More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1242 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1242  NUDIX hydrolase  100 
 
 
216 aa  420  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.141201  normal  0.571829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  53 
 
 
208 aa  195  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2348  NUDIX hydrolase  56 
 
 
210 aa  192  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00912328  normal  0.0106592 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1133  NUDIX hydrolase  54.23 
 
 
225 aa  191  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  52.38 
 
 
212 aa  188  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1519  NUDIX hydrolase  49.28 
 
 
220 aa  185  5e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000389624 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1520  NUDIX hydrolase  49.76 
 
 
220 aa  180  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234445  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3140  NUDIX hydrolase  52.24 
 
 
225 aa  170  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511935  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22070  NTP pyrophosphohydrolase  53.92 
 
 
219 aa  170  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2991  NUDIX hydrolase  52.78 
 
 
208 aa  169  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  53.3 
 
 
210 aa  158  8e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14200  NUDIX family protein  46.15 
 
 
235 aa  156  3e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0659704  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13740  NTP pyrophosphohydrolase  47.57 
 
 
215 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2835  NUDIX hydrolase  49.04 
 
 
210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0310181  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  48.13 
 
 
209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1348  NUDIX hydrolase  50 
 
 
217 aa  145  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.841772  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1755  NUDIX hydrolase  48.91 
 
 
207 aa  146  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0106102  hitchhiker  0.000762275 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  48.04 
 
 
201 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  48.13 
 
 
209 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  48.11 
 
 
207 aa  145  6e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  48.13 
 
 
209 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1665  NUDIX hydrolase  51.32 
 
 
203 aa  144  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0528877  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  44.62 
 
 
199 aa  143  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1200  hypothetical protein  49.22 
 
 
207 aa  142  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.552549  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3156  NUDIX hydrolase  49.46 
 
 
207 aa  141  9e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.38817  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  50.31 
 
 
201 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  44.78 
 
 
211 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  48.39 
 
 
210 aa  138  7e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  45.26 
 
 
215 aa  138  7.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 
211 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4063  NUDIX hydrolase  46.2 
 
 
228 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0818284  normal  0.284545 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0970  NUDIX hydrolase  45.67 
 
 
220 aa  132  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  48.15 
 
 
213 aa  129  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  42.53 
 
 
178 aa  124  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  39.2 
 
 
179 aa  122  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12410  NUDIX family protein  49.1 
 
 
227 aa  117  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.274172  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 
184 aa  116  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
177 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  40.83 
 
 
177 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4431  NUDIX hydrolase  43.45 
 
 
188 aa  112  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.212401  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  35.67 
 
 
176 aa  110  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 
177 aa  106  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  34.1 
 
 
180 aa  106  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  38.73 
 
 
178 aa  105  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 
172 aa  103  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 
180 aa  103  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 
192 aa  102  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  43.44 
 
 
179 aa  101  8e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  36.9 
 
 
176 aa  101  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  30.81 
 
 
187 aa  101  9e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  37.06 
 
 
183 aa  101  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  36.55 
 
 
281 aa  100  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2486  NUDIX hydrolase  39.58 
 
 
193 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.253943  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  40 
 
 
186 aa  94  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 
182 aa  94.4  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  37.95 
 
 
190 aa  94.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 
196 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  45.6 
 
 
175 aa  92.8  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  29.65 
 
 
183 aa  92.8  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3089  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 
177 aa  90.9  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  38.12 
 
 
194 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  41.88 
 
 
186 aa  90.1  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  39.26 
 
 
179 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  39.26 
 
 
179 aa  89.7  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  39.26 
 
 
179 aa  89.7  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  39.26 
 
 
179 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  39.26 
 
 
179 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  39.26 
 
 
179 aa  89.7  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  39.26 
 
 
179 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  39.26 
 
 
179 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  36.31 
 
 
196 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  36.31 
 
 
196 aa  89  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  36.87 
 
 
196 aa  89  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  36.87 
 
 
196 aa  89  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  36.31 
 
 
196 aa  89  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  36.31 
 
 
196 aa  88.6  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 
179 aa  88.6  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  39.26 
 
 
179 aa  89  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  34.83 
 
 
179 aa  88.6  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
204 aa  88.2  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  35.47 
 
 
185 aa  87.8  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  29.65 
 
 
180 aa  87.4  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1572  NUDIX hydrolase  44.72 
 
 
179 aa  87  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  37.57 
 
 
194 aa  87  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  34.17 
 
 
196 aa  86.3  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2199  NUDIX hydrolase  42.61 
 
 
203 aa  85.5  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  44.07 
 
 
184 aa  85.9  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2896  NUDIX hydrolase  31.79 
 
 
166 aa  85.5  6e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  31.79 
 
 
182 aa  84.7  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  43.51 
 
 
180 aa  84.7  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  40.46 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  33.92 
 
 
180 aa  84  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  33.92 
 
 
180 aa  84  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  42.61 
 
 
205 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1677  NUDIX hydrolase  29.35 
 
 
192 aa  82.8  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.855535  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3586  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  40.52 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1814  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.13 
 
 
196 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1305  NUDIX family hydrolase  39.13 
 
 
196 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9435  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0722  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.13 
 
 
196 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>