More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0456 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0456  MutT/nudix family protein  100 
 
 
176 aa  358  2e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0404799  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_398  MutT/nudix, ADP-ribose pyrophosphatase  91.48 
 
 
176 aa  333  1e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.148699  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0433  NUDIX hydrolase  87.93 
 
 
176 aa  319  9.999999999999999e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00447599  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
179 aa  137  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  42.01 
 
 
179 aa  131  5e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  38.69 
 
 
178 aa  131  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  39.76 
 
 
183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  39.76 
 
 
177 aa  127  7.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  40.12 
 
 
182 aa  127  9.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  38.37 
 
 
180 aa  125  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 
178 aa  125  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  36.9 
 
 
180 aa  124  7e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 
177 aa  120  7e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3241  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
200 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.021012  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  38.82 
 
 
176 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  40.94 
 
 
176 aa  119  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  35.06 
 
 
175 aa  118  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  35.47 
 
 
176 aa  117  6e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  41.21 
 
 
184 aa  117  7e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  36.53 
 
 
183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  38.82 
 
 
176 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1572  NUDIX hydrolase  43.2 
 
 
179 aa  114  5e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  34.27 
 
 
186 aa  114  6e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  39.77 
 
 
177 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
180 aa  114  6.9999999999999995e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 
184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 
184 aa  111  6e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 
179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 
186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  34.73 
 
 
190 aa  108  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 
180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  36.75 
 
 
179 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  35.15 
 
 
180 aa  108  6e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 
199 aa  107  9.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  36.75 
 
 
179 aa  106  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0237  NUDIX hydrolase  34.46 
 
 
183 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373824  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  35.76 
 
 
180 aa  105  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  35.76 
 
 
180 aa  105  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 
211 aa  105  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1439  NUDIX hydrolase  34.32 
 
 
204 aa  105  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  36.14 
 
 
179 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  36.14 
 
 
179 aa  105  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  36.14 
 
 
179 aa  105  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  36.14 
 
 
179 aa  105  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  36.14 
 
 
179 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  36.14 
 
 
179 aa  105  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 
179 aa  105  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 
195 aa  105  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 
183 aa  104  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 
183 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2896  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 
166 aa  102  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  35.54 
 
 
179 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2078  NUDIX family hydrolase  37.21 
 
 
194 aa  102  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1429  NUDIX hydrolase  38.32 
 
 
176 aa  102  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.742876  normal  0.0486947 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
180 aa  102  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  35.5 
 
 
196 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  35.5 
 
 
196 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  34.91 
 
 
185 aa  101  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  36.9 
 
 
209 aa  101  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 
281 aa  101  6e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 
176 aa  101  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 
192 aa  100  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 
196 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 
204 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1076  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.5 
 
 
196 aa  99  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  34.32 
 
 
196 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 
194 aa  98.6  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 
211 aa  98.2  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  36.31 
 
 
209 aa  97.8  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  35.93 
 
 
189 aa  98.2  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  34.32 
 
 
187 aa  97.8  6e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  36.31 
 
 
209 aa  97.8  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  34.32 
 
 
196 aa  97.4  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  34.32 
 
 
196 aa  97.4  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 
182 aa  97.1  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 
169 aa  96.7  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  36.2 
 
 
201 aa  96.7  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  35.12 
 
 
196 aa  95.5  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1814  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  34.32 
 
 
196 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0428  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  34.32 
 
 
196 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0722  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  34.32 
 
 
196 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1305  NUDIX family hydrolase  34.32 
 
 
196 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9435  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1314  NUDIX family hydrolase  34.32 
 
 
196 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.861294  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1145  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  34.32 
 
 
196 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107087  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  30.41 
 
 
175 aa  95.1  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  32.57 
 
 
207 aa  94.7  5e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1886  NUDIX hydrolase  35.33 
 
 
172 aa  95.1  5e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.556059 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2271  ADP-ribose pyrophosphatase  39.34 
 
 
183 aa  94.4  7e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1451  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  33.73 
 
 
196 aa  94.4  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0995  NUDIX hydrolase  41.21 
 
 
170 aa  93.6  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.575894  normal  0.946338 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0600  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 
183 aa  93.6  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3049  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 
182 aa  92.8  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  34.57 
 
 
184 aa  92.8  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25181  NUDIX hydrolase  36.18 
 
 
189 aa  92.8  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  34.42 
 
 
172 aa  92.4  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1515  NUDIX hydrolase  30.54 
 
 
208 aa  92.4  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 
210 aa  92  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  30.36 
 
 
184 aa  91.7  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  32.3 
 
 
199 aa  91.3  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2834  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 
169 aa  91.3  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>