More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2018 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2018  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 192 aa  385  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6067  NUDIX hydrolase  47.78 
 
 		 193 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0114891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1523  NUDIX hydrolase  45.14 
 
 		 180 aa  162  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02241  hypothetical protein  46.78 
 
 		 179 aa  158  5e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0727099  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6125  NUDIX hydrolase  48.84 
 
 		 178 aa  154  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3065  hypothetical protein  45.98 
 
 		 181 aa  154  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194764 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4146  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 180 aa  149  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4737  NUDIX hydrolase  46.29 
 
 		 174 aa  147  8e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4251  NUDIX hydrolase  46.59 
 
 		 181 aa  144  9e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.0489284 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4021  NUDIX hydrolase  46.59 
 
 		 181 aa  144  9e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4096  NUDIX hydrolase  46.59 
 
 		 181 aa  144  9e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.196207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1489  NUDIX hydrolase  48.45 
 
 		 173 aa  144  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2006  NUDIX hydrolase  46.37 
 
 		 186 aa  142  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00276085  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000782  ADP-ribose pyrophosphatase  38.98 
 
 		 179 aa  142  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4797  NUDIX hydrolase  43.41 
 
 		 196 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.868054  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29440  NUDIX family protein  47.95 
 
 		 179 aa  137  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4016  NUDIX hydrolase  45.14 
 
 		 183 aa  131  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.298866 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2174  NUDIX hydrolase  42.77 
 
 		 190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0334323  normal  0.0698698 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4523  NUDIX hydrolase  43.23 
 
 		 178 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2209  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 		 184 aa  108  7.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.022301  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  36.57 
 
 		 178 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3458  NUDIX hydrolase  40.12 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.185858  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2029  NUDIX hydrolase  39.77 
 
 		 184 aa  101  8e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 		 209 aa  101  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  35.87 
 
 		 215 aa  98.6  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  37.79 
 
 		 180 aa  98.2  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 		 209 aa  98.2  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 		 209 aa  98.2  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0157  NUDIX hydrolase  38.79 
 
 		 180 aa  97.1  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0179624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0271  NUDIX hydrolase  37.36 
 
 		 180 aa  95.9  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.443042  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 		 179 aa  95.5  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0471  NUDIX hydrolase  33.15 
 
 		 184 aa  95.5  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0219  NUDIX hydrolase  34.83 
 
 		 184 aa  93.6  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1662  NUDIX hydrolase  37.64 
 
 		 201 aa  92.4  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3586  NUDIX hydrolase  34.1 
 
 		 186 aa  92.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  40.36 
 
 		 184 aa  91.3  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  32.16 
 
 		 182 aa  91.3  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2826  pyrophosphohydrolase related protein  35.84 
 
 		 192 aa  90.9  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6699  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 		 215 aa  89  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.121967 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2474  MutT/nudix family protein  34.86 
 
 		 182 aa  88.2  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.131904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 183 aa  87.8  9e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  32.02 
 
 		 179 aa  87.4  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15030  NTP pyrophosphohydrolase  40.61 
 
 		 181 aa  87.4  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  36.16 
 
 		 207 aa  85.1  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  38.36 
 
 		 177 aa  84.3  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2192  NUDIX hydrolase  38.42 
 
 		 179 aa  83.6  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.349846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  34.46 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0180  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 183 aa  83.2  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195159 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  34.03 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  33.53 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0333  MutT/nudix family protein  35.09 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0452702  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2928  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  31.61 
 
 		 190 aa  81.6  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  34.12 
 
 		 178 aa  80.9  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3899  NUDIX hydrolase  30.41 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2078  NUDIX family hydrolase  30.34 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  29.78 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3513  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.200164 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3049  NUDIX hydrolase  35.75 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 		 211 aa  77.8  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  33.72 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1572  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 		 179 aa  77.4  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1221  NUDIX hydrolase  30.41 
 
 		 190 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2429  NUDIX hydrolase  35.03 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  36.15 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  35.33 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  27.75 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 		 177 aa  76.3  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  29.76 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  35.98 
 
 		 175 aa  75.9  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0456  MutT/nudix family protein  32.76 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0404799  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  32.14 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  27.75 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1418  ADP-ribose pyrophosphatase  34.64 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.656759  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  28.32 
 
 		 195 aa  74.7  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0970  NUDIX hydrolase  39.5 
 
 		 220 aa  74.3  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  35.47 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  29.71 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  29.47 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_398  MutT/nudix, ADP-ribose pyrophosphatase  32.94 
 
 		 176 aa  73.9  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.148699  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  31.28 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0237  NUDIX hydrolase  33.55 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373824  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0978  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  29.14 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  30.18 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1066  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.133388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0176  NUDIX hydrolase  41.5 
 
 		 173 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0982781  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  33.77 
 
 		 171 aa  72  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2771  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 		 192 aa  72  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  30.06 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  38.26 
 
 		 173 aa  71.6  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  29.89 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  34.39 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0433  NUDIX hydrolase  34.12 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00447599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>