More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0027 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 281 aa  574  1.0000000000000001e-163  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  47.7 
 
 		 180 aa  169  6e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  47.98 
 
 		 178 aa  162  6e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  45.51 
 
 		 190 aa  159  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  48.81 
 
 		 177 aa  157  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  45.35 
 
 		 177 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  43.1 
 
 		 182 aa  154  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  45.29 
 
 		 179 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  47.02 
 
 		 180 aa  152  7e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  43.11 
 
 		 177 aa  152  8e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  49.09 
 
 		 186 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  45.83 
 
 		 176 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 176 aa  150  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  42.46 
 
 		 199 aa  149  7e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  44.85 
 
 		 186 aa  148  8e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  45.78 
 
 		 184 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  42.94 
 
 		 180 aa  147  3e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  41.71 
 
 		 178 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  47.27 
 
 		 179 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  42.01 
 
 		 175 aa  141  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  41.38 
 
 		 176 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 199 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  45.24 
 
 		 179 aa  140  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  44.64 
 
 		 179 aa  139  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  40.8 
 
 		 176 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  44.64 
 
 		 179 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  42.35 
 
 		 183 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  42.77 
 
 		 185 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  41.24 
 
 		 196 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  45.88 
 
 		 179 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  42.54 
 
 		 199 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  42.61 
 
 		 205 aa  135  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  39.89 
 
 		 211 aa  136  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 184 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 		 196 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 204 aa  135  9e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  43.45 
 
 		 179 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  43.45 
 
 		 179 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  43.45 
 
 		 179 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  43.45 
 
 		 179 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  43.45 
 
 		 179 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  43.45 
 
 		 179 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  41.45 
 
 		 172 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2199  NUDIX hydrolase  40.34 
 
 		 203 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  42.86 
 
 		 179 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  40.12 
 
 		 175 aa  132  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1814  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40.98 
 
 		 196 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1314  NUDIX family hydrolase  40.98 
 
 		 196 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.861294  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0428  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40.98 
 
 		 196 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0722  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40.98 
 
 		 196 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1305  NUDIX family hydrolase  40.98 
 
 		 196 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9435  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1145  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40.98 
 
 		 196 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107087  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  42.17 
 
 		 180 aa  131  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 196 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  39.88 
 
 		 204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1451  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40.44 
 
 		 196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 180 aa  130  3e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  44.05 
 
 		 189 aa  130  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1076  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40.98 
 
 		 196 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  40.76 
 
 		 194 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  40.11 
 
 		 194 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  42.24 
 
 		 171 aa  129  6e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 196 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1515  NUDIX hydrolase  41.52 
 
 		 208 aa  129  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 196 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1876  NUDIX hydrolase  40.34 
 
 		 203 aa  128  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.48572 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  40.61 
 
 		 194 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1418  ADP-ribose pyrophosphatase  43.35 
 
 		 207 aa  127  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.656759  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  40.59 
 
 		 179 aa  126  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  40.11 
 
 		 180 aa  125  8.000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 		 178 aa  125  9e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  45.16 
 
 		 176 aa  124  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3241  NUDIX hydrolase  42.5 
 
 		 200 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.021012  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  39.43 
 
 		 215 aa  124  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  42.04 
 
 		 173 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1439  NUDIX hydrolase  39.56 
 
 		 204 aa  122  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  38.64 
 
 		 187 aa  122  7e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  44.25 
 
 		 209 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  42.33 
 
 		 184 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  44.25 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  44.25 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  40.12 
 
 		 180 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  45.28 
 
 		 201 aa  120  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  40.12 
 
 		 180 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  41.46 
 
 		 210 aa  119  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2896  NUDIX hydrolase  39.24 
 
 		 166 aa  119  6e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  42.26 
 
 		 192 aa  119  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  45.06 
 
 		 164 aa  118  9e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  44.1 
 
 		 201 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1572  NUDIX hydrolase  43.64 
 
 		 179 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  39.38 
 
 		 173 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  39.38 
 
 		 173 aa  117  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 169 aa  117  3e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  43.37 
 
 		 210 aa  115  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0176  NUDIX hydrolase  37.87 
 
 		 173 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0982781  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0227  NUDIX hydrolase  40.24 
 
 		 185 aa  112  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.282406  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  41.5 
 
 		 181 aa  112  8.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>