More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_0428 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_1305  NUDIX family hydrolase  100 
 
 
196 aa  401  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9435  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1814  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  100 
 
 
196 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1451  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  99.49 
 
 
196 aa  400  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0428  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  100 
 
 
196 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1314  NUDIX family hydrolase  100 
 
 
196 aa  401  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.861294  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1145  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  100 
 
 
196 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107087  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0722  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  100 
 
 
196 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1076  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  96.43 
 
 
196 aa  390  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  90.31 
 
 
196 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  87.76 
 
 
196 aa  363  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  87.76 
 
 
196 aa  363  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  87.24 
 
 
196 aa  362  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  87.24 
 
 
196 aa  361  4e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  85.71 
 
 
196 aa  357  6e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  85.71 
 
 
196 aa  356  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  81.25 
 
 
194 aa  338  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  80.73 
 
 
194 aa  337  5.9999999999999996e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  80.95 
 
 
196 aa  323  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  70.27 
 
 
205 aa  271  6e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  67.39 
 
 
204 aa  266  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1876  NUDIX hydrolase  67.74 
 
 
203 aa  266  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.48572 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  65.97 
 
 
211 aa  263  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2199  NUDIX hydrolase  68.28 
 
 
203 aa  263  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1439  NUDIX hydrolase  62.7 
 
 
204 aa  246  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3241  NUDIX hydrolase  57.84 
 
 
200 aa  232  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.021012  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1515  NUDIX hydrolase  53.97 
 
 
208 aa  224  6e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  56.77 
 
 
204 aa  223  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  57.53 
 
 
199 aa  219  3e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  57.07 
 
 
199 aa  214  7e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1507  NUDIX hydrolase  53.48 
 
 
201 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.694951  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1418  ADP-ribose pyrophosphatase  54.3 
 
 
207 aa  206  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.656759  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  50.81 
 
 
185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  49.46 
 
 
199 aa  191  7e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  47.8 
 
 
194 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  47.19 
 
 
180 aa  174  7e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  48.48 
 
 
189 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 
177 aa  159  3e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 
183 aa  150  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  46.91 
 
 
184 aa  149  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  44.97 
 
 
180 aa  147  1.0000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  46.43 
 
 
178 aa  145  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  42.35 
 
 
180 aa  141  5e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  40.12 
 
 
178 aa  138  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 
179 aa  137  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  41.52 
 
 
177 aa  135  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  38.29 
 
 
179 aa  134  9e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  40.23 
 
 
176 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 
281 aa  132  3e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  37.71 
 
 
179 aa  132  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 
179 aa  131  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  41.95 
 
 
190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  39.08 
 
 
182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  37.71 
 
 
179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  37.71 
 
 
179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  37.71 
 
 
179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  37.71 
 
 
179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  37.71 
 
 
179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  37.71 
 
 
179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  37.71 
 
 
179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  37.14 
 
 
179 aa  128  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  40.83 
 
 
177 aa  127  9.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  40.61 
 
 
176 aa  127  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  39.08 
 
 
180 aa  124  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  37.08 
 
 
180 aa  124  7e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  39.31 
 
 
178 aa  123  2e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  36.84 
 
 
176 aa  123  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  36.99 
 
 
186 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  37.87 
 
 
184 aa  122  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  37.13 
 
 
179 aa  122  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  38.15 
 
 
186 aa  121  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  37.65 
 
 
180 aa  120  9e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1572  NUDIX hydrolase  43.83 
 
 
179 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  35.67 
 
 
176 aa  117  9e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  32.95 
 
 
183 aa  114  7.999999999999999e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  36.47 
 
 
180 aa  112  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  36.47 
 
 
180 aa  112  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0227  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 
185 aa  111  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.282406  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  36.71 
 
 
184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 
172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  34.55 
 
 
171 aa  107  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1242  NUDIX hydrolase  36.16 
 
 
182 aa  106  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  33.7 
 
 
187 aa  106  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 
175 aa  105  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
176 aa  105  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  32.91 
 
 
171 aa  104  9e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 
215 aa  104  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 
179 aa  103  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1716  NUDIX hydrolase  35.62 
 
 
171 aa  103  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0743315 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  35.98 
 
 
173 aa  102  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  33.53 
 
 
175 aa  102  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2078  NUDIX family hydrolase  35.39 
 
 
194 aa  102  5e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  32.28 
 
 
214 aa  100  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  31.65 
 
 
185 aa  100  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  35.37 
 
 
173 aa  99.8  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0600  NUDIX hydrolase  35.67 
 
 
183 aa  100  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0238  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 
186 aa  98.6  5e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 
169 aa  97.8  8e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
208 aa  98.2  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  31.87 
 
 
192 aa  97.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  35.26 
 
 
201 aa  96.3  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>