More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2151 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 196 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  98.98 
 
 		 196 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  96.94 
 
 		 196 aa  393  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  95.92 
 
 		 196 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  95.41 
 
 		 196 aa  387  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  95.92 
 
 		 196 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  92.35 
 
 		 196 aa  374  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1076  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  87.76 
 
 		 196 aa  362  1e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1814  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  85.71 
 
 		 196 aa  357  6e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1314  NUDIX family hydrolase  85.71 
 
 		 196 aa  357  6e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.861294  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1305  NUDIX family hydrolase  85.71 
 
 		 196 aa  357  6e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9435  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0722  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  85.71 
 
 		 196 aa  357  6e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0428  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  85.71 
 
 		 196 aa  357  6e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1145  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  85.71 
 
 		 196 aa  357  6e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107087  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1451  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  85.2 
 
 		 196 aa  356  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  82.72 
 
 		 194 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  81.68 
 
 		 194 aa  333  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  76.19 
 
 		 196 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  69.89 
 
 		 205 aa  270  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  66.3 
 
 		 204 aa  260  8.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1876  NUDIX hydrolase  66.13 
 
 		 203 aa  259  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.48572 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2199  NUDIX hydrolase  66.67 
 
 		 203 aa  258  4e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  66.67 
 
 		 211 aa  257  8e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1439  NUDIX hydrolase  61.38 
 
 		 204 aa  246  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3241  NUDIX hydrolase  59.46 
 
 		 200 aa  235  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.021012  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  57.53 
 
 		 204 aa  226  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1515  NUDIX hydrolase  51.85 
 
 		 208 aa  221  7e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1507  NUDIX hydrolase  52.31 
 
 		 201 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.694951  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  55.98 
 
 		 199 aa  210  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1418  ADP-ribose pyrophosphatase  53.23 
 
 		 207 aa  207  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.656759  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  52.88 
 
 		 199 aa  204  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  50.27 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  48.91 
 
 		 199 aa  191  5e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  48.35 
 
 		 194 aa  181  7e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  46.63 
 
 		 180 aa  177  9e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  47.27 
 
 		 189 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  47.31 
 
 		 177 aa  160  8.000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  47.34 
 
 		 180 aa  152  2.9999999999999998e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  44.51 
 
 		 183 aa  148  5e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 178 aa  146  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  41.95 
 
 		 180 aa  144  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  46.3 
 
 		 184 aa  143  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  40.7 
 
 		 178 aa  138  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  42.53 
 
 		 190 aa  137  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 177 aa  135  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  43.03 
 
 		 176 aa  135  5e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 179 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  40.45 
 
 		 180 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  40.94 
 
 		 179 aa  131  7.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  37.57 
 
 		 176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  40 
 
 		 176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 281 aa  129  3e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 		 182 aa  128  5.0000000000000004e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  40.23 
 
 		 180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  37.57 
 
 		 176 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  39.64 
 
 		 177 aa  124  6e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  37.36 
 
 		 179 aa  123  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  38.37 
 
 		 186 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 184 aa  123  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  39.08 
 
 		 178 aa  122  4e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  38.95 
 
 		 186 aa  121  8e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  36.78 
 
 		 179 aa  120  9e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  36.78 
 
 		 179 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  36.78 
 
 		 179 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  36.78 
 
 		 179 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  36.78 
 
 		 179 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  36.78 
 
 		 179 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  36.78 
 
 		 179 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 		 179 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  36.21 
 
 		 179 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  36.78 
 
 		 179 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1572  NUDIX hydrolase  41.21 
 
 		 179 aa  117  9e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  35.88 
 
 		 180 aa  115  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  37.65 
 
 		 171 aa  115  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  35.88 
 
 		 180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 		 184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  35.88 
 
 		 180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0227  NUDIX hydrolase  40.61 
 
 		 185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.282406  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  32.95 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  34.81 
 
 		 171 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  34.81 
 
 		 187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 		 179 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  34.81 
 
 		 185 aa  108  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 172 aa  106  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  33.53 
 
 		 214 aa  105  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  33.53 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1716  NUDIX hydrolase  34.76 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0743315 
 
 
-
 
NC_002936  DET0456  MutT/nudix family protein  35.5 
 
 		 176 aa  102  4e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0404799  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  33.89 
 
 		 215 aa  101  8e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 		 208 aa  101  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_398  MutT/nudix, ADP-ribose pyrophosphatase  34.91 
 
 		 176 aa  101  9e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.148699  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0433  NUDIX hydrolase  35.5 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00447599  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  34.32 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 		 169 aa  99.4  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0238  NUDIX hydrolase  39.86 
 
 		 186 aa  99.4  3e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03121  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 		 189 aa  99.4  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2078  NUDIX family hydrolase  34.66 
 
 		 194 aa  99  4e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  36.02 
 
 		 199 aa  98.2  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  31.87 
 
 		 192 aa  97.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>