More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3140 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3140  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 225 aa  435  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511935  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1520  NUDIX hydrolase  56.93 
 
 		 220 aa  209  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234445  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22070  NTP pyrophosphohydrolase  57.5 
 
 		 219 aa  209  3e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1133  NUDIX hydrolase  52.34 
 
 		 225 aa  201  8e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1519  NUDIX hydrolase  52.97 
 
 		 220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000389624 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2348  NUDIX hydrolase  55.26 
 
 		 210 aa  195  4.0000000000000005e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00912328  normal  0.0106592 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14200  NUDIX family protein  47.62 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0659704  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1665  NUDIX hydrolase  53.65 
 
 		 203 aa  170  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0528877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  50.26 
 
 		 208 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  51.09 
 
 		 201 aa  170  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1242  NUDIX hydrolase  52.24 
 
 		 216 aa  170  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.141201  normal  0.571829 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  51.63 
 
 		 201 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  49.21 
 
 		 209 aa  164  9e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  49.21 
 
 		 209 aa  164  9e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  48.69 
 
 		 209 aa  161  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  47.24 
 
 		 212 aa  161  8.000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  46.07 
 
 		 199 aa  158  8e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1348  NUDIX hydrolase  53.17 
 
 		 217 aa  156  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.841772  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2991  NUDIX hydrolase  48.04 
 
 		 208 aa  152  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13740  NTP pyrophosphohydrolase  45.97 
 
 		 215 aa  146  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3156  NUDIX hydrolase  47.09 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.38817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1755  NUDIX hydrolase  47.09 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0106102  hitchhiker  0.000762275 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  51.81 
 
 		 210 aa  143  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  43.92 
 
 		 207 aa  141  9e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  45.13 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  42.29 
 
 		 215 aa  137  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  42.49 
 
 		 211 aa  136  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2835  NUDIX hydrolase  54.49 
 
 		 210 aa  134  8e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0310181  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  40.59 
 
 		 178 aa  134  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  44.95 
 
 		 210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1200  hypothetical protein  52.5 
 
 		 207 aa  126  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.552549  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  43.6 
 
 		 213 aa  125  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4431  NUDIX hydrolase  46.55 
 
 		 188 aa  125  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.212401  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0970  NUDIX hydrolase  49.28 
 
 		 220 aa  122  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4063  NUDIX hydrolase  42.79 
 
 		 228 aa  119  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0818284  normal  0.284545 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12410  NUDIX family protein  45.89 
 
 		 227 aa  119  3e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.274172  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  38.76 
 
 		 177 aa  112  4.0000000000000004e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  39.34 
 
 		 281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  39.6 
 
 		 176 aa  107  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 180 aa  106  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  35.91 
 
 		 185 aa  106  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  34.76 
 
 		 177 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 177 aa  102  4e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  29.07 
 
 		 180 aa  101  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  32.95 
 
 		 182 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  33.72 
 
 		 184 aa  100  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  34.39 
 
 		 192 aa  99.8  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1515  NUDIX hydrolase  35.75 
 
 		 208 aa  99.8  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  39.18 
 
 		 180 aa  99  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 		 178 aa  99  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1418  ADP-ribose pyrophosphatase  38.33 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.656759  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  34.64 
 
 		 194 aa  97.8  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 		 204 aa  97.1  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3089  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 		 177 aa  95.5  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 		 179 aa  95.5  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2486  NUDIX hydrolase  43.26 
 
 		 193 aa  94.7  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.253943  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 183 aa  94.7  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1814  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.64 
 
 		 196 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0722  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.64 
 
 		 196 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 		 172 aa  93.6  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0428  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.64 
 
 		 196 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1314  NUDIX family hydrolase  35.64 
 
 		 196 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.861294  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1305  NUDIX family hydrolase  35.64 
 
 		 196 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9435  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1145  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.64 
 
 		 196 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107087  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  31.79 
 
 		 175 aa  93.2  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1439  NUDIX hydrolase  37.85 
 
 		 204 aa  93.2  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1451  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.11 
 
 		 196 aa  92.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0600  NUDIX hydrolase  31.15 
 
 		 183 aa  92  6e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1076  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.11 
 
 		 196 aa  91.7  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  32.78 
 
 		 186 aa  91.7  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  30.99 
 
 		 180 aa  90.9  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  33.51 
 
 		 196 aa  90.9  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  32 
 
 		 176 aa  90.9  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 189 aa  91.3  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  33.7 
 
 		 190 aa  90.9  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  32.77 
 
 		 179 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  34.22 
 
 		 194 aa  90.1  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 		 186 aa  90.1  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 		 179 aa  90.5  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  28.99 
 
 		 187 aa  90.9  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  33.16 
 
 		 196 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  33.51 
 
 		 196 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  32.77 
 
 		 179 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  33.51 
 
 		 196 aa  89.7  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  33.69 
 
 		 199 aa  89  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  32.77 
 
 		 179 aa  88.6  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  32.77 
 
 		 179 aa  88.6  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  32.77 
 
 		 179 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  32.77 
 
 		 179 aa  88.6  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  32.77 
 
 		 179 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  32.77 
 
 		 179 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  33.95 
 
 		 184 aa  88.2  9e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 		 194 aa  88.2  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  33.51 
 
 		 196 aa  88.2  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 		 180 aa  87.8  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  32.98 
 
 		 196 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  31.84 
 
 		 199 aa  87.8  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  32.98 
 
 		 196 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  31.64 
 
 		 179 aa  87.8  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  32.98 
 
 		 196 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>