More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4431 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4431  NUDIX hydrolase  100 
 
 
188 aa  381  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.212401  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  57.14 
 
 
201 aa  193  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  54.97 
 
 
201 aa  182  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1348  NUDIX hydrolase  58.79 
 
 
217 aa  165  4e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.841772  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  50.57 
 
 
212 aa  162  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  47.85 
 
 
209 aa  159  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22070  NTP pyrophosphohydrolase  53.37 
 
 
219 aa  156  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2348  NUDIX hydrolase  50 
 
 
210 aa  156  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00912328  normal  0.0106592 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  47.31 
 
 
209 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  47.31 
 
 
209 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  47.28 
 
 
199 aa  154  7e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1520  NUDIX hydrolase  50 
 
 
220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234445  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1519  NUDIX hydrolase  49.4 
 
 
220 aa  151  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000389624 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1133  NUDIX hydrolase  48.02 
 
 
225 aa  150  8e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  49.16 
 
 
211 aa  149  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  47.16 
 
 
210 aa  148  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1755  NUDIX hydrolase  48.89 
 
 
207 aa  148  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0106102  hitchhiker  0.000762275 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  47.31 
 
 
211 aa  147  6e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  46.59 
 
 
210 aa  144  8.000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2991  NUDIX hydrolase  48.55 
 
 
208 aa  143  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14200  NUDIX family protein  42.86 
 
 
235 aa  142  3e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0659704  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1200  hypothetical protein  50.85 
 
 
207 aa  141  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.552549  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3140  NUDIX hydrolase  46.55 
 
 
225 aa  141  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511935  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  43.18 
 
 
207 aa  138  4.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3156  NUDIX hydrolase  45.95 
 
 
207 aa  137  7e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.38817  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1665  NUDIX hydrolase  49.72 
 
 
203 aa  137  7e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0528877  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  47.59 
 
 
213 aa  137  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13740  NTP pyrophosphohydrolase  46.47 
 
 
215 aa  137  8.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  44.02 
 
 
208 aa  133  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  41.11 
 
 
215 aa  134  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2835  NUDIX hydrolase  46.59 
 
 
210 aa  131  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0310181  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1242  NUDIX hydrolase  43.45 
 
 
216 aa  129  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.141201  normal  0.571829 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4063  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 
228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0818284  normal  0.284545 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  38.29 
 
 
180 aa  125  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0970  NUDIX hydrolase  48.86 
 
 
220 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 
177 aa  122  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 
179 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  36.78 
 
 
178 aa  112  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 
178 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  33.15 
 
 
180 aa  107  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  35.5 
 
 
176 aa  106  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  35.68 
 
 
180 aa  105  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  32.04 
 
 
182 aa  104  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
177 aa  104  9e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  41.32 
 
 
194 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 
179 aa  102  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 
176 aa  102  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 
183 aa  102  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  39.55 
 
 
189 aa  101  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  36.16 
 
 
281 aa  98.2  6e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 
184 aa  97.8  8e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
180 aa  97.1  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  43.44 
 
 
184 aa  97.4  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1886  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 
172 aa  96.7  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.556059 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 
169 aa  95.5  4e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
179 aa  95.1  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  31.52 
 
 
186 aa  94  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  37.13 
 
 
180 aa  93.2  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2486  NUDIX hydrolase  39.43 
 
 
193 aa  92.8  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.253943  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 
177 aa  92.8  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 
199 aa  92.8  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  34.42 
 
 
176 aa  92  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0456  MutT/nudix family protein  32.95 
 
 
176 aa  92  5e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0404799  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  30.46 
 
 
176 aa  91.3  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  36.47 
 
 
199 aa  91.3  8e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2896  NUDIX hydrolase  31.95 
 
 
166 aa  90.5  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 
199 aa  90.5  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 
192 aa  90.9  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  30.23 
 
 
176 aa  89.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1429  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 
176 aa  90.1  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.742876  normal  0.0486947 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_398  MutT/nudix, ADP-ribose pyrophosphatase  32.37 
 
 
176 aa  89.4  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.148699  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  33.97 
 
 
178 aa  88.2  6e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12410  NUDIX family protein  41.24 
 
 
227 aa  87.8  7e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.274172  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1134  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 
200 aa  88.2  7e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  34.68 
 
 
185 aa  87  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0830  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 
177 aa  87.4  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.66661  normal  0.255619 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  33.72 
 
 
186 aa  86.7  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  30.73 
 
 
187 aa  86.7  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  27.33 
 
 
183 aa  86.7  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0433  NUDIX hydrolase  31.79 
 
 
176 aa  86.3  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00447599  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  29.34 
 
 
187 aa  85.9  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  30.17 
 
 
187 aa  85.1  6e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
172 aa  84.3  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1572  NUDIX hydrolase  34.73 
 
 
179 aa  83.6  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3089  NUDIX hydrolase  34.44 
 
 
177 aa  83.2  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1418  ADP-ribose pyrophosphatase  35.06 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.656759  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4021  NUDIX hydrolase  32.24 
 
 
181 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4251  NUDIX hydrolase  32.24 
 
 
181 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.0489284 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4096  NUDIX hydrolase  32.24 
 
 
181 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.196207  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6125  NUDIX hydrolase  34.12 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1507  NUDIX hydrolase  36.16 
 
 
201 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.694951  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1515  NUDIX hydrolase  34.66 
 
 
208 aa  82.4  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2078  NUDIX family hydrolase  33.88 
 
 
194 aa  82.4  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1439  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 
204 aa  82  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  37.19 
 
 
190 aa  81.6  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  29.34 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  29.61 
 
 
187 aa  81.6  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  29.34 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  33.7 
 
 
196 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  33.7 
 
 
196 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>