More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1779 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  100 
 
 
176 aa  355  1.9999999999999998e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  94.89 
 
 
176 aa  339  1e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  43.37 
 
 
184 aa  144  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 
180 aa  144  7.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  44.89 
 
 
180 aa  144  8.000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  43.27 
 
 
183 aa  142  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  44.19 
 
 
194 aa  141  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 
281 aa  140  6e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  41.42 
 
 
180 aa  140  7e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  40.24 
 
 
189 aa  140  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  40.7 
 
 
178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  42.29 
 
 
179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  38.37 
 
 
180 aa  137  7e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  41.14 
 
 
182 aa  136  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  39.66 
 
 
185 aa  136  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  40.24 
 
 
180 aa  137  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  40.24 
 
 
180 aa  137  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  44.19 
 
 
176 aa  135  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  43.1 
 
 
176 aa  136  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  44.19 
 
 
179 aa  135  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
180 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  41.04 
 
 
186 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  40 
 
 
178 aa  133  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  42.77 
 
 
171 aa  130  6.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  39.24 
 
 
176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  40.12 
 
 
179 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 
175 aa  128  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 
186 aa  127  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  37.57 
 
 
196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  37.57 
 
 
196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  37.93 
 
 
179 aa  125  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  37.93 
 
 
179 aa  125  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  37.93 
 
 
179 aa  125  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  37.93 
 
 
179 aa  125  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  37.93 
 
 
179 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  37.93 
 
 
179 aa  125  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  37.57 
 
 
196 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  37.57 
 
 
196 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  37.93 
 
 
179 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 
179 aa  124  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  43.11 
 
 
177 aa  124  5e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  37.57 
 
 
196 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  38.15 
 
 
194 aa  124  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  37.93 
 
 
179 aa  124  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  37.64 
 
 
187 aa  124  7e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  37.36 
 
 
179 aa  123  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  36.99 
 
 
196 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  41.14 
 
 
214 aa  122  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  37.57 
 
 
196 aa  123  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1572  NUDIX hydrolase  42.29 
 
 
179 aa  122  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  37.36 
 
 
199 aa  122  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  41.76 
 
 
180 aa  122  3e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  36.99 
 
 
211 aa  122  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  36.99 
 
 
194 aa  121  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  35.84 
 
 
183 aa  121  6e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 
199 aa  120  8e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1876  NUDIX hydrolase  36.78 
 
 
203 aa  120  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.48572 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 
177 aa  120  9e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  37.06 
 
 
177 aa  120  9e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  34.1 
 
 
204 aa  120  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  35.84 
 
 
205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  37.06 
 
 
190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2199  NUDIX hydrolase  36.99 
 
 
203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1076  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.26 
 
 
196 aa  118  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1418  ADP-ribose pyrophosphatase  32.76 
 
 
207 aa  118  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.656759  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 
184 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1814  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.67 
 
 
196 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0428  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.67 
 
 
196 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1451  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.67 
 
 
196 aa  117  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1305  NUDIX family hydrolase  35.67 
 
 
196 aa  117  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9435  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1314  NUDIX family hydrolase  35.67 
 
 
196 aa  117  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.861294  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0722  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.67 
 
 
196 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1145  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.67 
 
 
196 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107087  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  35.84 
 
 
204 aa  117  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0456  MutT/nudix family protein  38.82 
 
 
176 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0404799  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  35.06 
 
 
199 aa  115  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0433  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 
176 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00447599  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_398  MutT/nudix, ADP-ribose pyrophosphatase  37.65 
 
 
176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.148699  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  35.5 
 
 
215 aa  113  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  36.47 
 
 
175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 
184 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1515  NUDIX hydrolase  30.46 
 
 
208 aa  112  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  35.71 
 
 
185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  34.76 
 
 
179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1439  NUDIX hydrolase  33.53 
 
 
204 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 
192 aa  111  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0600  NUDIX hydrolase  33.52 
 
 
183 aa  110  7.000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  41.83 
 
 
178 aa  110  8.000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  35.84 
 
 
196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3241  NUDIX hydrolase  33.53 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.021012  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1507  NUDIX hydrolase  33.52 
 
 
201 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.694951  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1242  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 
182 aa  107  8.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  34.18 
 
 
172 aa  106  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2078  NUDIX family hydrolase  37.57 
 
 
194 aa  107  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  33.53 
 
 
173 aa  106  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 
209 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 
209 aa  104  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 
209 aa  104  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2672  NUDIX hydrolase  29.48 
 
 
184 aa  104  7e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.687973  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  32.74 
 
 
207 aa  103  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.191182 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>