More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1133 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1133  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 225 aa  445  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22070  NTP pyrophosphohydrolase  70.24 
 
 		 219 aa  256  3e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1519  NUDIX hydrolase  58.14 
 
 		 220 aa  231  9e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000389624 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2348  NUDIX hydrolase  60.61 
 
 		 210 aa  221  9e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00912328  normal  0.0106592 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1348  NUDIX hydrolase  65.85 
 
 		 217 aa  217  1e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.841772  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1520  NUDIX hydrolase  54.63 
 
 		 220 aa  215  4e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234445  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3140  NUDIX hydrolase  52.34 
 
 		 225 aa  204  8e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511935  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14200  NUDIX family protein  50.23 
 
 		 235 aa  199  3e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0659704  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1242  NUDIX hydrolase  54.23 
 
 		 216 aa  193  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.141201  normal  0.571829 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1665  NUDIX hydrolase  58.97 
 
 		 203 aa  190  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0528877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  54.64 
 
 		 201 aa  188  7e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  54.64 
 
 		 201 aa  178  7e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  49.75 
 
 		 208 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  48.24 
 
 		 212 aa  174  9e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13740  NTP pyrophosphohydrolase  49.05 
 
 		 215 aa  167  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2991  NUDIX hydrolase  51.76 
 
 		 208 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3156  NUDIX hydrolase  48.7 
 
 		 207 aa  154  9e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.38817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  47.09 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2835  NUDIX hydrolase  57.32 
 
 		 210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0310181  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1755  NUDIX hydrolase  47.67 
 
 		 207 aa  151  8.999999999999999e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0106102  hitchhiker  0.000762275 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1200  hypothetical protein  50 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.552549  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  45.18 
 
 		 199 aa  149  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  47.18 
 
 		 209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  47.18 
 
 		 209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  47.18 
 
 		 209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  45.62 
 
 		 210 aa  144  9e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0970  NUDIX hydrolase  48.37 
 
 		 220 aa  141  7e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  46.03 
 
 		 211 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  45.26 
 
 		 210 aa  139  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4431  NUDIX hydrolase  48.02 
 
 		 188 aa  139  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.212401  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  43.68 
 
 		 215 aa  137  8.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  42.33 
 
 		 211 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12410  NUDIX family protein  47.09 
 
 		 227 aa  129  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.274172  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4063  NUDIX hydrolase  42.93 
 
 		 228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0818284  normal  0.284545 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  39.23 
 
 		 178 aa  122  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  44.22 
 
 		 213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  36.78 
 
 		 172 aa  111  9e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  36.31 
 
 		 177 aa  109  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  35.33 
 
 		 180 aa  109  3e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  34.94 
 
 		 176 aa  109  4.0000000000000004e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 		 178 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 		 177 aa  104  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2486  NUDIX hydrolase  42.76 
 
 		 193 aa  102  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.253943  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  37.95 
 
 		 177 aa  101  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  33.52 
 
 		 179 aa  101  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  36.31 
 
 		 180 aa  101  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  31.03 
 
 		 187 aa  101  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  32.95 
 
 		 185 aa  95.9  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  37.24 
 
 		 182 aa  94.7  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 		 281 aa  93.2  3e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 		 184 aa  93.2  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 		 204 aa  92  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  32.16 
 
 		 180 aa  92.4  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  32.76 
 
 		 176 aa  91.7  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  42.4 
 
 		 180 aa  91.7  9e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 		 183 aa  89.7  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  32.45 
 
 		 199 aa  89.7  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  31.64 
 
 		 186 aa  90.1  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 		 175 aa  89  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  32.18 
 
 		 179 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 		 176 aa  88.2  9e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  31.84 
 
 		 179 aa  88.2  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 186 aa  88.2  9e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  31.64 
 
 		 194 aa  87.8  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  31.84 
 
 		 179 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  31.84 
 
 		 179 aa  87  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  31.84 
 
 		 179 aa  87  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  33.13 
 
 		 179 aa  87.4  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  31.84 
 
 		 179 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  31.84 
 
 		 179 aa  87  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  31.84 
 
 		 179 aa  87  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1886  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 172 aa  87.4  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.556059 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  31.84 
 
 		 179 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 173 aa  85.9  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 173 aa  85.9  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 173 aa  85.9  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 		 184 aa  85.9  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  32.53 
 
 		 180 aa  85.5  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3089  NUDIX hydrolase  45.61 
 
 		 177 aa  85.5  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  32.53 
 
 		 180 aa  85.5  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  32.18 
 
 		 179 aa  85.5  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 		 179 aa  85.1  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  31.28 
 
 		 179 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  32.16 
 
 		 196 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  32.94 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  31.66 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  31.66 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  31.66 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  31.16 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1418  ADP-ribose pyrophosphatase  31.25 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.656759  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  30.34 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2078  NUDIX family hydrolase  29.89 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  31.33 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  31.16 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1336  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 171 aa  80.9  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.723792 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  31.16 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1429  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.742876  normal  0.0486947 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  30.51 
 
 		 199 aa  80.5  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1439  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>