More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1278 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1278  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 185 aa  371  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0341  NUDIX hydrolase  54.01 
 
 		 186 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0703  putative ADP-ribose pyrophosphatase  49.71 
 
 		 186 aa  190  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2439  NUDIX hydrolase  47.73 
 
 		 181 aa  162  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14240  ADP-ribose pyrophosphatase  46.07 
 
 		 182 aa  158  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0896  NUDIX hydrolase  50.28 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.22169  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1579  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 		 172 aa  143  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.904804  normal  0.0162238 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2153  NUDIX hydrolase  44.77 
 
 		 176 aa  142  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399297 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4804  NUDIX hydrolase  43.02 
 
 		 188 aa  142  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.483514 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4483  NUDIX hydrolase  42.2 
 
 		 176 aa  131  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2474  MutT/nudix family protein  31.82 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.131904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1716  NUDIX hydrolase  27.44 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0743315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8603  transcriptional regulator, GntR family  28.49 
 
 		 268 aa  75.5  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195942  normal  0.233283 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  28.49 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  33.09 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  29.61 
 
 		 181 aa  72  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  33.91 
 
 		 185 aa  72  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 194 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0471  NUDIX hydrolase  28.09 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 		 178 aa  70.9  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0745  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 		 175 aa  70.5  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  28.83 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3582  NUDIX hydrolase  32.16 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  26.95 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  29.38 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  32.14 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  31.43 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  31.43 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  31.43 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  31.43 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  31.43 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  31.43 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2209  NUDIX hydrolase  29.21 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.022301  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  31.43 
 
 		 179 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1814  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  28.4 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1451  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  28.4 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1314  NUDIX family hydrolase  28.4 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.861294  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0428  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  28.4 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1305  NUDIX family hydrolase  28.4 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9435  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  25.6 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1145  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  28.4 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107087  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0722  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  28.4 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1662  NUDIX hydrolase  26.67 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  27.22 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  26.99 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1076  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  27.95 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  27.33 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1066  NUDIX hydrolase  36.29 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.133388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  24.39 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  29.52 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  27.16 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  27.16 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0603  NUDIX hydrolase  30.18 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0913378  normal  0.29293 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0604  NUDIX hydrolase  31.18 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0701215  normal  0.289612 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  25.88 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2928  NUDIX hydrolase  26.29 
 
 		 189 aa  64.3  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  27.16 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2771  NUDIX hydrolase  26.29 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1429  NUDIX hydrolase  40.22 
 
 		 176 aa  64.3  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.742876  normal  0.0486947 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1592  NUDIX hydrolase  33.13 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1402  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173305  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0333  MutT/nudix family protein  26.04 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0452702  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  23.81 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  29.57 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  30.19 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  23.31 
 
 		 176 aa  62  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  26.54 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1886  NUDIX hydrolase  40.22 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.556059 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  26.54 
 
 		 196 aa  62  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  26.54 
 
 		 196 aa  62  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  30.06 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  31.58 
 
 		 214 aa  62  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  32.59 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2271  ADP-ribose pyrophosphatase  37.29 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  27.95 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13740  NTP pyrophosphohydrolase  29.61 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6125  NUDIX hydrolase  30.06 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4063  NUDIX hydrolase  29.51 
 
 		 228 aa  61.2  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0818284  normal  0.284545 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_398  MutT/nudix, ADP-ribose pyrophosphatase  28.49 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.148699  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  28.99 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  24.85 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  28.99 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114525 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2896  NUDIX hydrolase  24.7 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0456  MutT/nudix family protein  29.52 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0404799  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0157  NUDIX hydrolase  32.33 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0179624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1200  hypothetical protein  34.88 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.552549  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0180  NUDIX hydrolase  31.33 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195159 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  29.51 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  30.28 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1439  NUDIX hydrolase  31.08 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0970  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1424  NUDIX hydrolase  28.32 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.884669  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  26.99 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2826  pyrophosphohydrolase related protein  25.97 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2467  NUDIX hydrolase  35.26 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>