More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0048 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  100 
 
 
173 aa  345  1e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3354  mutT/nudix family protein  78.7 
 
 
173 aa  258  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0176  NUDIX hydrolase  72.25 
 
 
173 aa  255  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0982781  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  66.27 
 
 
173 aa  241  5e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  65.68 
 
 
173 aa  239  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  40.25 
 
 
176 aa  133  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
172 aa  131  6e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  42.26 
 
 
179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  38.99 
 
 
177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  40.49 
 
 
178 aa  128  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  42.04 
 
 
281 aa  124  9e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  35.33 
 
 
182 aa  123  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  38.65 
 
 
179 aa  123  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  41.01 
 
 
183 aa  122  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  38.65 
 
 
179 aa  122  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  38.65 
 
 
179 aa  122  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  38.65 
 
 
179 aa  122  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  38.65 
 
 
179 aa  122  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  38.65 
 
 
179 aa  122  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  38.04 
 
 
179 aa  122  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  38.65 
 
 
179 aa  122  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 
186 aa  121  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  42.41 
 
 
186 aa  122  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  38.65 
 
 
179 aa  120  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  38.04 
 
 
179 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  36.16 
 
 
180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 
184 aa  118  4.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  39.76 
 
 
180 aa  117  6e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  42.14 
 
 
171 aa  117  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  34.76 
 
 
179 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  36.71 
 
 
179 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  38.36 
 
 
180 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  42.04 
 
 
190 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  38.61 
 
 
179 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 
178 aa  114  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  36.9 
 
 
175 aa  114  8.999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  37.74 
 
 
185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 
184 aa  112  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  34.15 
 
 
176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0238  NUDIX hydrolase  44.37 
 
 
186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  33.76 
 
 
184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  39.49 
 
 
177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  36.47 
 
 
194 aa  108  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  36.02 
 
 
177 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  36.2 
 
 
180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1876  NUDIX hydrolase  41.03 
 
 
203 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.48572 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2896  NUDIX hydrolase  35.58 
 
 
166 aa  106  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03121  NUDIX hydrolase  36.9 
 
 
189 aa  106  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  33.53 
 
 
176 aa  106  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25181  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
189 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
164 aa  104  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  35.98 
 
 
175 aa  104  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
182 aa  103  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  38.15 
 
 
201 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  40.38 
 
 
205 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  40.88 
 
 
204 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0212  NUDIX hydrolase  41.55 
 
 
186 aa  102  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.465676  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  36.2 
 
 
180 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  36.2 
 
 
180 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  35.9 
 
 
176 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03661  NUDIX hydrolase  41.43 
 
 
186 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2199  NUDIX hydrolase  39.1 
 
 
203 aa  101  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1652  NUDIX hydrolase  40.71 
 
 
186 aa  100  8e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.568517  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  39.88 
 
 
211 aa  100  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  39.22 
 
 
184 aa  100  9e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  38.57 
 
 
214 aa  100  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2211  NUDIX hydrolase  45.65 
 
 
164 aa  100  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1418  ADP-ribose pyrophosphatase  35 
 
 
207 aa  100  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.656759  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 
184 aa  99.8  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2271  ADP-ribose pyrophosphatase  34.97 
 
 
183 aa  99  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  40 
 
 
185 aa  99  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
187 aa  98.6  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  38.92 
 
 
192 aa  98.6  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
204 aa  98.6  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 
196 aa  98.2  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 
196 aa  98.2  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  38.82 
 
 
178 aa  97.4  8e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 
196 aa  97.4  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 
201 aa  96.7  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1134  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
200 aa  96.7  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1336  NUDIX hydrolase  42.58 
 
 
171 aa  96.7  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.723792 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 
189 aa  96.3  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  38.19 
 
 
187 aa  96.3  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  33.13 
 
 
199 aa  96.7  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1314  NUDIX family hydrolase  38.31 
 
 
196 aa  95.5  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.861294  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0722  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  38.31 
 
 
196 aa  95.5  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1814  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  38.31 
 
 
196 aa  95.5  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0428  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  38.31 
 
 
196 aa  95.5  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1305  NUDIX family hydrolase  38.31 
 
 
196 aa  95.5  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9435  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
195 aa  95.5  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  37.86 
 
 
171 aa  95.9  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1145  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  38.31 
 
 
196 aa  95.5  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107087  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  41.96 
 
 
210 aa  95.1  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  38.31 
 
 
196 aa  94.7  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1515  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 
208 aa  94.7  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 
187 aa  95.1  5e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  37.82 
 
 
196 aa  94.7  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  37.82 
 
 
196 aa  94.7  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1451  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.66 
 
 
196 aa  94.4  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 
176 aa  94  9e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>