More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2474 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2474  MutT/nudix family protein  100 
 
 		 182 aa  372  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.131904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1662  NUDIX hydrolase  57.76 
 
 		 201 aa  200  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2029  NUDIX hydrolase  53.49 
 
 		 184 aa  197  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40025  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0333  MutT/nudix family protein  54.65 
 
 		 189 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0452702  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2826  pyrophosphohydrolase related protein  54.17 
 
 		 192 aa  191  7e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0471  NUDIX hydrolase  51.76 
 
 		 184 aa  186  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0219  NUDIX hydrolase  49.71 
 
 		 184 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2928  NUDIX hydrolase  49.71 
 
 		 189 aa  177  7e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1066  NUDIX hydrolase  44.71 
 
 		 201 aa  158  4e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.133388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3753  NUDIX hydrolase  42.05 
 
 		 206 aa  155  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.641661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  38.12 
 
 		 184 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0271  NUDIX hydrolase  37.79 
 
 		 180 aa  119  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.443042  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2209  NUDIX hydrolase  36.9 
 
 		 184 aa  114  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.022301  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15030  NTP pyrophosphohydrolase  40.61 
 
 		 181 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3049  NUDIX hydrolase  31.98 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2192  NUDIX hydrolase  36.78 
 
 		 179 aa  105  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.349846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  35.22 
 
 		 180 aa  105  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  33.54 
 
 		 178 aa  104  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2429  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  34.76 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 		 181 aa  100  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  42.06 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0180  NUDIX hydrolase  34.3 
 
 		 183 aa  99.4  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195159 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0176  NUDIX hydrolase  40.94 
 
 		 173 aa  99.4  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0982781  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 		 173 aa  98.6  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0157  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 180 aa  97.1  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0179624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 		 177 aa  96.7  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 180 aa  95.1  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 		 183 aa  94.4  8e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 		 199 aa  94.4  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4146  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 		 180 aa  93.6  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  33.95 
 
 		 177 aa  92.8  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 		 215 aa  92.8  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  33.74 
 
 		 177 aa  92  4e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 		 176 aa  91.3  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  36.42 
 
 		 210 aa  90.9  8e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6125  NUDIX hydrolase  35.47 
 
 		 178 aa  90.5  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  36.02 
 
 		 185 aa  90.5  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  36.69 
 
 		 209 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  32.92 
 
 		 182 aa  90.1  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  36.69 
 
 		 209 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  36.69 
 
 		 209 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 180 aa  89  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 		 201 aa  89.4  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2018  NUDIX hydrolase  34.86 
 
 		 192 aa  88.2  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  31.33 
 
 		 171 aa  87.4  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2006  NUDIX hydrolase  36.02 
 
 		 186 aa  87  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00276085  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  36.25 
 
 		 185 aa  87  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  33.55 
 
 		 199 aa  86.7  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 		 178 aa  85.5  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4021  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 		 181 aa  85.1  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4251  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 		 181 aa  85.1  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.0489284 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4096  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 		 181 aa  85.1  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.196207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  33.99 
 
 		 199 aa  84.7  7e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 		 173 aa  84.3  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  32.53 
 
 		 180 aa  84.3  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  32.53 
 
 		 180 aa  84.3  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  35.58 
 
 		 211 aa  84.3  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 196 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  38.76 
 
 		 176 aa  84  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  35.58 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  35.1 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2439  NUDIX hydrolase  30.81 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  31.33 
 
 		 180 aa  82.4  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  34.18 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3586  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6699  NUDIX hydrolase  31.29 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.121967 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  32.34 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1076  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.54 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  33.33 
 
 		 205 aa  81.3  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  29.56 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0978  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  33.76 
 
 		 213 aa  80.9  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  33.95 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1814  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.77 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1305  NUDIX family hydrolase  32.77 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9435  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0428  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.77 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3065  hypothetical protein  32.54 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194764 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1314  NUDIX family hydrolase  32.77 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.861294  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0722  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.77 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  33.53 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1145  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.77 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107087  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1451  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.77 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2174  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0334323  normal  0.0698698 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29440  NUDIX family protein  33.54 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1278  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  30.18 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02241  hypothetical protein  33.54 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0727099  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0703  putative ADP-ribose pyrophosphatase  29.94 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  33.33 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  29.56 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>