253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4797 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4797  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 196 aa  396  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.868054  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3065  hypothetical protein  46.67 
 
 		 181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194764 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6067  NUDIX hydrolase  49.7 
 
 		 193 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0114891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4146  NUDIX hydrolase  51.81 
 
 		 180 aa  170  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2006  NUDIX hydrolase  48.94 
 
 		 186 aa  167  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00276085  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000782  ADP-ribose pyrophosphatase  44.24 
 
 		 179 aa  165  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1523  NUDIX hydrolase  43.9 
 
 		 180 aa  162  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4737  NUDIX hydrolase  50.61 
 
 		 174 aa  159  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1489  NUDIX hydrolase  50.63 
 
 		 173 aa  154  6e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02241  hypothetical protein  43.03 
 
 		 179 aa  153  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0727099  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6125  NUDIX hydrolase  49.4 
 
 		 178 aa  153  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2018  NUDIX hydrolase  43.41 
 
 		 192 aa  151  5e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29440  NUDIX family protein  49.7 
 
 		 179 aa  149  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4016  NUDIX hydrolase  48.8 
 
 		 183 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.298866 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2174  NUDIX hydrolase  46.06 
 
 		 190 aa  144  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0334323  normal  0.0698698 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4021  NUDIX hydrolase  44.89 
 
 		 181 aa  141  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4096  NUDIX hydrolase  44.89 
 
 		 181 aa  141  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.196207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4251  NUDIX hydrolase  44.89 
 
 		 181 aa  141  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.0489284 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4523  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 178 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3458  NUDIX hydrolase  40.23 
 
 		 215 aa  121  8e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.185858  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2826  pyrophosphohydrolase related protein  37.04 
 
 		 192 aa  97.8  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0271  NUDIX hydrolase  34.32 
 
 		 180 aa  92  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.443042  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2029  NUDIX hydrolase  34.76 
 
 		 184 aa  88.2  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2209  NUDIX hydrolase  37.98 
 
 		 184 aa  85.1  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.022301  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2474  MutT/nudix family protein  30.77 
 
 		 182 aa  84.7  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.131904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0157  NUDIX hydrolase  36.81 
 
 		 180 aa  84  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0179624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1662  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  29.31 
 
 		 180 aa  82.4  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  29.27 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  36.46 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  31.55 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  29.44 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1066  NUDIX hydrolase  37.28 
 
 		 201 aa  77.8  0.00000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.133388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2192  NUDIX hydrolase  38.69 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.349846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0219  NUDIX hydrolase  31.55 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0471  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25181  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6699  NUDIX hydrolase  31.61 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.121967 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  30.26 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2928  NUDIX hydrolase  29.76 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  34.93 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03661  NUDIX hydrolase  25.58 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03121  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 		 201 aa  71.2  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  30.91 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1652  NUDIX hydrolase  25.58 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.568517  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  29.56 
 
 		 164 aa  70.9  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0237  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373824  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15030  NTP pyrophosphohydrolase  35 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  36.3 
 
 		 171 aa  68.9  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  32.05 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  30.46 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  29.34 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0333  MutT/nudix family protein  34.57 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0452702  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 		 184 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 		 175 aa  67.4  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1572  NUDIX hydrolase  29.27 
 
 		 179 aa  67.8  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 180 aa  67.4  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  31.29 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  27.04 
 
 		 176 aa  67  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0978  NUDIX hydrolase  34.11 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0180  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195159 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1876  NUDIX hydrolase  30.99 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.48572 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2271  ADP-ribose pyrophosphatase  34.51 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0238  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  34.67 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1755  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0106102  hitchhiker  0.000762275 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  31.51 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  34.93 
 
 		 213 aa  64.7  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2834  NUDIX hydrolase  29.58 
 
 		 169 aa  63.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  30.82 
 
 		 183 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  34.67 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  29.14 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  34.67 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  30.5 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  27.04 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  26.22 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  29.21 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03191  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.798424  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0055  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3598  NUDIX hydrolase  43.18 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1418  ADP-ribose pyrophosphatase  31.85 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.656759  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1451  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 		 184 aa  62  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  30.64 
 
 		 210 aa  62  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  29.46 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3049  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>