More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1134 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1134  NUDIX hydrolase  100 
 
 
200 aa  387  1e-107  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  39.86 
 
 
179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  39.86 
 
 
179 aa  109  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  39.16 
 
 
179 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  39.16 
 
 
179 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  39.16 
 
 
179 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  39.16 
 
 
179 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  39.16 
 
 
179 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  39.16 
 
 
179 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  38.46 
 
 
179 aa  107  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  43.12 
 
 
281 aa  107  1e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  39.16 
 
 
179 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  35.33 
 
 
177 aa  105  5e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  39.73 
 
 
182 aa  103  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  43.51 
 
 
189 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
179 aa  102  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3089  NUDIX hydrolase  45.95 
 
 
177 aa  100  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  40.4 
 
 
178 aa  100  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 
201 aa  100  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  36.24 
 
 
183 aa  100  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 
186 aa  99.4  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  44.67 
 
 
177 aa  99.4  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  40.25 
 
 
194 aa  99  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  41.26 
 
 
186 aa  98.6  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  42 
 
 
180 aa  97.8  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 
201 aa  97.8  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  40.79 
 
 
180 aa  97.4  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  35.22 
 
 
180 aa  97.1  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
173 aa  96.7  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1418  ADP-ribose pyrophosphatase  41.67 
 
 
207 aa  96.3  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.656759  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  42.58 
 
 
211 aa  95.9  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  37.75 
 
 
177 aa  95.5  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  36.91 
 
 
176 aa  95.5  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  34.18 
 
 
183 aa  95.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  34.18 
 
 
183 aa  95.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 
184 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  41.61 
 
 
199 aa  93.2  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  36.91 
 
 
214 aa  93.6  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 
184 aa  92.8  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  29.22 
 
 
176 aa  92  5e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  34 
 
 
180 aa  92  5e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2348  NUDIX hydrolase  39.64 
 
 
210 aa  92  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00912328  normal  0.0106592 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  30.54 
 
 
187 aa  91.7  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  30.54 
 
 
187 aa  91.7  7e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 
179 aa  91.7  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  33.75 
 
 
182 aa  91.3  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  35.57 
 
 
171 aa  91.3  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  33.33 
 
 
176 aa  91.3  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  33.33 
 
 
176 aa  90.9  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 
195 aa  90.5  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  38.62 
 
 
184 aa  90.9  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3354  mutT/nudix family protein  44.23 
 
 
173 aa  90.1  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1652  NUDIX hydrolase  35.97 
 
 
186 aa  89.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.568517  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0176  NUDIX hydrolase  41.3 
 
 
173 aa  90.5  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0982781  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0268  NUDIX hydrolase  35.03 
 
 
165 aa  89.7  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.880251  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  31.33 
 
 
184 aa  90.5  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  44.3 
 
 
211 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2486  NUDIX hydrolase  42.57 
 
 
193 aa  90.1  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.253943  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2834  NUDIX hydrolase  35.46 
 
 
169 aa  89.7  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03661  NUDIX hydrolase  35.97 
 
 
186 aa  89  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 
183 aa  89  4e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0238  NUDIX hydrolase  38.36 
 
 
186 aa  89.4  4e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 
172 aa  88.6  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0237  NUDIX hydrolase  35 
 
 
183 aa  88.6  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373824  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  29.94 
 
 
187 aa  88.2  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  35.62 
 
 
179 aa  88.2  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  35.21 
 
 
180 aa  87  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03121  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
189 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0600  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 
183 aa  87.4  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  38.99 
 
 
215 aa  87.4  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25181  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 
189 aa  87  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 
209 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0433  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
176 aa  87  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00447599  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 
209 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  40.43 
 
 
173 aa  86.3  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 
178 aa  86.3  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  36 
 
 
185 aa  85.9  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  34.46 
 
 
179 aa  85.5  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  32.87 
 
 
180 aa  85.1  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  32.87 
 
 
180 aa  85.1  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  32.87 
 
 
187 aa  85.1  6e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0212  NUDIX hydrolase  36.6 
 
 
186 aa  85.1  7e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.465676  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  39.72 
 
 
173 aa  85.1  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  36.69 
 
 
175 aa  84.7  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  36 
 
 
185 aa  84.7  9e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 
209 aa  84.7  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1519  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
220 aa  84.3  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000389624 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0524  ADP-ribose diphosphatase NudE  38.69 
 
 
192 aa  84.3  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2271  ADP-ribose pyrophosphatase  35 
 
 
183 aa  83.6  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0456  MutT/nudix family protein  36.43 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0404799  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1515  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
208 aa  82.8  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0740  NTP pyrophosphohydrolase including oxidative damage repair enzyme  31.65 
 
 
199 aa  82.4  0.000000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000988568  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2991  NUDIX hydrolase  40.85 
 
 
208 aa  82.4  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  38.73 
 
 
207 aa  82  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1429  NUDIX hydrolase  39.16 
 
 
176 aa  82  0.000000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.742876  normal  0.0486947 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1520  NUDIX hydrolase  36.88 
 
 
220 aa  81.6  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234445  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  38.1 
 
 
210 aa  81.6  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3140  NUDIX hydrolase  34.83 
 
 
225 aa  81.6  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511935  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1886  NUDIX hydrolase  40 
 
 
172 aa  81.3  0.000000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.556059 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  35.67 
 
 
212 aa  81.3  0.000000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>