More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3458 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3458  NUDIX hydrolase  100 
 
 
215 aa  437  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.185858  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4021  NUDIX hydrolase  46.55 
 
 
181 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4251  NUDIX hydrolase  46.55 
 
 
181 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.0489284 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4096  NUDIX hydrolase  46.55 
 
 
181 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.196207  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6125  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 
178 aa  149  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2174  NUDIX hydrolase  42.7 
 
 
190 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0334323  normal  0.0698698 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29440  NUDIX family protein  45.29 
 
 
179 aa  139  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6067  NUDIX hydrolase  43.03 
 
 
193 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0114891  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4523  NUDIX hydrolase  43.21 
 
 
178 aa  134  9e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2006  NUDIX hydrolase  42.13 
 
 
186 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00276085  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4146  NUDIX hydrolase  41.76 
 
 
180 aa  125  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3065  hypothetical protein  39.88 
 
 
181 aa  124  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194764 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000782  ADP-ribose pyrophosphatase  40.49 
 
 
179 aa  122  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1489  NUDIX hydrolase  42.77 
 
 
173 aa  117  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1523  NUDIX hydrolase  37.13 
 
 
180 aa  115  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4016  NUDIX hydrolase  42.05 
 
 
183 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.298866 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02241  hypothetical protein  36.21 
 
 
179 aa  108  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0727099  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4797  NUDIX hydrolase  40.23 
 
 
196 aa  108  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.868054  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4737  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 
174 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2018  NUDIX hydrolase  40.12 
 
 
192 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2029  NUDIX hydrolase  36.9 
 
 
184 aa  85.9  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40025  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0271  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 
180 aa  84.3  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.443042  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2826  pyrophosphohydrolase related protein  33.13 
 
 
192 aa  84  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
175 aa  82.8  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  34.74 
 
 
178 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  31.14 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2928  NUDIX hydrolase  32.57 
 
 
189 aa  81.6  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  27.37 
 
 
177 aa  80.1  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 
180 aa  80.5  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0471  NUDIX hydrolase  31.33 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115783  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  29.31 
 
 
195 aa  79.3  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6699  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 
215 aa  78.2  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.121967 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3513  NUDIX hydrolase  35.06 
 
 
184 aa  77.4  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.200164 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1662  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 
201 aa  76.3  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0978  NUDIX hydrolase  34.46 
 
 
189 aa  76.3  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  30.59 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  27.17 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  26.38 
 
 
180 aa  74.7  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  32.16 
 
 
207 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15030  NTP pyrophosphohydrolase  34.94 
 
 
181 aa  73.6  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202896  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 
176 aa  73.9  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1066  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.133388  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2834  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 
169 aa  73.2  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2078  NUDIX family hydrolase  31.55 
 
 
194 aa  72.8  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0039  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  27.53 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  31 
 
 
209 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
208 aa  72.4  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  28.66 
 
 
169 aa  72  0.000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3069  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 
188 aa  72  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3899  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 
187 aa  72  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  28.14 
 
 
183 aa  71.6  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 
182 aa  70.9  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  30.23 
 
 
176 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 
184 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2209  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 
184 aa  70.5  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.022301  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3586  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  30.5 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  30.5 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
181 aa  69.3  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  28.31 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0333  MutT/nudix family protein  31.46 
 
 
189 aa  68.6  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0452702  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2192  NUDIX hydrolase  33.13 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.349846  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2474  MutT/nudix family protein  28.4 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.131904  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  29.46 
 
 
176 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 
183 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2429  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 
182 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3753  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 
206 aa  67  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.641661  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0180  NUDIX hydrolase  35.61 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195159 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  28.06 
 
 
196 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  28.66 
 
 
171 aa  67  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  28.06 
 
 
196 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
196 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0219  NUDIX hydrolase  29.14 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  25.97 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1424  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.884669  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0268  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.880251  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0176  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0982781  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1076  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.67 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3049  NUDIX hydrolase  30.86 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0433  NUDIX hydrolase  27.44 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00447599  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  29.75 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  34.96 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1451  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  29.81 
 
 
196 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  27.04 
 
 
196 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  36.97 
 
 
201 aa  64.7  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  27.32 
 
 
196 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5000  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 
180 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1242  NUDIX hydrolase  31.74 
 
 
216 aa  64.7  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.141201  normal  0.571829 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1305  NUDIX family hydrolase  29.81 
 
 
196 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9435  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0237  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
183 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373824  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0722  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  29.81 
 
 
196 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>