More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0970 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0970  NUDIX hydrolase  100 
 
 
220 aa  436  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1200  hypothetical protein  70.19 
 
 
207 aa  266  2e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.552549  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  54 
 
 
212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2991  NUDIX hydrolase  52.26 
 
 
208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2835  NUDIX hydrolase  52.43 
 
 
210 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0310181  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  49.51 
 
 
208 aa  169  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1133  NUDIX hydrolase  48.37 
 
 
225 aa  161  8.000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1519  NUDIX hydrolase  48.29 
 
 
220 aa  160  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000389624 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1520  NUDIX hydrolase  47.39 
 
 
220 aa  160  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234445  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1242  NUDIX hydrolase  45.67 
 
 
216 aa  149  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.141201  normal  0.571829 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  47.94 
 
 
201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3140  NUDIX hydrolase  49.28 
 
 
225 aa  146  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511935  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  49.43 
 
 
210 aa  145  6e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  54.11 
 
 
199 aa  144  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1665  NUDIX hydrolase  51.04 
 
 
203 aa  144  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0528877  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2348  NUDIX hydrolase  50.31 
 
 
210 aa  140  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00912328  normal  0.0106592 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  47.76 
 
 
201 aa  136  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22070  NTP pyrophosphohydrolase  53.12 
 
 
219 aa  135  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  47.89 
 
 
209 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1348  NUDIX hydrolase  49.73 
 
 
217 aa  132  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.841772  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 
209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 
209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  43.62 
 
 
207 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13740  NTP pyrophosphohydrolase  47.03 
 
 
215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  48.3 
 
 
211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
210 aa  126  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4431  NUDIX hydrolase  48.88 
 
 
188 aa  124  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.212401  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  45.76 
 
 
211 aa  123  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2486  NUDIX hydrolase  43.98 
 
 
193 aa  122  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.253943  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1755  NUDIX hydrolase  44.1 
 
 
207 aa  121  9e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0106102  hitchhiker  0.000762275 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  48.08 
 
 
213 aa  121  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14200  NUDIX family protein  45.73 
 
 
235 aa  116  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0659704  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4063  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 
228 aa  116  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0818284  normal  0.284545 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  35.67 
 
 
179 aa  112  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  38.67 
 
 
178 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3156  NUDIX hydrolase  39.59 
 
 
207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.38817  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 
177 aa  108  7.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
281 aa  107  1e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  36.18 
 
 
180 aa  105  5e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  37.76 
 
 
184 aa  103  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  40 
 
 
172 aa  103  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  35.86 
 
 
187 aa  103  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12410  NUDIX family protein  46.91 
 
 
227 aa  102  4e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.274172  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  36 
 
 
177 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 
178 aa  101  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 
177 aa  100  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  40.28 
 
 
179 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  42.72 
 
 
176 aa  98.6  7e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  39.22 
 
 
186 aa  97.8  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 
180 aa  97.8  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  47.31 
 
 
187 aa  96.7  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 
180 aa  96.3  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  37.97 
 
 
192 aa  95.9  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  44.55 
 
 
187 aa  95.1  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  44.9 
 
 
187 aa  94.4  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0238  NUDIX hydrolase  51.02 
 
 
186 aa  94.4  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  37.24 
 
 
184 aa  94.4  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  36.07 
 
 
185 aa  94  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0212  NUDIX hydrolase  52.17 
 
 
186 aa  93.6  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.465676  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25181  NUDIX hydrolase  46.73 
 
 
189 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  34.87 
 
 
183 aa  93.2  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1652  NUDIX hydrolase  46.74 
 
 
186 aa  92  7e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.568517  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03661  NUDIX hydrolase  46.74 
 
 
186 aa  92  7e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  33.53 
 
 
176 aa  91.7  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03121  NUDIX hydrolase  44.23 
 
 
189 aa  91.7  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 
178 aa  91.3  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2271  ADP-ribose pyrophosphatase  42.97 
 
 
183 aa  90.5  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  37.41 
 
 
194 aa  90.1  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  51.06 
 
 
186 aa  90.1  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  32.6 
 
 
184 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  36.36 
 
 
179 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1134  NUDIX hydrolase  41.22 
 
 
200 aa  90.1  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 
180 aa  89.7  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  39.46 
 
 
171 aa  89.7  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
179 aa  89.4  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  41.04 
 
 
184 aa  89  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  41.78 
 
 
173 aa  89  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  35.59 
 
 
179 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  32.45 
 
 
182 aa  88.2  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  34.46 
 
 
199 aa  86.7  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  37.16 
 
 
179 aa  86.3  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  37.16 
 
 
179 aa  86.3  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  37.16 
 
 
179 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  38.29 
 
 
199 aa  86.3  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  37.16 
 
 
179 aa  86.3  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  37.16 
 
 
179 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  37.16 
 
 
179 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 
179 aa  85.9  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 
195 aa  86.3  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  37.97 
 
 
173 aa  85.9  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  44 
 
 
182 aa  85.9  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  35.17 
 
 
211 aa  85.5  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  45.92 
 
 
204 aa  85.5  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  37.97 
 
 
173 aa  85.5  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3089  NUDIX hydrolase  40 
 
 
177 aa  85.5  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1716  NUDIX hydrolase  34.64 
 
 
171 aa  85.5  6e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0743315 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 
204 aa  85.1  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2771  NUDIX hydrolase  35.52 
 
 
192 aa  85.1  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
169 aa  85.1  8e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>