5434 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  100 
 
 
213 aa  409  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  68.42 
 
 
210 aa  282  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  57.69 
 
 
211 aa  229  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  57.35 
 
 
209 aa  224  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  57.35 
 
 
209 aa  224  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  56.73 
 
 
211 aa  223  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  56.86 
 
 
209 aa  222  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  51.96 
 
 
207 aa  211  7e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  51.98 
 
 
215 aa  197  9e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  51.96 
 
 
210 aa  186  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  56.98 
 
 
201 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4063  NUDIX hydrolase  51.74 
 
 
228 aa  176  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0818284  normal  0.284545 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  49.21 
 
 
199 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  55.88 
 
 
201 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  46.88 
 
 
212 aa  153  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  44.9 
 
 
208 aa  148  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3156  NUDIX hydrolase  48.24 
 
 
207 aa  146  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.38817  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  43.02 
 
 
178 aa  145  6e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1242  NUDIX hydrolase  47.64 
 
 
216 aa  142  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.141201  normal  0.571829 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3140  NUDIX hydrolase  43.6 
 
 
225 aa  140  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511935  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13740  NTP pyrophosphohydrolase  47.21 
 
 
215 aa  139  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1755  NUDIX hydrolase  46.23 
 
 
207 aa  139  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0106102  hitchhiker  0.000762275 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4431  NUDIX hydrolase  47.51 
 
 
188 aa  137  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.212401  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  42.26 
 
 
177 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  38.42 
 
 
184 aa  133  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1133  NUDIX hydrolase  44.22 
 
 
225 aa  132  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1519  NUDIX hydrolase  43.81 
 
 
220 aa  131  6e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000389624 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  41.04 
 
 
178 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2835  NUDIX hydrolase  47.21 
 
 
210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0310181  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2348  NUDIX hydrolase  43.56 
 
 
210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00912328  normal  0.0106592 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22070  NTP pyrophosphohydrolase  46.04 
 
 
219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1520  NUDIX hydrolase  41.12 
 
 
220 aa  129  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234445  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  44.72 
 
 
177 aa  128  7.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 
179 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  37.91 
 
 
192 aa  124  8.000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  39.52 
 
 
172 aa  124  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 
179 aa  124  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2991  NUDIX hydrolase  44.88 
 
 
208 aa  123  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  37.43 
 
 
183 aa  122  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 
182 aa  121  6e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  36.57 
 
 
180 aa  119  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 
176 aa  119  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  38.55 
 
 
176 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  35.47 
 
 
180 aa  117  9e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1665  NUDIX hydrolase  48.33 
 
 
203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0528877  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  35.06 
 
 
180 aa  116  3e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1348  NUDIX hydrolase  47.1 
 
 
217 aa  116  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.841772  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  37.89 
 
 
186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0970  NUDIX hydrolase  48.78 
 
 
220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1200  hypothetical protein  45.51 
 
 
207 aa  112  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.552549  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  38.67 
 
 
179 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  30.29 
 
 
183 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  38.69 
 
 
194 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  38 
 
 
179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  38 
 
 
179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  38 
 
 
179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  38 
 
 
179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  38 
 
 
179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  38 
 
 
179 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  38 
 
 
179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 
177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  38 
 
 
179 aa  109  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4146  NUDIX hydrolase  36.93 
 
 
180 aa  108  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  37.33 
 
 
179 aa  107  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  37.89 
 
 
186 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  38.55 
 
 
281 aa  107  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  37.33 
 
 
179 aa  106  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  37.99 
 
 
194 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  47.46 
 
 
180 aa  103  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 
194 aa  102  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  29.55 
 
 
187 aa  101  7e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  38.55 
 
 
171 aa  100  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 
199 aa  100  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14200  NUDIX family protein  36.82 
 
 
235 aa  100  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0659704  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  35 
 
 
180 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  35 
 
 
180 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
211 aa  99.8  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 
179 aa  99.4  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  37.28 
 
 
184 aa  99  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
199 aa  98.6  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  30.17 
 
 
184 aa  98.6  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0219  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
184 aa  98.2  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2029  NUDIX hydrolase  35.91 
 
 
184 aa  97.4  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40025  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0978  NUDIX hydrolase  38.55 
 
 
189 aa  97.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03121  NUDIX hydrolase  33.55 
 
 
189 aa  97.1  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  33.54 
 
 
176 aa  97.1  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3241  NUDIX hydrolase  34.76 
 
 
200 aa  95.1  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.021012  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  28.49 
 
 
182 aa  94.4  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0471  NUDIX hydrolase  35.39 
 
 
184 aa  94.4  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115783  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  32.91 
 
 
176 aa  94.4  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
204 aa  94.7  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  34.73 
 
 
185 aa  93.6  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  37.06 
 
 
196 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  37.06 
 
 
196 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1652  NUDIX hydrolase  27.13 
 
 
186 aa  92.8  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.568517  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  37.06 
 
 
196 aa  92.8  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  29.09 
 
 
187 aa  93.2  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  34.66 
 
 
196 aa  92.8  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03661  NUDIX hydrolase  26.6 
 
 
186 aa  92.8  4e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0238  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 
186 aa  92.4  5e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>