More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_398 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_398  MutT/nudix, ADP-ribose pyrophosphatase  100 
 
 		 176 aa  360  7.0000000000000005e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.148699  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0456  MutT/nudix family protein  91.48 
 
 		 176 aa  333  1e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0404799  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0433  NUDIX hydrolase  89.14 
 
 		 176 aa  327  4e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00447599  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  39.41 
 
 		 179 aa  136  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  39.76 
 
 		 183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  39.52 
 
 		 182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 178 aa  127  6e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  37.87 
 
 		 180 aa  127  7.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  40.83 
 
 		 179 aa  127  8.000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  39.76 
 
 		 177 aa  126  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  36.69 
 
 		 177 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 		 180 aa  121  5e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 178 aa  121  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 		 176 aa  118  4.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3241  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 		 200 aa  117  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.021012  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  37.65 
 
 		 176 aa  117  7e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  39.76 
 
 		 176 aa  117  7.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 180 aa  115  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  37.65 
 
 		 176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  39.38 
 
 		 184 aa  112  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1572  NUDIX hydrolase  42.01 
 
 		 179 aa  111  5e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  37.58 
 
 		 184 aa  111  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  38.15 
 
 		 177 aa  111  6e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  37.87 
 
 		 186 aa  111  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  34.73 
 
 		 183 aa  110  7.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  35.5 
 
 		 199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  34.86 
 
 		 180 aa  105  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  34.86 
 
 		 180 aa  105  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  36.53 
 
 		 211 aa  105  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1439  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 		 204 aa  105  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  36.14 
 
 		 179 aa  105  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  33.71 
 
 		 180 aa  104  5e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 180 aa  104  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  32.93 
 
 		 190 aa  104  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 		 195 aa  104  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  35.54 
 
 		 179 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  35.33 
 
 		 179 aa  101  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  35.33 
 
 		 179 aa  101  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  35.33 
 
 		 179 aa  101  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  35.33 
 
 		 179 aa  101  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  35.33 
 
 		 179 aa  101  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  35.33 
 
 		 179 aa  101  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 		 196 aa  101  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 		 196 aa  101  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  34.94 
 
 		 179 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  34.32 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 		 169 aa  99.4  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  34.73 
 
 		 179 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 		 204 aa  99.8  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0237  NUDIX hydrolase  33.11 
 
 		 183 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373824  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  34.32 
 
 		 196 aa  99.4  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  34.1 
 
 		 192 aa  98.6  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  35.12 
 
 		 209 aa  98.2  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 		 281 aa  97.8  7e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1076  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  34.91 
 
 		 196 aa  97.8  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 		 176 aa  97.4  9e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  35.33 
 
 		 189 aa  97.1  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  30.36 
 
 		 182 aa  97.1  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  33.73 
 
 		 187 aa  97.1  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 		 196 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 		 196 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 		 196 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2896  NUDIX hydrolase  33.54 
 
 		 166 aa  95.9  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  30.72 
 
 		 183 aa  95.5  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2078  NUDIX family hydrolase  34.88 
 
 		 194 aa  95.9  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 194 aa  95.1  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 		 209 aa  95.5  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0995  NUDIX hydrolase  41.21 
 
 		 170 aa  95.5  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.575894  normal  0.946338 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 		 209 aa  95.5  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 		 196 aa  94.7  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  30.72 
 
 		 183 aa  94.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1814  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  33.73 
 
 		 196 aa  94.7  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1305  NUDIX family hydrolase  33.73 
 
 		 196 aa  94.7  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9435  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1314  NUDIX family hydrolase  33.73 
 
 		 196 aa  94.7  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.861294  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0428  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  33.73 
 
 		 196 aa  94.7  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0722  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  33.73 
 
 		 196 aa  94.7  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1145  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  33.73 
 
 		 196 aa  94.7  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107087  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  33.77 
 
 		 172 aa  94  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  33.95 
 
 		 184 aa  93.6  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  33.78 
 
 		 187 aa  93.6  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 		 211 aa  93.6  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1451  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  33.14 
 
 		 196 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  33.78 
 
 		 187 aa  93.2  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2271  ADP-ribose pyrophosphatase  37.7 
 
 		 183 aa  92.8  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2834  NUDIX hydrolase  33.53 
 
 		 169 aa  93.2  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 		 201 aa  92.8  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  29.24 
 
 		 175 aa  93.2  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  36.53 
 
 		 210 aa  92.8  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 		 210 aa  92.8  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  33.78 
 
 		 187 aa  92.8  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0600  NUDIX hydrolase  30.29 
 
 		 183 aa  92.4  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  32.14 
 
 		 207 aa  92  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0176  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 		 173 aa  91.7  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0982781  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1808  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 		 193 aa  91.3  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.801107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25181  NUDIX hydrolase  36.81 
 
 		 189 aa  91.3  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>