More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4483 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4483  NUDIX hydrolase  100 
 
 
176 aa  356  9e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4804  NUDIX hydrolase  53.89 
 
 
188 aa  197  9e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.483514 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14240  ADP-ribose pyrophosphatase  55.17 
 
 
182 aa  193  8.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336684  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0703  putative ADP-ribose pyrophosphatase  51.46 
 
 
186 aa  181  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0341  NUDIX hydrolase  47.65 
 
 
186 aa  164  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1278  NUDIX hydrolase  42.2 
 
 
185 aa  147  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2439  NUDIX hydrolase  42.69 
 
 
181 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2153  NUDIX hydrolase  39.16 
 
 
176 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.399297 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0896  NUDIX hydrolase  41.14 
 
 
208 aa  115  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.22169  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1579  NUDIX hydrolase  37.58 
 
 
172 aa  111  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.904804  normal  0.0162238 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 
179 aa  94.7  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2209  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 
184 aa  94.4  9e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.022301  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  30.82 
 
 
178 aa  93.2  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 
180 aa  92.8  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  29.75 
 
 
182 aa  92  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 
186 aa  91.7  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 
186 aa  87  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 
184 aa  84.3  7e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 
199 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  31.29 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  30.67 
 
 
185 aa  83.2  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 
172 aa  82.8  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  32.91 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  28.4 
 
 
177 aa  79  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2029  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 
184 aa  79.3  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40025  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  31.03 
 
 
176 aa  78.2  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1066  NUDIX hydrolase  32.22 
 
 
201 aa  77.8  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.133388  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 
173 aa  77.8  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  32.1 
 
 
171 aa  77.8  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  28.83 
 
 
214 aa  77.4  0.00000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  29.88 
 
 
176 aa  77  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  32.34 
 
 
184 aa  77  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  28.4 
 
 
179 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
178 aa  76.6  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2474  MutT/nudix family protein  27.98 
 
 
182 aa  76.3  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.131904  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  26.47 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2271  ADP-ribose pyrophosphatase  32.54 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  27.98 
 
 
179 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
179 aa  74.3  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  27.95 
 
 
183 aa  73.9  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  28.74 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  28.74 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  28.49 
 
 
187 aa  73.9  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13740  NTP pyrophosphohydrolase  35.48 
 
 
215 aa  73.6  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  28.57 
 
 
179 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  28.57 
 
 
179 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  28.57 
 
 
179 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  28.57 
 
 
179 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  28.57 
 
 
179 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4146  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  31.29 
 
 
194 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  28.83 
 
 
171 aa  73.2  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  28.57 
 
 
179 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  27.71 
 
 
175 aa  72.8  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  27.22 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  28.74 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  27.1 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  29.52 
 
 
192 aa  72  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  27.38 
 
 
184 aa  72  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
281 aa  71.6  0.000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  25.68 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  31.49 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  30.41 
 
 
189 aa  71.2  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  26.19 
 
 
195 aa  71.2  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  28.93 
 
 
179 aa  71.2  0.000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
173 aa  70.9  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  27.98 
 
 
179 aa  70.9  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8603  transcriptional regulator, GntR family  27.71 
 
 
268 aa  70.9  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195942  normal  0.233283 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1716  NUDIX hydrolase  26.71 
 
 
171 aa  70.5  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0743315 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  27.38 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2771  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
192 aa  70.5  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0600  NUDIX hydrolase  28.74 
 
 
183 aa  70.5  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  26.01 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  31.33 
 
 
175 aa  69.7  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  26.32 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  29.38 
 
 
194 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2211  NUDIX hydrolase  28.12 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1076  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  29.52 
 
 
196 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  30.52 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  35.77 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
201 aa  69.3  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  30 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  27.17 
 
 
187 aa  68.6  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2896  NUDIX hydrolase  27.33 
 
 
166 aa  68.6  0.00000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  27.98 
 
 
176 aa  68.2  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1451  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  29.52 
 
 
196 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  30.82 
 
 
180 aa  68.2  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03661  NUDIX hydrolase  26.38 
 
 
186 aa  68.2  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0428  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  29.52 
 
 
196 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1814  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  29.52 
 
 
196 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1314  NUDIX family hydrolase  29.52 
 
 
196 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.861294  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1305  NUDIX family hydrolase  29.52 
 
 
196 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9435  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  30 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0722  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  29.52 
 
 
196 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1145  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  29.52 
 
 
196 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107087  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  27.74 
 
 
180 aa  67.8  0.00000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  26.04 
 
 
184 aa  67.8  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1652  NUDIX hydrolase  26.99 
 
 
186 aa  67.4  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.568517  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3586  NUDIX hydrolase  28.65 
 
 
186 aa  67.4  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>