More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1876 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1876  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 203 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.48572 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2199  NUDIX hydrolase  91.58 
 
 		 203 aa  387  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  84.62 
 
 		 205 aa  350  7e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  74.63 
 
 		 211 aa  314  5e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  77.84 
 
 		 204 aa  310  5.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  69.95 
 
 		 194 aa  277  8e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  69.95 
 
 		 194 aa  275  5e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1305  NUDIX family hydrolase  67.74 
 
 		 196 aa  266  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9435  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1814  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  67.74 
 
 		 196 aa  266  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0428  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  67.74 
 
 		 196 aa  266  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1314  NUDIX family hydrolase  67.74 
 
 		 196 aa  266  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.861294  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0722  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  67.74 
 
 		 196 aa  266  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1145  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  67.74 
 
 		 196 aa  266  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107087  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  67.74 
 
 		 196 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1451  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  67.2 
 
 		 196 aa  265  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1076  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  66.49 
 
 		 196 aa  265  4e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  67.74 
 
 		 196 aa  264  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  67.74 
 
 		 196 aa  264  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  67.2 
 
 		 196 aa  263  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  65.78 
 
 		 196 aa  263  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  66.67 
 
 		 196 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  66.13 
 
 		 196 aa  259  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  66.13 
 
 		 196 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1439  NUDIX hydrolase  54.36 
 
 		 204 aa  225  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  52.11 
 
 		 204 aa  219  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3241  NUDIX hydrolase  55 
 
 		 200 aa  217  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.021012  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1515  NUDIX hydrolase  54.64 
 
 		 208 aa  216  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  53.33 
 
 		 199 aa  210  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1507  NUDIX hydrolase  51.52 
 
 		 201 aa  206  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.694951  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  53.01 
 
 		 199 aa  203  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  50.54 
 
 		 185 aa  199  3e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  51.4 
 
 		 199 aa  197  7e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  49.73 
 
 		 194 aa  184  5e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1418  ADP-ribose pyrophosphatase  49.45 
 
 		 207 aa  182  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.656759  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 180 aa  167  7e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  44.64 
 
 		 189 aa  156  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  42.51 
 
 		 177 aa  150  8.999999999999999e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  42.35 
 
 		 183 aa  144  8.000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 		 178 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  41.32 
 
 		 180 aa  139  3e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  36.16 
 
 		 182 aa  137  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 		 180 aa  136  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 184 aa  136  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  41.62 
 
 		 177 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  42.17 
 
 		 178 aa  135  6.0000000000000005e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 		 179 aa  134  8e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  37.06 
 
 		 176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  40.46 
 
 		 178 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 180 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  40.34 
 
 		 281 aa  128  4.0000000000000003e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  36.84 
 
 		 176 aa  128  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  38.51 
 
 		 176 aa  127  9.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 179 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 		 177 aa  124  8.000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 190 aa  123  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  36.78 
 
 		 176 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 		 179 aa  118  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1572  NUDIX hydrolase  38.41 
 
 		 179 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  34.86 
 
 		 179 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  35.62 
 
 		 176 aa  116  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  36.14 
 
 		 180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 186 aa  112  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  34.25 
 
 		 187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  34.76 
 
 		 214 aa  112  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  33.71 
 
 		 179 aa  111  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  33.71 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  33.71 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  33.71 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  33.71 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  33.71 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  34.1 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  33.71 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  33.71 
 
 		 179 aa  109  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  33.14 
 
 		 179 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  32.93 
 
 		 180 aa  108  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  32.93 
 
 		 180 aa  108  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  36.53 
 
 		 184 aa  108  7.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  34.12 
 
 		 175 aa  108  7.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  33.13 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  41.03 
 
 		 173 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0227  NUDIX hydrolase  37.58 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.282406  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  30.73 
 
 		 183 aa  104  8e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  33.54 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 		 187 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 		 183 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  35.47 
 
 		 175 aa  102  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 		 187 aa  102  5e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 		 183 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  34.16 
 
 		 182 aa  99.8  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  31.98 
 
 		 195 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1652  NUDIX hydrolase  38.56 
 
 		 186 aa  99.4  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.568517  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  30.82 
 
 		 172 aa  99.8  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03661  NUDIX hydrolase  37.91 
 
 		 186 aa  99.4  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  36.02 
 
 		 179 aa  98.6  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 169 aa  98.6  6e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>