More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2987 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  100 
 
 
209 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  100 
 
 
209 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  99.52 
 
 
209 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  71.01 
 
 
211 aa  294  7e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  70.87 
 
 
211 aa  292  2e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  68.12 
 
 
207 aa  291  6e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  56.86 
 
 
210 aa  221  6e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  57.77 
 
 
215 aa  219  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  57.07 
 
 
210 aa  209  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  57.35 
 
 
213 aa  209  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4063  NUDIX hydrolase  56.83 
 
 
228 aa  192  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0818284  normal  0.284545 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  51.55 
 
 
199 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  54.7 
 
 
201 aa  178  4.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  48.74 
 
 
212 aa  166  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1755  NUDIX hydrolase  49.5 
 
 
207 aa  166  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0106102  hitchhiker  0.000762275 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3140  NUDIX hydrolase  49.21 
 
 
225 aa  164  8e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511935  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  45.69 
 
 
208 aa  162  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  51.74 
 
 
201 aa  161  6e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  50.29 
 
 
178 aa  154  7e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3156  NUDIX hydrolase  46 
 
 
207 aa  153  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.38817  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13740  NTP pyrophosphohydrolase  46.03 
 
 
215 aa  152  5e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2348  NUDIX hydrolase  48.19 
 
 
210 aa  151  8e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00912328  normal  0.0106592 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1242  NUDIX hydrolase  48.13 
 
 
216 aa  145  6e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.141201  normal  0.571829 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1133  NUDIX hydrolase  47.18 
 
 
225 aa  144  9e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2835  NUDIX hydrolase  48.98 
 
 
210 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0310181  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2991  NUDIX hydrolase  47.18 
 
 
208 aa  141  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4431  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 
188 aa  141  8e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.212401  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22070  NTP pyrophosphohydrolase  47.74 
 
 
219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  43.71 
 
 
184 aa  139  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  42.35 
 
 
178 aa  138  6e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1519  NUDIX hydrolase  43.81 
 
 
220 aa  138  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000389624 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1520  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
220 aa  137  7.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234445  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  42.26 
 
 
180 aa  132  5e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
177 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1200  hypothetical protein  49.21 
 
 
207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.552549  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  44.05 
 
 
177 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 
182 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1348  NUDIX hydrolase  46.07 
 
 
217 aa  122  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.841772  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14200  NUDIX family protein  43.43 
 
 
235 aa  122  4e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0659704  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  40.76 
 
 
179 aa  122  6e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  44.25 
 
 
281 aa  120  9.999999999999999e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  40.13 
 
 
179 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  40.13 
 
 
179 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  40.13 
 
 
179 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  40.13 
 
 
179 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  40.13 
 
 
179 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  40.13 
 
 
179 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  37.89 
 
 
186 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  39.55 
 
 
192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  40.13 
 
 
179 aa  119  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  40.13 
 
 
179 aa  119  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  39.47 
 
 
179 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  39.47 
 
 
179 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 
180 aa  118  6e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  35.26 
 
 
183 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  38.69 
 
 
179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  37.58 
 
 
176 aa  115  5e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  36.31 
 
 
180 aa  114  8.999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  33.53 
 
 
177 aa  112  3e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  39.75 
 
 
186 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  35.36 
 
 
194 aa  111  6e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  36.26 
 
 
185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0970  NUDIX hydrolase  47.7 
 
 
220 aa  109  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4146  NUDIX hydrolase  37.08 
 
 
180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  34.73 
 
 
175 aa  107  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  31.15 
 
 
183 aa  106  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 
179 aa  106  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  36.57 
 
 
180 aa  105  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  35.93 
 
 
199 aa  106  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1665  NUDIX hydrolase  44.19 
 
 
203 aa  105  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0528877  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  32.74 
 
 
176 aa  104  9e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2486  NUDIX hydrolase  40.24 
 
 
193 aa  104  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.253943  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3089  NUDIX hydrolase  42.34 
 
 
177 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  35.67 
 
 
176 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  37.13 
 
 
179 aa  103  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  37.72 
 
 
180 aa  102  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  31.52 
 
 
187 aa  101  7e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2826  pyrophosphohydrolase related protein  36.07 
 
 
192 aa  101  9e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 
172 aa  100  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  33.16 
 
 
199 aa  101  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2078  NUDIX family hydrolase  35.12 
 
 
194 aa  101  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0433  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 
176 aa  100  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00447599  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  37.58 
 
 
194 aa  99.8  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1418  ADP-ribose pyrophosphatase  39.05 
 
 
207 aa  99.8  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.656759  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  31.55 
 
 
176 aa  99.8  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2771  NUDIX hydrolase  35.67 
 
 
192 aa  98.2  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2018  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 
192 aa  98.2  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0456  MutT/nudix family protein  36.31 
 
 
176 aa  97.8  9e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0404799  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2029  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 
184 aa  98.2  9e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40025  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
194 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1515  NUDIX hydrolase  34.64 
 
 
208 aa  97.4  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  30.64 
 
 
184 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2928  NUDIX hydrolase  35.36 
 
 
189 aa  97.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  32.3 
 
 
183 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0219  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 
184 aa  96.7  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  29.76 
 
 
195 aa  97.1  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1523  NUDIX hydrolase  37.06 
 
 
180 aa  96.3  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0471  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 
184 aa  96.3  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115783  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  31.74 
 
 
180 aa  95.5  5e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_398  MutT/nudix, ADP-ribose pyrophosphatase  34.52 
 
 
176 aa  95.5  5e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.148699  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>