More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2771 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2771  NUDIX hydrolase  100 
 
 
192 aa  381  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1424  NUDIX hydrolase  42.2 
 
 
188 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.884669  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1544  NUDIX hydrolase  36.78 
 
 
186 aa  124  7e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1344  hypothetical protein  36.05 
 
 
265 aa  122  3e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.321071  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3605  NUDIX hydrolase  38.29 
 
 
181 aa  122  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6545  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
188 aa  121  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3069  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 
188 aa  120  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  38.29 
 
 
181 aa  118  6e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  38.73 
 
 
178 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1495  NUDIX hydrolase  35.47 
 
 
182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.403846  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  40 
 
 
180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5000  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
180 aa  112  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1677  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 
192 aa  112  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.855535  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1221  NUDIX hydrolase  31.84 
 
 
190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0039  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 
183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03191  NUDIX hydrolase  38.36 
 
 
186 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.798424  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0237  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 
183 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373824  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0982  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
177 aa  105  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.76015  normal  0.0931916 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  38.36 
 
 
180 aa  103  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 
179 aa  103  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0673  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 
191 aa  102  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3586  NUDIX hydrolase  33.72 
 
 
186 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3899  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 
187 aa  102  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 
177 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2467  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 
181 aa  101  6e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3513  NUDIX hydrolase  35.47 
 
 
184 aa  100  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.200164 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  36.57 
 
 
179 aa  100  9e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  35.36 
 
 
186 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  35.22 
 
 
187 aa  99.8  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  32.93 
 
 
179 aa  99.8  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  35.06 
 
 
199 aa  99.4  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 
195 aa  99.4  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  33.52 
 
 
187 aa  98.2  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  35.67 
 
 
209 aa  98.2  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  35.67 
 
 
209 aa  98.2  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  35.22 
 
 
187 aa  98.2  6e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  32.18 
 
 
184 aa  98.2  7e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  35.23 
 
 
184 aa  97.8  7e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 
194 aa  97.8  9e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1222  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 
166 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524014  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 
212 aa  97.4  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  34.46 
 
 
215 aa  97.1  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0212  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 
186 aa  96.3  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.465676  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  33.95 
 
 
185 aa  96.7  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 
209 aa  95.9  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0604  NUDIX hydrolase  37.7 
 
 
187 aa  96.3  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0701215  normal  0.289612 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  32.94 
 
 
182 aa  95.5  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 
183 aa  95.5  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 
183 aa  94.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  37.42 
 
 
177 aa  94.7  7e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 
184 aa  94.7  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  33.89 
 
 
199 aa  94  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  35.15 
 
 
179 aa  92.4  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2271  ADP-ribose pyrophosphatase  33.14 
 
 
183 aa  92  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  29.89 
 
 
177 aa  92  4e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0722  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 
184 aa  92  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1444  NUDIX hydrolase  31.18 
 
 
181 aa  92  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.9766  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03661  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 
186 aa  92  4e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 
204 aa  92  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  30 
 
 
183 aa  92  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  30 
 
 
176 aa  92  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25181  NUDIX hydrolase  36.62 
 
 
189 aa  92  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4063  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 
228 aa  91.7  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0818284  normal  0.284545 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  30.81 
 
 
205 aa  91.3  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  33.89 
 
 
186 aa  91.3  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  33.97 
 
 
281 aa  91.3  9e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  33.72 
 
 
185 aa  91.3  9e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 
211 aa  91.3  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  36.69 
 
 
179 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  30.86 
 
 
182 aa  89.7  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 
180 aa  89.4  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  33.15 
 
 
179 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  36.69 
 
 
179 aa  89.4  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1242  NUDIX hydrolase  33.54 
 
 
182 aa  89  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3745  NUDIX hydrolase  34.66 
 
 
182 aa  88.6  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  34.78 
 
 
194 aa  88.6  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 
176 aa  88.2  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0238  NUDIX hydrolase  34.39 
 
 
186 aa  88.2  7e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2199  NUDIX hydrolase  31.98 
 
 
203 aa  88.2  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  33.95 
 
 
194 aa  87.8  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
196 aa  87.8  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
196 aa  87.8  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  32.42 
 
 
211 aa  87.8  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1652  NUDIX hydrolase  29.94 
 
 
186 aa  87.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.568517  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 
204 aa  87.4  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
196 aa  87  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5882  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 
191 aa  87  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  29.17 
 
 
176 aa  87  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  33.92 
 
 
214 aa  87.4  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2672  NUDIX hydrolase  31.87 
 
 
184 aa  86.7  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.687973  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
208 aa  86.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1651  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
163 aa  86.3  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 
173 aa  85.9  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1336  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
171 aa  86.3  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.723792 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0185  hypothetical protein  32.37 
 
 
335 aa  86.3  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.533354  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001880  ADP compounds hydrolase NudE  33.52 
 
 
189 aa  85.5  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00613  ADP-ribose diphosphatase NudE  32.96 
 
 
188 aa  85.5  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  36.09 
 
 
179 aa  85.5  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  36.09 
 
 
179 aa  85.5  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  29.76 
 
 
176 aa  85.9  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>