More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1348 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1348  NUDIX hydrolase  100 
 
 
217 aa  413  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.841772  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1133  NUDIX hydrolase  65.85 
 
 
225 aa  249  3e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22070  NTP pyrophosphohydrolase  64.52 
 
 
219 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1519  NUDIX hydrolase  60.1 
 
 
220 aa  222  4e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000389624 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2348  NUDIX hydrolase  60 
 
 
210 aa  222  4e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00912328  normal  0.0106592 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1520  NUDIX hydrolase  61.19 
 
 
220 aa  219  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234445  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  56.7 
 
 
201 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  58.85 
 
 
201 aa  194  9e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14200  NUDIX family protein  53.55 
 
 
235 aa  194  1e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0659704  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3140  NUDIX hydrolase  53.17 
 
 
225 aa  190  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511935  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1665  NUDIX hydrolase  63.07 
 
 
203 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0528877  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  52.46 
 
 
212 aa  179  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1242  NUDIX hydrolase  51.76 
 
 
216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.141201  normal  0.571829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4431  NUDIX hydrolase  57.63 
 
 
188 aa  170  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.212401  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2991  NUDIX hydrolase  52.38 
 
 
208 aa  164  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2835  NUDIX hydrolase  55.85 
 
 
210 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0310181  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1755  NUDIX hydrolase  53.72 
 
 
207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0106102  hitchhiker  0.000762275 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  48.92 
 
 
210 aa  155  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3156  NUDIX hydrolase  51.53 
 
 
207 aa  155  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.38817  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  47.64 
 
 
209 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  47.83 
 
 
199 aa  153  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  47.12 
 
 
209 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  47.12 
 
 
209 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  49.2 
 
 
208 aa  151  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  49.21 
 
 
215 aa  151  8.999999999999999e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13740  NTP pyrophosphohydrolase  48.69 
 
 
215 aa  150  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1200  hypothetical protein  53.16 
 
 
207 aa  149  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.552549  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  48.21 
 
 
211 aa  148  5e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 
211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  49.48 
 
 
210 aa  144  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  44.92 
 
 
207 aa  144  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0970  NUDIX hydrolase  50 
 
 
220 aa  136  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4063  NUDIX hydrolase  45.69 
 
 
228 aa  131  7.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0818284  normal  0.284545 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  46.24 
 
 
213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  38.15 
 
 
180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  43.03 
 
 
178 aa  125  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12410  NUDIX family protein  50 
 
 
227 aa  121  8e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.274172  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 
177 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  45.08 
 
 
176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  35.5 
 
 
179 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  37.8 
 
 
176 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  40.7 
 
 
281 aa  109  4.0000000000000004e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  37.97 
 
 
179 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 
178 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 
199 aa  106  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 
177 aa  106  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 
177 aa  105  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 
176 aa  104  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  34.1 
 
 
180 aa  104  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  37.34 
 
 
179 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  37.34 
 
 
179 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  37.34 
 
 
179 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  37.34 
 
 
179 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  37.34 
 
 
179 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  37.34 
 
 
179 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  36.71 
 
 
179 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  39.87 
 
 
184 aa  102  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  43.09 
 
 
180 aa  102  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  46.22 
 
 
180 aa  101  7e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  37.34 
 
 
179 aa  101  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 
184 aa  101  8e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  35.67 
 
 
172 aa  101  9e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  38.76 
 
 
173 aa  101  9e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  37.42 
 
 
179 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  35.67 
 
 
184 aa  99  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 
199 aa  99  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  35.76 
 
 
182 aa  98.2  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 
186 aa  97.8  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  48.31 
 
 
175 aa  97.8  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  32.1 
 
 
187 aa  97.4  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  35.44 
 
 
179 aa  97.4  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1076  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.02 
 
 
196 aa  96.7  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  37.72 
 
 
186 aa  96.7  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2486  NUDIX hydrolase  43.54 
 
 
193 aa  96.3  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.253943  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 
179 aa  95.9  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 
211 aa  95.5  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  35.52 
 
 
205 aa  95.1  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
196 aa  94.7  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1418  ADP-ribose pyrophosphatase  37.36 
 
 
207 aa  94  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.656759  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  37.65 
 
 
180 aa  94  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  34.16 
 
 
204 aa  93.6  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  37.08 
 
 
194 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  35.39 
 
 
204 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1515  NUDIX hydrolase  34.1 
 
 
208 aa  94  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1814  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.99 
 
 
196 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1314  NUDIX family hydrolase  36.99 
 
 
196 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.861294  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1305  NUDIX family hydrolase  36.99 
 
 
196 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9435  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0428  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.99 
 
 
196 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1145  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.99 
 
 
196 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107087  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0722  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.99 
 
 
196 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0604  MutT/nudix family protein  35.96 
 
 
182 aa  92.4  4e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1451  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.42 
 
 
196 aa  92  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2199  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 
203 aa  91.7  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 
196 aa  91.7  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1876  NUDIX hydrolase  34.44 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.48572 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  32.95 
 
 
185 aa  91.3  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  35.84 
 
 
196 aa  91.3  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1439  NUDIX hydrolase  36.99 
 
 
204 aa  90.9  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  34.2 
 
 
196 aa  90.1  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 
196 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>