More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1520 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1520  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 220 aa  439  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234445  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1519  NUDIX hydrolase  83.18 
 
 		 220 aa  358  5e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000389624 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1133  NUDIX hydrolase  54.63 
 
 		 225 aa  222  3e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3140  NUDIX hydrolase  56.93 
 
 		 225 aa  217  8.999999999999998e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511935  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14200  NUDIX family protein  50 
 
 		 235 aa  208  5e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0659704  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22070  NTP pyrophosphohydrolase  57.21 
 
 		 219 aa  207  7e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2348  NUDIX hydrolase  53.27 
 
 		 210 aa  204  6e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00912328  normal  0.0106592 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1348  NUDIX hydrolase  61.19 
 
 		 217 aa  191  9e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.841772  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  51.89 
 
 		 201 aa  186  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1242  NUDIX hydrolase  49.76 
 
 		 216 aa  184  7e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.141201  normal  0.571829 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1665  NUDIX hydrolase  56.02 
 
 		 203 aa  182  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0528877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  53.51 
 
 		 201 aa  175  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  45.71 
 
 		 212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2991  NUDIX hydrolase  50.75 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13740  NTP pyrophosphohydrolase  46.41 
 
 		 215 aa  162  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1200  hypothetical protein  51.76 
 
 		 207 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.552549  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2835  NUDIX hydrolase  48.31 
 
 		 210 aa  159  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0310181  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  42.72 
 
 		 208 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1755  NUDIX hydrolase  47.09 
 
 		 207 aa  152  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0106102  hitchhiker  0.000762275 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  45.36 
 
 		 199 aa  151  7e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3156  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 207 aa  150  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.38817  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  46.43 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0970  NUDIX hydrolase  47.39 
 
 		 220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  47.15 
 
 		 210 aa  146  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  43.88 
 
 		 209 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  43.37 
 
 		 209 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  43.37 
 
 		 209 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  43.59 
 
 		 210 aa  141  7e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4431  NUDIX hydrolase  49.71 
 
 		 188 aa  138  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.212401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  45.36 
 
 		 211 aa  137  8.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  40.51 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  42.56 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12410  NUDIX family protein  42.47 
 
 		 227 aa  121  6e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.274172  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4063  NUDIX hydrolase  41.29 
 
 		 228 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0818284  normal  0.284545 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  41.12 
 
 		 213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 		 178 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  34.95 
 
 		 177 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  35.06 
 
 		 180 aa  112  3e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  38.15 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 		 179 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  35.26 
 
 		 180 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  34.3 
 
 		 176 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  38.37 
 
 		 185 aa  104  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 		 182 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 		 178 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 		 176 aa  100  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 		 180 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2486  NUDIX hydrolase  35.53 
 
 		 193 aa  98.2  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.253943  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 177 aa  97.4  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  34.66 
 
 		 176 aa  97.1  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  33.7 
 
 		 172 aa  95.1  7e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  32.16 
 
 		 179 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  31.58 
 
 		 179 aa  92  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 		 199 aa  91.7  8e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  30.99 
 
 		 179 aa  91.7  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 		 281 aa  91.3  9e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  39.38 
 
 		 184 aa  90.9  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  32.94 
 
 		 179 aa  90.5  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 179 aa  90.1  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  31.58 
 
 		 179 aa  89.7  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  31.58 
 
 		 179 aa  89.7  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  31.58 
 
 		 179 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  31.58 
 
 		 179 aa  89.7  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  31.58 
 
 		 179 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  31.58 
 
 		 179 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 184 aa  89.4  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  31.58 
 
 		 179 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  32.75 
 
 		 179 aa  89  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3089  NUDIX hydrolase  38.95 
 
 		 177 aa  87.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  33.15 
 
 		 190 aa  87.8  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  34.27 
 
 		 194 aa  87.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  34.12 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  38.19 
 
 		 196 aa  86.7  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2199  NUDIX hydrolase  32.63 
 
 		 203 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1305  NUDIX family hydrolase  32.63 
 
 		 196 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9435  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1814  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.63 
 
 		 196 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  38.81 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1451  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.63 
 
 		 196 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  32.04 
 
 		 186 aa  86.3  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  29.3 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  29.28 
 
 		 186 aa  86.3  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  32.63 
 
 		 196 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0428  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.63 
 
 		 196 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1314  NUDIX family hydrolase  32.63 
 
 		 196 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.861294  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  30.86 
 
 		 184 aa  86.3  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0722  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.63 
 
 		 196 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1145  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.63 
 
 		 196 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107087  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  34.32 
 
 		 173 aa  85.9  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 199 aa  85.9  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  38.19 
 
 		 196 aa  85.9  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  38.19 
 
 		 196 aa  85.9  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1515  NUDIX hydrolase  31.05 
 
 		 208 aa  85.5  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  33.54 
 
 		 180 aa  85.1  7e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  34.12 
 
 		 180 aa  85.1  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  30.59 
 
 		 187 aa  85.1  7e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  32.11 
 
 		 196 aa  85.1  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  40.31 
 
 		 180 aa  85.1  8e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  32.11 
 
 		 196 aa  85.1  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>