More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_22070 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_22070  NTP pyrophosphohydrolase  100 
 
 
219 aa  422  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1133  NUDIX hydrolase  70.24 
 
 
225 aa  266  1e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2348  NUDIX hydrolase  63.73 
 
 
210 aa  223  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00912328  normal  0.0106592 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3140  NUDIX hydrolase  57.5 
 
 
225 aa  222  4e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511935  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1520  NUDIX hydrolase  57.21 
 
 
220 aa  215  5e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234445  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1519  NUDIX hydrolase  56.72 
 
 
220 aa  212  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000389624 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1665  NUDIX hydrolase  63.35 
 
 
203 aa  208  7e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0528877  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1348  NUDIX hydrolase  64.52 
 
 
217 aa  201  5e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.841772  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14200  NUDIX family protein  50.22 
 
 
235 aa  197  7.999999999999999e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0659704  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1242  NUDIX hydrolase  53.92 
 
 
216 aa  185  4e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.141201  normal  0.571829 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  50.96 
 
 
212 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2991  NUDIX hydrolase  57.14 
 
 
208 aa  177  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  53.55 
 
 
201 aa  175  5e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  55.19 
 
 
201 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13740  NTP pyrophosphohydrolase  49.52 
 
 
215 aa  160  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  48.24 
 
 
209 aa  155  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  48.45 
 
 
208 aa  155  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  47.74 
 
 
209 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  47.74 
 
 
209 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1755  NUDIX hydrolase  48.97 
 
 
207 aa  150  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0106102  hitchhiker  0.000762275 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  50.26 
 
 
199 aa  150  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  46.19 
 
 
207 aa  149  5e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4431  NUDIX hydrolase  51.69 
 
 
188 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.212401  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3156  NUDIX hydrolase  48.45 
 
 
207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.38817  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2835  NUDIX hydrolase  57.69 
 
 
210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0310181  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  49.48 
 
 
211 aa  145  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1200  hypothetical protein  51.96 
 
 
207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.552549  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  43.14 
 
 
215 aa  135  6.0000000000000005e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  44.39 
 
 
211 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  48.37 
 
 
210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0970  NUDIX hydrolase  53.12 
 
 
220 aa  132  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12410  NUDIX family protein  51.31 
 
 
227 aa  132  6e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.274172  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  45.21 
 
 
210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4063  NUDIX hydrolase  45.37 
 
 
228 aa  126  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0818284  normal  0.284545 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  46.04 
 
 
213 aa  126  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  42.2 
 
 
178 aa  124  8.000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  38.73 
 
 
177 aa  109  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
177 aa  108  6e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  37.79 
 
 
180 aa  105  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
176 aa  105  5e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  35.26 
 
 
180 aa  105  7e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  33.53 
 
 
179 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  36.53 
 
 
184 aa  102  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  33.13 
 
 
177 aa  98.6  7e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 
178 aa  95.1  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2486  NUDIX hydrolase  44.22 
 
 
193 aa  94.7  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.253943  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
172 aa  92.8  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  32.75 
 
 
176 aa  92  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 
182 aa  91.7  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  30.89 
 
 
179 aa  89.4  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  30.89 
 
 
179 aa  89.4  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  39.52 
 
 
184 aa  89.4  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  29.8 
 
 
192 aa  89.4  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  30.37 
 
 
179 aa  89  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  30.37 
 
 
179 aa  89  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  30.37 
 
 
179 aa  89  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  30.37 
 
 
179 aa  89  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  30.37 
 
 
179 aa  89  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 
281 aa  88.6  6e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  30.37 
 
 
179 aa  89  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  30.37 
 
 
179 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  29.84 
 
 
179 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  30.37 
 
 
179 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  35.14 
 
 
185 aa  86.3  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
204 aa  85.5  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2209  NUDIX hydrolase  38.3 
 
 
184 aa  85.1  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.022301  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 
176 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 
186 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  33.57 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  32 
 
 
199 aa  84  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 
211 aa  84  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  34.22 
 
 
205 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3089  NUDIX hydrolase  42.18 
 
 
177 aa  83.2  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1515  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 
208 aa  82.4  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  28.57 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  35.76 
 
 
199 aa  82  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  32.78 
 
 
194 aa  82  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 
183 aa  82  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1134  NUDIX hydrolase  36 
 
 
200 aa  80.9  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  28.07 
 
 
183 aa  81.3  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  33.7 
 
 
204 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  32.57 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  31.96 
 
 
190 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  34.05 
 
 
194 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
178 aa  79.7  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1418  ADP-ribose pyrophosphatase  35.06 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.656759  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 
175 aa  79.3  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0227  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
185 aa  79  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.282406  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  32.78 
 
 
196 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 
175 aa  78.2  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2199  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 
203 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 
179 aa  77.4  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  33.51 
 
 
194 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  32.22 
 
 
196 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  32.22 
 
 
196 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1439  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1886  NUDIX hydrolase  35.33 
 
 
172 aa  76.3  0.0000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.556059 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  35.06 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>