More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2047 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  419  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2199  NUDIX hydrolase  85.49 
 
 		 203 aa  352  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1876  NUDIX hydrolase  84.62 
 
 		 203 aa  350  7e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.48572 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  75.51 
 
 		 211 aa  313  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  77.3 
 
 		 204 aa  312  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  69.4 
 
 		 194 aa  276  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  68.85 
 
 		 194 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  70.97 
 
 		 196 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  70.97 
 
 		 196 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  70.97 
 
 		 196 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  70.43 
 
 		 196 aa  272  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1814  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  70.27 
 
 		 196 aa  271  7e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1305  NUDIX family hydrolase  70.27 
 
 		 196 aa  271  7e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9435  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0428  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  70.27 
 
 		 196 aa  271  7e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1314  NUDIX family hydrolase  70.27 
 
 		 196 aa  271  7e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.861294  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1145  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  70.27 
 
 		 196 aa  271  7e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107087  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0722  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  70.27 
 
 		 196 aa  271  7e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1451  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  68.98 
 
 		 196 aa  270  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  69.89 
 
 		 196 aa  270  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  69.89 
 
 		 196 aa  270  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  69.57 
 
 		 196 aa  266  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1076  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  69.02 
 
 		 196 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  66.12 
 
 		 196 aa  263  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1439  NUDIX hydrolase  54.3 
 
 		 204 aa  220  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3241  NUDIX hydrolase  54.35 
 
 		 200 aa  216  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.021012  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  55.98 
 
 		 199 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  51.65 
 
 		 204 aa  209  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1515  NUDIX hydrolase  52.49 
 
 		 208 aa  209  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1507  NUDIX hydrolase  50.51 
 
 		 201 aa  204  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.694951  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  52.46 
 
 		 199 aa  202  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  51.69 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  48.88 
 
 		 199 aa  191  9e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1418  ADP-ribose pyrophosphatase  46.39 
 
 		 207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.656759  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  47.83 
 
 		 194 aa  175  5e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  43.18 
 
 		 180 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  44.97 
 
 		 189 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  43.11 
 
 		 177 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 		 180 aa  148  7e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 		 177 aa  141  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  46.3 
 
 		 184 aa  141  7e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  43.11 
 
 		 183 aa  139  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 178 aa  139  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  41.42 
 
 		 180 aa  139  3e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  40.72 
 
 		 178 aa  139  3.9999999999999997e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  42.61 
 
 		 281 aa  135  3.0000000000000003e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 		 178 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  36.57 
 
 		 182 aa  134  8e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  38.82 
 
 		 176 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  38.37 
 
 		 177 aa  131  6e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  37.58 
 
 		 179 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 176 aa  128  5.0000000000000004e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  37.36 
 
 		 180 aa  128  5.0000000000000004e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  39.88 
 
 		 190 aa  125  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 		 179 aa  121  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  35.26 
 
 		 176 aa  119  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  35.84 
 
 		 176 aa  119  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 		 179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  35.44 
 
 		 184 aa  115  6e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  34.71 
 
 		 180 aa  114  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 		 176 aa  112  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 		 179 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1572  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 179 aa  112  5e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  34.27 
 
 		 192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  32.97 
 
 		 187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0227  NUDIX hydrolase  44.52 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.282406  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  33.71 
 
 		 179 aa  108  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  32.94 
 
 		 180 aa  108  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  32.94 
 
 		 180 aa  108  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 		 186 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  34.36 
 
 		 185 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  33.71 
 
 		 179 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  33.71 
 
 		 179 aa  106  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  33.71 
 
 		 179 aa  106  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 172 aa  107  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  33.71 
 
 		 179 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  33.71 
 
 		 179 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  34.1 
 
 		 186 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  34.15 
 
 		 214 aa  106  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  33.71 
 
 		 179 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  33.14 
 
 		 179 aa  104  9e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  33.14 
 
 		 179 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  35.93 
 
 		 179 aa  103  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 		 184 aa  102  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  40.38 
 
 		 173 aa  102  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  30.06 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 		 187 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  32.95 
 
 		 183 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  32.95 
 
 		 183 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  32.91 
 
 		 171 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 		 187 aa  99  4e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  34.78 
 
 		 210 aa  98.6  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 		 175 aa  98.6  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 		 169 aa  98.6  6e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 195 aa  98.6  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1716  NUDIX hydrolase  35.22 
 
 		 171 aa  98.6  6e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0743315 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0237  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 		 183 aa  97.8  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373824  normal  0.440739 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>