234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4016 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4016  NUDIX hydrolase  100 
 
 
183 aa  375  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.298866 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1489  NUDIX hydrolase  58.13 
 
 
173 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2006  NUDIX hydrolase  52.51 
 
 
186 aa  177  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00276085  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6067  NUDIX hydrolase  45.93 
 
 
193 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0114891  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4021  NUDIX hydrolase  50.3 
 
 
181 aa  148  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4096  NUDIX hydrolase  50.3 
 
 
181 aa  148  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.196207  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4251  NUDIX hydrolase  50.3 
 
 
181 aa  148  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.0489284 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2174  NUDIX hydrolase  48.24 
 
 
190 aa  144  9e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0334323  normal  0.0698698 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3065  hypothetical protein  42.77 
 
 
181 aa  142  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6125  NUDIX hydrolase  49.4 
 
 
178 aa  140  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4146  NUDIX hydrolase  46.24 
 
 
180 aa  137  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29440  NUDIX family protein  49.7 
 
 
179 aa  134  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1523  NUDIX hydrolase  39.01 
 
 
180 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000782  ADP-ribose pyrophosphatase  40.35 
 
 
179 aa  134  6.0000000000000005e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4797  NUDIX hydrolase  48.8 
 
 
196 aa  132  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.868054  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2018  NUDIX hydrolase  45.14 
 
 
192 aa  131  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02241  hypothetical protein  39.53 
 
 
179 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0727099  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4737  NUDIX hydrolase  43.53 
 
 
174 aa  128  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4523  NUDIX hydrolase  46.58 
 
 
178 aa  128  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3458  NUDIX hydrolase  42.05 
 
 
215 aa  115  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.185858  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2826  pyrophosphohydrolase related protein  38.46 
 
 
192 aa  108  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0271  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 
180 aa  102  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.443042  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2029  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 
184 aa  87.8  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40025  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1662  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 
201 aa  85.1  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0471  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 
184 aa  84.7  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115783  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2928  NUDIX hydrolase  31.79 
 
 
189 aa  83.6  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2209  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
184 aa  82.4  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.022301  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0219  NUDIX hydrolase  32.18 
 
 
184 aa  82  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  35.5 
 
 
209 aa  81.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0157  NUDIX hydrolase  37.58 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0179624  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 
177 aa  81.3  0.000000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  35.52 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  35.5 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  35.5 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1066  NUDIX hydrolase  39.51 
 
 
201 aa  78.2  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.133388  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 
215 aa  77  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3598  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 
193 aa  77  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2474  MutT/nudix family protein  34.32 
 
 
182 aa  77  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.131904  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2834  NUDIX hydrolase  34.36 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  29.88 
 
 
196 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0333  MutT/nudix family protein  38.15 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0452702  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  30.18 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  30.54 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  30.67 
 
 
184 aa  72.8  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6699  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
215 aa  72  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.121967 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  30.12 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  34.84 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0268  NUDIX hydrolase  32.7 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.880251  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  30.32 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2192  NUDIX hydrolase  37.72 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.349846  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 
201 aa  69.3  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 
177 aa  68.9  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  32.53 
 
 
211 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15030  NTP pyrophosphohydrolase  36.9 
 
 
181 aa  68.6  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202896  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1515  NUDIX hydrolase  33.74 
 
 
208 aa  68.2  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  34.57 
 
 
213 aa  68.2  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  35.26 
 
 
210 aa  67.8  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1507  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
201 aa  67.8  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.694951  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  30.3 
 
 
176 aa  67.8  0.00000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  31.14 
 
 
194 aa  67  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 
195 aa  67.4  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  30.59 
 
 
164 aa  67.4  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0237  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
183 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373824  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1418  ADP-ribose pyrophosphatase  33.54 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.656759  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  30.3 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  32.3 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3753  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 
206 aa  65.1  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.641661  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2078  NUDIX family hydrolase  30.82 
 
 
194 aa  65.1  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3049  NUDIX hydrolase  32.18 
 
 
182 aa  65.1  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  30.86 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  35.62 
 
 
281 aa  64.7  0.0000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3241  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 
200 aa  64.7  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.021012  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  32.3 
 
 
179 aa  64.3  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  34.4 
 
 
199 aa  64.3  0.0000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0185  hypothetical protein  28.9 
 
 
335 aa  64.3  0.0000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.533354  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  28.09 
 
 
183 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  28.74 
 
 
182 aa  63.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0978  NUDIX hydrolase  30.06 
 
 
189 aa  63.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 
212 aa  63.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  29.05 
 
 
184 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0604  MutT/nudix family protein  31.36 
 
 
182 aa  63.2  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  27.88 
 
 
179 aa  63.5  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  28.49 
 
 
180 aa  63.5  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 
208 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  28.09 
 
 
183 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03121  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 
189 aa  62.8  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  28.93 
 
 
175 aa  62.4  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2429  NUDIX hydrolase  30.86 
 
 
182 aa  62.8  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0995  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
170 aa  62  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.575894  normal  0.946338 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  29.17 
 
 
194 aa  62  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  28.49 
 
 
192 aa  61.6  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_398  MutT/nudix, ADP-ribose pyrophosphatase  30.36 
 
 
176 aa  61.6  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.148699  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  28.42 
 
 
204 aa  62  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0180  NUDIX hydrolase  33.86 
 
 
183 aa  61.2  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195159 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  30.29 
 
 
184 aa  61.2  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  31.06 
 
 
179 aa  60.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
196 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>