More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0995 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0995  NUDIX hydrolase  100 
 
 
170 aa  344  4e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.575894  normal  0.946338 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1651  NUDIX hydrolase  71.07 
 
 
163 aa  228  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1808  NUDIX hydrolase  56.41 
 
 
193 aa  166  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.801107  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 
178 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 
184 aa  99.8  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  38.12 
 
 
180 aa  97.4  8e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_398  MutT/nudix, ADP-ribose pyrophosphatase  41.21 
 
 
176 aa  95.5  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.148699  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 
190 aa  95.1  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0456  MutT/nudix family protein  41.21 
 
 
176 aa  93.6  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0404799  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 
179 aa  92.8  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 
175 aa  92.8  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 
180 aa  93.2  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 
210 aa  92  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  39.69 
 
 
179 aa  92  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  36.02 
 
 
177 aa  92  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  40.88 
 
 
178 aa  91.7  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0433  NUDIX hydrolase  45 
 
 
176 aa  92  4e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00447599  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  37.43 
 
 
172 aa  91.3  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  38.93 
 
 
179 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  33.54 
 
 
176 aa  89.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  38.93 
 
 
179 aa  89  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  38.93 
 
 
179 aa  89  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  38.93 
 
 
179 aa  89  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  38.93 
 
 
179 aa  89  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  38.93 
 
 
179 aa  89  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  38.93 
 
 
179 aa  89  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  38.93 
 
 
179 aa  89  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 
179 aa  89  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  35.22 
 
 
187 aa  89  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 
183 aa  88.6  4e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  38.17 
 
 
179 aa  88.6  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  32.53 
 
 
179 aa  88.2  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  32.3 
 
 
281 aa  87  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 
184 aa  87  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  43.09 
 
 
164 aa  86.3  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  33.13 
 
 
182 aa  85.9  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2834  NUDIX hydrolase  40.31 
 
 
169 aa  84.7  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 
178 aa  84  9e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  35.67 
 
 
175 aa  83.2  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 
177 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2771  NUDIX hydrolase  40.14 
 
 
192 aa  82.8  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1768  NUDIX hydrolase  39.55 
 
 
175 aa  83.2  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00835912  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  37.24 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  41.74 
 
 
171 aa  82  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  32.53 
 
 
192 aa  81.6  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3354  mutT/nudix family protein  37.59 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  39.71 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  36.16 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  33.33 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 
186 aa  79  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1336  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 
171 aa  79  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.723792 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1886  NUDIX hydrolase  41.23 
 
 
172 aa  77.8  0.00000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.556059 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 
176 aa  77.4  0.00000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  32.68 
 
 
184 aa  77.4  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  32.62 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  37.04 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  35.46 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5882  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 
191 aa  75.9  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  34.25 
 
 
169 aa  75.5  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 
184 aa  74.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03121  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 
189 aa  74.3  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1429  NUDIX hydrolase  41.23 
 
 
176 aa  74.3  0.0000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.742876  normal  0.0486947 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  39.82 
 
 
201 aa  73.6  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  31.33 
 
 
195 aa  73.2  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  40.71 
 
 
201 aa  73.6  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  35.51 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  40.17 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 
213 aa  72.4  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 
215 aa  71.6  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0185  hypothetical protein  41.82 
 
 
335 aa  71.6  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.533354  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0830  NUDIX hydrolase  39.64 
 
 
177 aa  71.2  0.000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.66661  normal  0.255619 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1854  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 
163 aa  70.9  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 
183 aa  70.1  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  32.89 
 
 
182 aa  70.5  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4063  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 
228 aa  70.5  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0818284  normal  0.284545 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1716  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 
171 aa  70.5  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0743315 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2896  NUDIX hydrolase  31.34 
 
 
166 aa  70.1  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38092  predicted protein  48.81 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00931034  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1520  NUDIX hydrolase  32.93 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234445  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0268  NUDIX hydrolase  41.46 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.880251  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2211  NUDIX hydrolase  42.06 
 
 
164 aa  69.7  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1537  MutT/nudix family protein  31.29 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.652785  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1652  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.568517  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0176  NUDIX hydrolase  40.57 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0982781  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1134  NUDIX hydrolase  46.24 
 
 
200 aa  68.2  0.00000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1572  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 
179 aa  68.2  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 
209 aa  68.2  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0603  NUDIX hydrolase  37.27 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0913378  normal  0.29293 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03661  NUDIX hydrolase  33.86 
 
 
186 aa  67.8  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0237  NUDIX hydrolase  38.68 
 
 
183 aa  67.8  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373824  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 
209 aa  67.8  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  40.52 
 
 
199 aa  67.8  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>