More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0238 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0238  NUDIX hydrolase  100 
 
 
186 aa  375  1e-103  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0212  NUDIX hydrolase  88.17 
 
 
186 aa  338  2e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.465676  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25181  NUDIX hydrolase  72.09 
 
 
189 aa  261  4e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03661  NUDIX hydrolase  61.75 
 
 
186 aa  251  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1652  NUDIX hydrolase  61.75 
 
 
186 aa  250  8.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.568517  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03121  NUDIX hydrolase  66.86 
 
 
189 aa  246  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  56.73 
 
 
187 aa  215  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  57.31 
 
 
187 aa  215  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03191  NUDIX hydrolase  56.65 
 
 
186 aa  214  5e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.798424  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  56.73 
 
 
187 aa  213  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  54.6 
 
 
182 aa  187  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0237  NUDIX hydrolase  51.11 
 
 
183 aa  184  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373824  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  50.61 
 
 
195 aa  180  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  49.69 
 
 
184 aa  179  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  49.15 
 
 
184 aa  179  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  51.22 
 
 
183 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  51.22 
 
 
183 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2271  ADP-ribose pyrophosphatase  50.29 
 
 
183 aa  172  2.9999999999999996e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  41.07 
 
 
189 aa  124  8.000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  38.73 
 
 
177 aa  122  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  40.37 
 
 
194 aa  120  9e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  38.85 
 
 
176 aa  120  9e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  38.12 
 
 
171 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  40.4 
 
 
185 aa  118  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 
204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  37.58 
 
 
186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 
178 aa  115  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  36.88 
 
 
214 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  43.83 
 
 
179 aa  114  5e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  38.75 
 
 
180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
199 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  43.23 
 
 
190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1439  NUDIX hydrolase  37.86 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  44.37 
 
 
173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  41.89 
 
 
173 aa  108  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3241  NUDIX hydrolase  40.34 
 
 
200 aa  108  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.021012  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 
180 aa  107  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  42.67 
 
 
171 aa  106  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  41.22 
 
 
173 aa  106  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  37.58 
 
 
186 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 
180 aa  105  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  37.42 
 
 
180 aa  104  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  34.81 
 
 
210 aa  104  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 
204 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  39.39 
 
 
185 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  36.99 
 
 
179 aa  102  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 
179 aa  102  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  38.41 
 
 
184 aa  101  7e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  37.04 
 
 
179 aa  100  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  37.04 
 
 
179 aa  100  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  37.04 
 
 
179 aa  100  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  37.04 
 
 
179 aa  100  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  37.04 
 
 
179 aa  100  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  37.04 
 
 
179 aa  100  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  37.04 
 
 
179 aa  100  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 
172 aa  100  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  39.86 
 
 
196 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  39.51 
 
 
177 aa  100  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  39.86 
 
 
196 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  34.48 
 
 
176 aa  99  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0176  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
173 aa  99.4  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0982781  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1507  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 
201 aa  99  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.694951  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 
182 aa  99.4  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  39.86 
 
 
196 aa  99.4  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0268  NUDIX hydrolase  40.79 
 
 
165 aa  98.6  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.880251  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  39.16 
 
 
196 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1076  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.71 
 
 
196 aa  99  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  42.36 
 
 
211 aa  99  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  36.3 
 
 
179 aa  98.6  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0428  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.14 
 
 
196 aa  98.6  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1314  NUDIX family hydrolase  37.14 
 
 
196 aa  98.6  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.861294  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1814  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.14 
 
 
196 aa  98.6  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1418  ADP-ribose pyrophosphatase  40.4 
 
 
207 aa  98.6  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.656759  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0722  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.14 
 
 
196 aa  98.6  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1305  NUDIX family hydrolase  37.14 
 
 
196 aa  98.6  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9435  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  38.27 
 
 
196 aa  98.6  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  41.48 
 
 
164 aa  98.6  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 
177 aa  98.6  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1145  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.14 
 
 
196 aa  98.6  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107087  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  39.16 
 
 
196 aa  98.2  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  39.16 
 
 
196 aa  98.2  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  40.27 
 
 
281 aa  98.2  6e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  36.3 
 
 
179 aa  97.8  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 
196 aa  97.8  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  34.39 
 
 
184 aa  97.4  9e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1451  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.57 
 
 
196 aa  97.1  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  38.99 
 
 
180 aa  97.1  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1876  NUDIX hydrolase  36.02 
 
 
203 aa  97.1  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.48572 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  36.3 
 
 
179 aa  97.4  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3354  mutT/nudix family protein  42.96 
 
 
173 aa  96.3  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 
194 aa  96.3  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  35.98 
 
 
199 aa  96.3  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 
199 aa  96.3  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  37.27 
 
 
205 aa  95.9  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  40 
 
 
184 aa  95.9  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  31.29 
 
 
183 aa  95.9  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  39.19 
 
 
201 aa  95.9  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  36.05 
 
 
187 aa  95.9  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  38.81 
 
 
199 aa  95.5  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 
179 aa  95.5  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>