More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4804 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4804  NUDIX hydrolase  100 
 
 
188 aa  369  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.483514 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14240  ADP-ribose pyrophosphatase  64.37 
 
 
182 aa  231  5e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336684  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4483  NUDIX hydrolase  53.89 
 
 
176 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0341  NUDIX hydrolase  47.65 
 
 
186 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0703  putative ADP-ribose pyrophosphatase  47.34 
 
 
186 aa  169  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0896  NUDIX hydrolase  48.02 
 
 
208 aa  143  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.22169  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2439  NUDIX hydrolase  47.59 
 
 
181 aa  143  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1278  NUDIX hydrolase  43.02 
 
 
185 aa  142  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1579  NUDIX hydrolase  43.53 
 
 
172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.904804  normal  0.0162238 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2153  NUDIX hydrolase  45.61 
 
 
176 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.399297 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8603  transcriptional regulator, GntR family  34.3 
 
 
268 aa  90.9  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195942  normal  0.233283 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  27.84 
 
 
184 aa  87.8  8e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  31.87 
 
 
177 aa  87  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  33.52 
 
 
186 aa  86.3  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  35.76 
 
 
171 aa  85.5  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  26.67 
 
 
178 aa  85.1  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  34.16 
 
 
179 aa  84.3  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  30.39 
 
 
186 aa  84.7  8e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  28.65 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1716  NUDIX hydrolase  27.7 
 
 
171 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0743315 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  29.31 
 
 
178 aa  78.2  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  28.49 
 
 
187 aa  77.8  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
187 aa  77  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0227  NUDIX hydrolase  32.05 
 
 
185 aa  77  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.282406  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2209  NUDIX hydrolase  32.34 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.022301  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13740  NTP pyrophosphohydrolase  34.38 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2896  NUDIX hydrolase  27.56 
 
 
166 aa  75.5  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 
178 aa  75.9  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  27.71 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  27.49 
 
 
199 aa  74.7  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  32.24 
 
 
281 aa  74.3  0.0000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  26.83 
 
 
169 aa  73.2  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2271  ADP-ribose pyrophosphatase  35.26 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 
189 aa  72  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  26.99 
 
 
195 aa  72  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  28.93 
 
 
180 aa  70.9  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1886  NUDIX hydrolase  30.57 
 
 
172 aa  70.5  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.556059 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  28.08 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  26.25 
 
 
214 aa  69.7  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  26.71 
 
 
176 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  26.01 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1336  NUDIX hydrolase  34.46 
 
 
171 aa  69.3  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.723792 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  29.41 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  24.68 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  26.22 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  22.81 
 
 
179 aa  67.4  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  27.33 
 
 
179 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  26.62 
 
 
182 aa  67  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 
184 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  32.41 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  26.99 
 
 
183 aa  65.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  27.75 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  28.77 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03191  NUDIX hydrolase  28.85 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.798424  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03661  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  26.74 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  26.74 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  26.74 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  26.74 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  26.74 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  26.74 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0830  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 
177 aa  65.9  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.66661  normal  0.255619 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  27.81 
 
 
177 aa  65.5  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  27.75 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  26.74 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 
201 aa  65.1  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  27.75 
 
 
179 aa  64.3  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  25.77 
 
 
183 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 
176 aa  64.3  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
181 aa  63.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03121  NUDIX hydrolase  28.32 
 
 
189 aa  63.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  26.16 
 
 
179 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0970  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 
220 aa  63.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  32 
 
 
201 aa  63.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  24.1 
 
 
176 aa  63.5  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1429  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 
176 aa  62.8  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.742876  normal  0.0486947 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  22.67 
 
 
180 aa  62.4  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1652  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 
186 aa  62.4  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.568517  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2029  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 
184 aa  62.4  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40025  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  22.67 
 
 
180 aa  62.4  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4063  NUDIX hydrolase  30.46 
 
 
228 aa  62  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0818284  normal  0.284545 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2211  NUDIX hydrolase  27.5 
 
 
164 aa  62  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 
184 aa  61.2  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2835  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 
210 aa  60.5  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0310181  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  25.55 
 
 
177 aa  60.8  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  26.38 
 
 
184 aa  60.8  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  30.52 
 
 
210 aa  60.5  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1200  hypothetical protein  36 
 
 
207 aa  60.5  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.552549  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  26.71 
 
 
180 aa  59.7  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  23.67 
 
 
176 aa  59.7  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2474  MutT/nudix family protein  28.03 
 
 
182 aa  60.1  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.131904  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  28.67 
 
 
180 aa  59.7  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 
199 aa  59.7  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2348  NUDIX hydrolase  31.18 
 
 
210 aa  60.1  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00912328  normal  0.0106592 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
190 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>