More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1325 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  100 
 
 
177 aa  345  2e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  65.32 
 
 
180 aa  224  5.0000000000000005e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  55.75 
 
 
178 aa  203  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  54.71 
 
 
178 aa  193  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  53.67 
 
 
184 aa  191  6e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  54.76 
 
 
177 aa  188  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  48.24 
 
 
179 aa  177  5.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  46.02 
 
 
176 aa  166  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  44.12 
 
 
182 aa  160  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  42.94 
 
 
183 aa  159  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  46.47 
 
 
179 aa  158  5e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  48.81 
 
 
281 aa  157  6e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  45.29 
 
 
179 aa  156  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  45.88 
 
 
176 aa  155  3e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  44.71 
 
 
179 aa  154  7e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  43.2 
 
 
199 aa  153  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  44.12 
 
 
179 aa  152  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  44.12 
 
 
179 aa  151  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  44.12 
 
 
179 aa  151  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  44.12 
 
 
179 aa  151  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  44.12 
 
 
179 aa  151  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  44.12 
 
 
179 aa  151  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  44.12 
 
 
179 aa  151  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  44.12 
 
 
179 aa  150  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  44.31 
 
 
177 aa  150  8.999999999999999e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  42.6 
 
 
180 aa  149  1e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  44.12 
 
 
179 aa  150  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  44.38 
 
 
180 aa  149  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  44.38 
 
 
180 aa  149  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
186 aa  149  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  41.04 
 
 
185 aa  147  8e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  46.41 
 
 
186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  40.57 
 
 
180 aa  145  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  44.97 
 
 
204 aa  144  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 
190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  45.68 
 
 
210 aa  138  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  42.51 
 
 
178 aa  137  4.999999999999999e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  46.06 
 
 
210 aa  137  8.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  40.83 
 
 
180 aa  137  8.999999999999999e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1572  NUDIX hydrolase  44.12 
 
 
179 aa  135  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 
192 aa  136  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  43.11 
 
 
215 aa  135  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1439  NUDIX hydrolase  43.79 
 
 
204 aa  135  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  46.39 
 
 
189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  45.66 
 
 
199 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3241  NUDIX hydrolase  43.79 
 
 
200 aa  135  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.021012  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  49.7 
 
 
211 aa  134  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  44.05 
 
 
175 aa  134  8e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0433  NUDIX hydrolase  41.57 
 
 
176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00447599  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  38.73 
 
 
211 aa  132  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  39.31 
 
 
194 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  39.31 
 
 
199 aa  131  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  38.37 
 
 
205 aa  131  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1418  ADP-ribose pyrophosphatase  42.77 
 
 
207 aa  131  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.656759  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  46.39 
 
 
211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  39.08 
 
 
199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  40.46 
 
 
196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  41.03 
 
 
184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1076  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40 
 
 
196 aa  129  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  44.05 
 
 
209 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  46.63 
 
 
184 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1451  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40.83 
 
 
196 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2199  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 
203 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  41.57 
 
 
204 aa  127  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0456  MutT/nudix family protein  39.76 
 
 
176 aa  127  7.000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0404799  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1814  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40.83 
 
 
196 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0722  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40.83 
 
 
196 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  37.57 
 
 
196 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1314  NUDIX family hydrolase  40.83 
 
 
196 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.861294  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0428  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40.83 
 
 
196 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1145  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40.83 
 
 
196 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107087  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1305  NUDIX family hydrolase  40.83 
 
 
196 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9435  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 
183 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  44.05 
 
 
209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_398  MutT/nudix, ADP-ribose pyrophosphatase  39.76 
 
 
176 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.148699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  44.05 
 
 
209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  41.36 
 
 
171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  44.31 
 
 
201 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  39.64 
 
 
196 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  40.24 
 
 
180 aa  125  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0600  NUDIX hydrolase  37.57 
 
 
183 aa  125  3e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  39.64 
 
 
196 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  39.64 
 
 
196 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  39.64 
 
 
196 aa  124  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  39.64 
 
 
196 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  39.64 
 
 
196 aa  124  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1876  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 
203 aa  124  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.48572 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  38.73 
 
 
194 aa  124  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1716  NUDIX hydrolase  40.72 
 
 
171 aa  124  7e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0743315 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1515  NUDIX hydrolase  37.57 
 
 
208 aa  124  9e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  38.29 
 
 
194 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
208 aa  122  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1507  NUDIX hydrolase  39.88 
 
 
201 aa  122  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.694951  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  38.79 
 
 
176 aa  122  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  40.57 
 
 
180 aa  121  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  37.27 
 
 
172 aa  121  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  37.79 
 
 
212 aa  121  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  40.46 
 
 
181 aa  120  8e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  37.06 
 
 
176 aa  120  9e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  45.03 
 
 
213 aa  120  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>