More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02241 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02241  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  364  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0727099  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1523  NUDIX hydrolase  66.11 
 
 		 180 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3065  hypothetical protein  56.98 
 
 		 181 aa  220  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194764 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000782  ADP-ribose pyrophosphatase  57.54 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4737  NUDIX hydrolase  52.02 
 
 		 174 aa  188  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6067  NUDIX hydrolase  50.85 
 
 		 193 aa  186  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0114891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4146  NUDIX hydrolase  51.67 
 
 		 180 aa  179  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2018  NUDIX hydrolase  46.78 
 
 		 192 aa  158  5e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2006  NUDIX hydrolase  44.38 
 
 		 186 aa  154  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00276085  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1489  NUDIX hydrolase  41.72 
 
 		 173 aa  144  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4797  NUDIX hydrolase  43.03 
 
 		 196 aa  138  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.868054  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4021  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 		 181 aa  138  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4251  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 		 181 aa  138  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.0489284 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4096  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 		 181 aa  138  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.196207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4523  NUDIX hydrolase  40.36 
 
 		 178 aa  137  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6125  NUDIX hydrolase  41.62 
 
 		 178 aa  136  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2174  NUDIX hydrolase  38.73 
 
 		 190 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0334323  normal  0.0698698 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29440  NUDIX family protein  39.53 
 
 		 179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4016  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 		 183 aa  130  9e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.298866 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15030  NTP pyrophosphohydrolase  40.12 
 
 		 181 aa  111  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3458  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 		 215 aa  108  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.185858  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2029  NUDIX hydrolase  40.83 
 
 		 184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  39.11 
 
 		 179 aa  108  6e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0471  NUDIX hydrolase  37.78 
 
 		 184 aa  105  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0157  NUDIX hydrolase  35.15 
 
 		 180 aa  102  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0179624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 		 180 aa  101  5e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0219  NUDIX hydrolase  37.13 
 
 		 184 aa  99.8  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 190 aa  97.8  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1662  NUDIX hydrolase  35.03 
 
 		 201 aa  96.3  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  35.33 
 
 		 178 aa  95.9  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0271  NUDIX hydrolase  35.98 
 
 		 180 aa  95.1  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.443042  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  35.26 
 
 		 214 aa  94  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  32.56 
 
 		 171 aa  93.2  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0180  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 183 aa  92.8  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195159 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  35.39 
 
 		 184 aa  93.2  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  33.74 
 
 		 177 aa  92  4e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 		 178 aa  91.3  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 		 183 aa  90.5  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  34.66 
 
 		 177 aa  90.1  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2826  pyrophosphohydrolase related protein  32.72 
 
 		 192 aa  88.2  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  31.33 
 
 		 176 aa  88.6  5e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  34.36 
 
 		 184 aa  88.2  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  32.75 
 
 		 185 aa  87.8  8e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  32.53 
 
 		 194 aa  86.3  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 		 184 aa  85.9  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  32.94 
 
 		 180 aa  85.9  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  36.53 
 
 		 180 aa  85.9  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3586  NUDIX hydrolase  33.53 
 
 		 186 aa  85.9  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1572  NUDIX hydrolase  35.23 
 
 		 179 aa  85.5  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 		 182 aa  85.1  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2192  NUDIX hydrolase  36.52 
 
 		 179 aa  83.6  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.349846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03121  NUDIX hydrolase  34.93 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  34.5 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6699  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.121967 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  32.95 
 
 		 183 aa  80.9  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  31.55 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1444  NUDIX hydrolase  29.94 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.9766  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  29.14 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  29.89 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  29.81 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2474  MutT/nudix family protein  33.54 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.131904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  28.98 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  29.81 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  29.81 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1066  NUDIX hydrolase  34.36 
 
 		 201 aa  77.8  0.00000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.133388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 		 196 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 		 196 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0978  NUDIX hydrolase  30.18 
 
 		 189 aa  77.4  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0176  NUDIX hydrolase  29.76 
 
 		 173 aa  77.8  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0982781  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  30.41 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  29.81 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2834  NUDIX hydrolase  31.61 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  34 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1424  NUDIX hydrolase  33.52 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.884669  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  31.14 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  31.14 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2928  NUDIX hydrolase  30.12 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  30.06 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3049  NUDIX hydrolase  31.64 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0333  MutT/nudix family protein  31.29 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0452702  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2209  NUDIX hydrolase  28.93 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.022301  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1076  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.43 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  30.12 
 
 		 180 aa  74.7  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  29.89 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  29.81 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  29.81 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  30.67 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  29.94 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  29.19 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1418  ADP-ribose pyrophosphatase  32.5 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.656759  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  27.53 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1814  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  29.81 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0722  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  29.81 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0428  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  29.81 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  29.19 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1314  NUDIX family hydrolase  29.81 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.861294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>