More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2078 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_2078  NUDIX family hydrolase  100 
 
 
194 aa  398  9.999999999999999e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  48.57 
 
 
186 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  49.14 
 
 
179 aa  158  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  49.14 
 
 
179 aa  158  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  49.14 
 
 
179 aa  158  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  49.14 
 
 
179 aa  158  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  49.14 
 
 
179 aa  158  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  49.14 
 
 
179 aa  158  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  49.14 
 
 
179 aa  157  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  48.57 
 
 
179 aa  156  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  46.86 
 
 
186 aa  154  6e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  48 
 
 
179 aa  153  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  48 
 
 
179 aa  153  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  47.43 
 
 
179 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1537  MutT/nudix family protein  50 
 
 
184 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.652785  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  46.55 
 
 
175 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  47.98 
 
 
179 aa  142  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0604  MutT/nudix family protein  50.84 
 
 
182 aa  142  3e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  44.13 
 
 
180 aa  142  4e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  44.94 
 
 
180 aa  140  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  44.94 
 
 
180 aa  140  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  44.51 
 
 
184 aa  131  6e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  41.48 
 
 
183 aa  131  6e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  38.86 
 
 
187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  42.2 
 
 
176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  41.76 
 
 
180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  41.14 
 
 
190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  40.23 
 
 
179 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  39.43 
 
 
182 aa  126  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  43.27 
 
 
178 aa  125  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0600  NUDIX hydrolase  41.14 
 
 
183 aa  124  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2896  NUDIX hydrolase  43.56 
 
 
166 aa  122  4e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  38.07 
 
 
180 aa  122  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  43.35 
 
 
176 aa  122  4e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  40.83 
 
 
177 aa  122  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  37.22 
 
 
178 aa  121  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  41.52 
 
 
177 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 
180 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  39.51 
 
 
169 aa  117  9.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  36.87 
 
 
185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  39.88 
 
 
177 aa  115  5e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 
176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  34.03 
 
 
189 aa  112  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  37.95 
 
 
184 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  37.65 
 
 
171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  37.36 
 
 
175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 
184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 
183 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  40 
 
 
180 aa  109  3e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 
194 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  38.15 
 
 
176 aa  108  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 
199 aa  107  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  37.57 
 
 
176 aa  107  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 
172 aa  106  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2271  ADP-ribose pyrophosphatase  35.98 
 
 
183 aa  105  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
196 aa  105  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1572  NUDIX hydrolase  39.18 
 
 
179 aa  105  6e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  39.33 
 
 
281 aa  105  6e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1451  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.96 
 
 
196 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
209 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1418  ADP-ribose pyrophosphatase  33.51 
 
 
207 aa  104  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.656759  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  36.52 
 
 
196 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0433  NUDIX hydrolase  35.47 
 
 
176 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00447599  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1076  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.39 
 
 
196 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0456  MutT/nudix family protein  37.21 
 
 
176 aa  102  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0404799  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0830  NUDIX hydrolase  38.36 
 
 
177 aa  102  3e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.66661  normal  0.255619 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  36.31 
 
 
192 aa  102  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1305  NUDIX family hydrolase  35.39 
 
 
196 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9435  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1314  NUDIX family hydrolase  35.39 
 
 
196 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.861294  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1814  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.39 
 
 
196 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0428  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.39 
 
 
196 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0722  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.39 
 
 
196 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1145  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.39 
 
 
196 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107087  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3241  NUDIX hydrolase  37.43 
 
 
200 aa  101  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.021012  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  34.94 
 
 
201 aa  101  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2834  NUDIX hydrolase  35.37 
 
 
169 aa  101  8e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  35.12 
 
 
209 aa  101  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  35.12 
 
 
209 aa  101  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  32.57 
 
 
215 aa  100  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 
195 aa  100  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 
199 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 
196 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 
196 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  36.46 
 
 
199 aa  99.8  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 
196 aa  99.4  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1429  NUDIX hydrolase  40 
 
 
176 aa  99.4  3e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.742876  normal  0.0486947 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  34.66 
 
 
196 aa  99  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  34.66 
 
 
196 aa  99  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 
196 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1886  NUDIX hydrolase  38.12 
 
 
172 aa  98.6  5e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.556059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 
201 aa  98.6  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  34.27 
 
 
194 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  36.65 
 
 
182 aa  97.4  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1507  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 
201 aa  97.1  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.694951  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  34.27 
 
 
194 aa  97.1  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2211  NUDIX hydrolase  34.16 
 
 
164 aa  97.8  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  32.93 
 
 
179 aa  97.4  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0268  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
165 aa  97.4  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.880251  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 
183 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03191  NUDIX hydrolase  32.45 
 
 
186 aa  96.7  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.798424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>