More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2486 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2486  NUDIX hydrolase  100 
 
 
193 aa  381  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.253943  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4063  NUDIX hydrolase  45.24 
 
 
228 aa  124  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0818284  normal  0.284545 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2835  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 
210 aa  124  7e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0310181  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1200  hypothetical protein  45.95 
 
 
207 aa  124  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.552549  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  43.9 
 
 
207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  43.03 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2991  NUDIX hydrolase  39.78 
 
 
208 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  40.21 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0970  NUDIX hydrolase  43.98 
 
 
220 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3156  NUDIX hydrolase  43.01 
 
 
207 aa  109  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.38817  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
212 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  45.35 
 
 
210 aa  107  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14200  NUDIX family protein  38.1 
 
 
235 aa  104  6e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0659704  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  40.24 
 
 
209 aa  104  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  40.24 
 
 
209 aa  104  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  40 
 
 
210 aa  102  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  39.63 
 
 
209 aa  101  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13740  NTP pyrophosphohydrolase  45.45 
 
 
215 aa  100  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  43.98 
 
 
211 aa  100  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  39.88 
 
 
211 aa  100  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  40.54 
 
 
182 aa  100  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  44.3 
 
 
201 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1519  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
220 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000389624 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1242  NUDIX hydrolase  39.58 
 
 
216 aa  100  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.141201  normal  0.571829 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  38.75 
 
 
178 aa  98.6  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  35.46 
 
 
176 aa  98.6  5e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1133  NUDIX hydrolase  43.05 
 
 
225 aa  97.1  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 
184 aa  97.1  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 
180 aa  95.9  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  29.82 
 
 
179 aa  96.3  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1520  NUDIX hydrolase  35.08 
 
 
220 aa  96.3  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234445  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  39.74 
 
 
172 aa  95.5  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3140  NUDIX hydrolase  43.26 
 
 
225 aa  94.7  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511935  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 
177 aa  94.4  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 
178 aa  92.8  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2348  NUDIX hydrolase  42.18 
 
 
210 aa  93.2  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00912328  normal  0.0106592 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1755  NUDIX hydrolase  41.11 
 
 
207 aa  93.2  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0106102  hitchhiker  0.000762275 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  36.97 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 
180 aa  92.8  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  42.6 
 
 
201 aa  92.4  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  35.03 
 
 
183 aa  92  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22070  NTP pyrophosphohydrolase  46.56 
 
 
219 aa  92  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  35.76 
 
 
177 aa  91.3  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 
177 aa  90.5  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  27.54 
 
 
187 aa  90.9  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1134  NUDIX hydrolase  42.57 
 
 
200 aa  90.1  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1665  NUDIX hydrolase  46.94 
 
 
203 aa  90.1  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0528877  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  39.01 
 
 
281 aa  89.7  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  34.36 
 
 
185 aa  88.2  7e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
179 aa  88.2  7e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  45.9 
 
 
213 aa  88.2  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  33.54 
 
 
179 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  32.94 
 
 
186 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  29.88 
 
 
183 aa  82.8  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  32.93 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3089  NUDIX hydrolase  38.55 
 
 
177 aa  82  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 
186 aa  81.3  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 
179 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 
169 aa  80.9  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  31.88 
 
 
183 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 
183 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1348  NUDIX hydrolase  45.8 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.841772  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  32.93 
 
 
179 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_398  MutT/nudix, ADP-ribose pyrophosphatase  33.71 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.148699  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  33.54 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03121  NUDIX hydrolase  32.21 
 
 
189 aa  79.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  29.88 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  36.44 
 
 
179 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  36.44 
 
 
179 aa  79  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  36.44 
 
 
179 aa  79  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  36.44 
 
 
179 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  36.44 
 
 
179 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  36.44 
 
 
179 aa  79  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  36.44 
 
 
179 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25181  NUDIX hydrolase  39.09 
 
 
189 aa  78.6  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  36.54 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1652  NUDIX hydrolase  33.86 
 
 
186 aa  78.2  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.568517  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  36.27 
 
 
187 aa  78.2  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0456  MutT/nudix family protein  32.96 
 
 
176 aa  77.8  0.00000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0404799  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03661  NUDIX hydrolase  33.86 
 
 
186 aa  77.8  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2896  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 
166 aa  77  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
187 aa  77.4  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
187 aa  77.4  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4431  NUDIX hydrolase  39.43 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.212401  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  33.77 
 
 
192 aa  75.9  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  30.52 
 
 
185 aa  75.5  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0238  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
186 aa  75.5  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0433  NUDIX hydrolase  32.57 
 
 
176 aa  75.1  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00447599  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 
189 aa  75.1  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  30.67 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1344  hypothetical protein  34.04 
 
 
265 aa  75.1  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.321071  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1716  NUDIX hydrolase  32.21 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0743315 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12410  NUDIX family protein  40 
 
 
227 aa  75.1  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.274172  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  30.67 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  31.55 
 
 
196 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  31.55 
 
 
196 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0740  NTP pyrophosphohydrolase including oxidative damage repair enzyme  33.79 
 
 
199 aa  74.7  0.0000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000988568  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 
190 aa  74.7  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>