More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1488 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  100 
 
 
212 aa  427  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2991  NUDIX hydrolase  69.65 
 
 
208 aa  256  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2835  NUDIX hydrolase  63.64 
 
 
210 aa  237  9e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0310181  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  53.73 
 
 
208 aa  205  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1200  hypothetical protein  55.28 
 
 
207 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.552549  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1242  NUDIX hydrolase  52.38 
 
 
216 aa  188  4e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.141201  normal  0.571829 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  50.26 
 
 
199 aa  180  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0970  NUDIX hydrolase  54 
 
 
220 aa  176  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  50.51 
 
 
201 aa  175  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  50.52 
 
 
210 aa  174  6e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  52.06 
 
 
211 aa  171  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1755  NUDIX hydrolase  53.85 
 
 
207 aa  171  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0106102  hitchhiker  0.000762275 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22070  NTP pyrophosphohydrolase  50.96 
 
 
219 aa  170  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1133  NUDIX hydrolase  48.24 
 
 
225 aa  169  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  49.25 
 
 
209 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  50.77 
 
 
211 aa  168  7e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  49.75 
 
 
201 aa  167  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1520  NUDIX hydrolase  45.71 
 
 
220 aa  167  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234445  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  48.74 
 
 
209 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  48.74 
 
 
209 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3156  NUDIX hydrolase  52.6 
 
 
207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.38817  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1519  NUDIX hydrolase  46.27 
 
 
220 aa  165  5e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000389624 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3140  NUDIX hydrolase  47.24 
 
 
225 aa  161  7e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511935  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2348  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 
210 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00912328  normal  0.0106592 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4063  NUDIX hydrolase  50 
 
 
228 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0818284  normal  0.284545 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  45.96 
 
 
215 aa  159  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  44.9 
 
 
207 aa  159  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13740  NTP pyrophosphohydrolase  49.22 
 
 
215 aa  154  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14200  NUDIX family protein  49.4 
 
 
235 aa  152  4e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0659704  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1665  NUDIX hydrolase  50.81 
 
 
203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0528877  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1348  NUDIX hydrolase  52.43 
 
 
217 aa  146  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.841772  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  45.65 
 
 
210 aa  144  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4431  NUDIX hydrolase  48.66 
 
 
188 aa  142  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.212401  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  46.06 
 
 
213 aa  138  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
180 aa  133  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 
184 aa  132  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  38.86 
 
 
178 aa  131  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 
177 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  39.55 
 
 
178 aa  127  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 
177 aa  122  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  37.79 
 
 
177 aa  121  9e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 
179 aa  119  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  33.53 
 
 
187 aa  117  9e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 
180 aa  115  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  35.06 
 
 
176 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 
183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 
281 aa  111  7.000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  33.13 
 
 
176 aa  111  9e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12410  NUDIX family protein  47.59 
 
 
227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.274172  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  35.06 
 
 
172 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  34.64 
 
 
179 aa  109  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  38.41 
 
 
185 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  37.16 
 
 
192 aa  108  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2486  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
193 aa  108  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.253943  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 
190 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  33.52 
 
 
180 aa  107  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  36.99 
 
 
180 aa  106  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 
186 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
184 aa  105  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  34.32 
 
 
179 aa  105  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 
182 aa  105  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  34.32 
 
 
179 aa  105  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  34.32 
 
 
179 aa  104  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  34.32 
 
 
179 aa  104  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  34.32 
 
 
179 aa  104  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  34.32 
 
 
179 aa  104  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  34.32 
 
 
179 aa  104  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  34.32 
 
 
179 aa  104  9e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  34.32 
 
 
179 aa  104  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  34.32 
 
 
179 aa  103  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  36.05 
 
 
171 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  34.32 
 
 
179 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  33.74 
 
 
180 aa  103  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  33.74 
 
 
180 aa  103  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  41.43 
 
 
175 aa  103  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 
186 aa  102  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
179 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  39.33 
 
 
194 aa  99  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  31.79 
 
 
199 aa  98.2  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  34.97 
 
 
205 aa  97.4  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2771  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 
192 aa  97.4  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  32.53 
 
 
176 aa  97.1  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 
184 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 
199 aa  97.1  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3089  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 
177 aa  95.9  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  38.55 
 
 
194 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1876  NUDIX hydrolase  37.42 
 
 
203 aa  95.9  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.48572 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2199  NUDIX hydrolase  34.25 
 
 
203 aa  95.9  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  36.31 
 
 
196 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 
196 aa  93.6  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  36.31 
 
 
196 aa  93.2  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  36.31 
 
 
196 aa  92.8  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 
196 aa  92.8  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  41.8 
 
 
211 aa  92.4  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  33.94 
 
 
176 aa  92.4  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  26.51 
 
 
183 aa  92  5e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  35.75 
 
 
196 aa  92  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  35.75 
 
 
196 aa  92  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03661  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 
186 aa  92  6e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 
187 aa  91.7  7e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>