More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3156 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3156  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 207 aa  407  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.38817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1755  NUDIX hydrolase  75.85 
 
 		 207 aa  286  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0106102  hitchhiker  0.000762275 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  55 
 
 		 201 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  51.5 
 
 		 208 aa  186  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  52.6 
 
 		 212 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2835  NUDIX hydrolase  54.55 
 
 		 210 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0310181  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  49.49 
 
 		 211 aa  181  8.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  52.5 
 
 		 201 aa  175  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2991  NUDIX hydrolase  53.06 
 
 		 208 aa  174  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1519  NUDIX hydrolase  49.02 
 
 		 220 aa  173  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000389624 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  47.03 
 
 		 211 aa  171  5.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  47.47 
 
 		 207 aa  171  9e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  46 
 
 		 209 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  46 
 
 		 209 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  45.5 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2348  NUDIX hydrolase  49.21 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00912328  normal  0.0106592 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  47.18 
 
 		 199 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1133  NUDIX hydrolase  48.7 
 
 		 225 aa  164  5.9999999999999996e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  48.04 
 
 		 210 aa  162  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  49.5 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4063  NUDIX hydrolase  47.14 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0818284  normal  0.284545 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1520  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 220 aa  159  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234445  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3140  NUDIX hydrolase  47.09 
 
 		 225 aa  159  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511935  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1242  NUDIX hydrolase  49.46 
 
 		 216 aa  158  6e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.141201  normal  0.571829 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22070  NTP pyrophosphohydrolase  48.45 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  46.23 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  47.74 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14200  NUDIX family protein  41.79 
 
 		 235 aa  143  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0659704  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1348  NUDIX hydrolase  51.53 
 
 		 217 aa  142  5e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.841772  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13740  NTP pyrophosphohydrolase  47.37 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4431  NUDIX hydrolase  45.95 
 
 		 188 aa  137  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.212401  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1665  NUDIX hydrolase  46.35 
 
 		 203 aa  131  6e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0528877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1200  hypothetical protein  45.13 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.552549  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2486  NUDIX hydrolase  43.01 
 
 		 193 aa  122  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.253943  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  39.88 
 
 		 183 aa  121  6e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 		 177 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  38.07 
 
 		 178 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  39.52 
 
 		 182 aa  119  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  33.52 
 
 		 180 aa  117  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  37.36 
 
 		 178 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  37.99 
 
 		 184 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  36.31 
 
 		 176 aa  114  6.9999999999999995e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 177 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 		 180 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 		 172 aa  111  9e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 		 180 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  32.6 
 
 		 179 aa  109  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  39.77 
 
 		 177 aa  108  6e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0970  NUDIX hydrolase  39.59 
 
 		 220 aa  108  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  38.73 
 
 		 281 aa  104  9e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1076  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.43 
 
 		 196 aa  104  9e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  41.38 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1451  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.31 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 		 179 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 179 aa  103  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0722  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.31 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1814  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.31 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1305  NUDIX family hydrolase  39.31 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9435  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  39.32 
 
 		 179 aa  102  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0428  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.31 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1314  NUDIX family hydrolase  39.31 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.861294  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1145  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.31 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107087  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 		 176 aa  102  5e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  36.56 
 
 		 196 aa  101  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  41.38 
 
 		 179 aa  101  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  41.38 
 
 		 179 aa  101  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  41.38 
 
 		 179 aa  101  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  41.38 
 
 		 179 aa  101  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  41.38 
 
 		 179 aa  101  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  41.38 
 
 		 179 aa  101  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  41.38 
 
 		 179 aa  101  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 196 aa  101  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  39.88 
 
 		 196 aa  101  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  39.88 
 
 		 196 aa  101  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3089  NUDIX hydrolase  40.78 
 
 		 177 aa  100  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  41.38 
 
 		 179 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  38.69 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  38.69 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  35.15 
 
 		 180 aa  99.8  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  35.15 
 
 		 180 aa  99.8  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 190 aa  99.4  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  37.13 
 
 		 175 aa  98.6  6e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12410  NUDIX family protein  41.43 
 
 		 227 aa  98.2  7e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.274172  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  38.37 
 
 		 196 aa  98.2  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  39.29 
 
 		 194 aa  98.2  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1418  ADP-ribose pyrophosphatase  34.95 
 
 		 207 aa  97.8  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.656759  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  34.52 
 
 		 185 aa  97.4  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  32.72 
 
 		 186 aa  96.3  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 		 180 aa  94.7  8e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 194 aa  94.7  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  31.29 
 
 		 175 aa  94.4  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 186 aa  94  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  31.29 
 
 		 176 aa  92.4  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1572  NUDIX hydrolase  43.65 
 
 		 179 aa  91.7  7e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  37.82 
 
 		 180 aa  90.5  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  40.5 
 
 		 205 aa  90.5  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 173 aa  90.1  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  32.07 
 
 		 192 aa  90.1  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  30.86 
 
 		 176 aa  90.1  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>