285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3753 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3753  NUDIX hydrolase  100 
 
 
206 aa  421  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.641661  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1066  NUDIX hydrolase  49.47 
 
 
201 aa  187  8e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.133388  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2029  NUDIX hydrolase  51.46 
 
 
184 aa  183  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40025  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2928  NUDIX hydrolase  47.28 
 
 
189 aa  174  7e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1662  NUDIX hydrolase  44.69 
 
 
201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2826  pyrophosphohydrolase related protein  48.24 
 
 
192 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0219  NUDIX hydrolase  43.96 
 
 
184 aa  168  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2474  MutT/nudix family protein  42.05 
 
 
182 aa  155  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.131904  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0471  NUDIX hydrolase  44.31 
 
 
184 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115783  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0333  MutT/nudix family protein  45.03 
 
 
189 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0452702  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2429  NUDIX hydrolase  35.88 
 
 
182 aa  118  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3049  NUDIX hydrolase  35.23 
 
 
182 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0271  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 
180 aa  106  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.443042  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0180  NUDIX hydrolase  39.64 
 
 
183 aa  104  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195159 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0157  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
180 aa  96.3  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0179624  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2209  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
184 aa  95.1  7e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.022301  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15030  NTP pyrophosphohydrolase  38.32 
 
 
181 aa  92.4  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202896  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  37.78 
 
 
180 aa  88.6  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0176  NUDIX hydrolase  39.1 
 
 
173 aa  88.2  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0982781  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 
178 aa  85.1  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 
173 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  32.34 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 
173 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  37.41 
 
 
281 aa  82  0.000000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6699  NUDIX hydrolase  30.11 
 
 
215 aa  81.3  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.121967 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  31.68 
 
 
177 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  32.98 
 
 
210 aa  80.1  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  37.24 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 
181 aa  79.3  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  30.97 
 
 
184 aa  78.2  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  29.77 
 
 
177 aa  77  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  36.55 
 
 
209 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  36.55 
 
 
209 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000782  ADP-ribose pyrophosphatase  32.1 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  34.86 
 
 
211 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4146  NUDIX hydrolase  34.73 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 
173 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 
177 aa  75.5  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2192  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.349846  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0212  NUDIX hydrolase  35.88 
 
 
186 aa  74.7  0.0000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.465676  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4737  NUDIX hydrolase  34.57 
 
 
174 aa  73.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03121  NUDIX hydrolase  34.56 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 
199 aa  72  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  27.32 
 
 
192 aa  72  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  32.16 
 
 
210 aa  72  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0722  NUDIX hydrolase  29.89 
 
 
184 aa  72  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3354  mutT/nudix family protein  39.06 
 
 
173 aa  71.6  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6067  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0114891  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
179 aa  71.2  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 
172 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 
184 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  32.42 
 
 
201 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 
184 aa  70.5  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0978  NUDIX hydrolase  30 
 
 
189 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  27.11 
 
 
176 aa  70.5  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02241  hypothetical protein  32.5 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0727099  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  29.94 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2006  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00276085  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0238  NUDIX hydrolase  33.97 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  30.86 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25181  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 
189 aa  68.6  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  32.08 
 
 
184 aa  68.2  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 
178 aa  67.8  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
184 aa  67.8  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03191  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 
186 aa  67.4  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.798424  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  26.44 
 
 
182 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  31.62 
 
 
185 aa  67  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1544  NUDIX hydrolase  28.41 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2467  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 
181 aa  67.4  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  29.56 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3458  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 
215 aa  67  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.185858  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2439  NUDIX hydrolase  29.34 
 
 
181 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2018  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 
192 aa  67.4  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2672  NUDIX hydrolase  29.05 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.687973  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1716  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 
171 aa  66.2  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0743315 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3065  hypothetical protein  32.3 
 
 
181 aa  65.9  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194764 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  32.33 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  31.2 
 
 
195 aa  65.5  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4016  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.298866 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  29.59 
 
 
186 aa  64.7  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 
213 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  32 
 
 
183 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  30.77 
 
 
205 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  32 
 
 
183 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1523  NUDIX hydrolase  31.29 
 
 
180 aa  64.3  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  34.96 
 
 
204 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  32.1 
 
 
171 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1444  NUDIX hydrolase  29.59 
 
 
181 aa  63.5  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.9766  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  27.92 
 
 
169 aa  63.5  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  30.05 
 
 
212 aa  63.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2896  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 
166 aa  63.2  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1652  NUDIX hydrolase  29.33 
 
 
186 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.568517  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 
176 aa  63.2  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  29.45 
 
 
185 aa  62.8  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2771  NUDIX hydrolase  27.91 
 
 
192 aa  62.8  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  26.25 
 
 
183 aa  62  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 
201 aa  62.4  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4251  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 
181 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.0489284 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>