More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8603 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8603  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 268 aa  528  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195942  normal  0.233283 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0341  NUDIX hydrolase  29.34 
 
 		 186 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0703  putative ADP-ribose pyrophosphatase  28.49 
 
 		 186 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4804  NUDIX hydrolase  34.3 
 
 		 188 aa  99.4  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.483514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1579  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 		 172 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.904804  normal  0.0162238 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2439  NUDIX hydrolase  28.24 
 
 		 181 aa  89.4  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1278  NUDIX hydrolase  28.49 
 
 		 185 aa  86.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14240  ADP-ribose pyrophosphatase  29.78 
 
 		 182 aa  86.3  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336684  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2153  NUDIX hydrolase  28.65 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399297 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4483  NUDIX hydrolase  27.71 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0037  GntR domain protein  47.14 
 
 		 234 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  24.39 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0031  GntR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0896  NUDIX hydrolase  27.84 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.22169  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  39.76 
 
 		 250 aa  62  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  43.28 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  46.58 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  22.62 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6494  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 		 482 aa  59.3  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6505  transcriptional regulator, GntR family  44.44 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381857  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  50.79 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  42.67 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0895  GntR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  42.67 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  48.44 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  48.44 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  25 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  26.22 
 
 		 180 aa  57  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1886  NUDIX hydrolase  27.98 
 
 		 172 aa  57  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.556059 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  41.33 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0402  GntR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0646  GntR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 473 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  42.5 
 
 		 237 aa  57  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  25.22 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  44 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  47.62 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  44 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  27.5 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1297  GntR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 480 aa  55.5  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  45 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03757  predicted DNA-binding transcriptional regulator  42.65 
 
 		 236 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4114  transcriptional regulator, GntR family  42.65 
 
 		 236 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  45 
 
 		 257 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  41.25 
 
 		 237 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  43.28 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03706  hypothetical protein  42.65 
 
 		 233 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4099  GntR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 236 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4395  GntR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 236 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4144  GntR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 236 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.815119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8112  transcriptional regulator, GntR family  51.79 
 
 		 252 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4257  GntR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 236 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.882891 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5318  transcriptional regulator, GntR family  42.65 
 
 		 236 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  49.02 
 
 		 244 aa  54.7  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1626  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60188  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0620  transcriptional regulator, GntR family  42.59 
 
 		 466 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  45.61 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4719  transcriptional regulator, GntR family  42.59 
 
 		 466 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  44.62 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 248 aa  53.5  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  45 
 
 		 249 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0638  transcriptional regulator, GntR family  40.74 
 
 		 466 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 240 aa  53.9  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0763  transcriptional regulator, GntR family  43.42 
 
 		 242 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.747826  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1196  GntR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 248 aa  53.5  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1100  GntR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 253 aa  53.5  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  39.19 
 
 		 257 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  46.03 
 
 		 232 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1061  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  40.98 
 
 		 253 aa  53.5  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488956  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2592  GntR domain protein  39.44 
 
 		 240 aa  53.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13093  normal  0.0457135 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4768  GntR domain-containing protein  44.62 
 
 		 233 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 257 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1429  NUDIX hydrolase  27.81 
 
 		 176 aa  53.5  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.742876  normal  0.0486947 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  45.31 
 
 		 256 aa  53.5  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  42.03 
 
 		 261 aa  53.5  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4759  GntR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 259 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000856086  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 244 aa  53.1  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4653  transcriptional regulator, GntR family  37.35 
 
 		 145 aa  53.1  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1805  GntR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 504 aa  53.1  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4633  GntR domain-containing protein  44.62 
 
 		 233 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.320715  hitchhiker  0.000883916 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 249 aa  53.1  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2743  transcriptional regulator, GntR family protein  42.03 
 
 		 263 aa  53.1  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  23.81 
 
 		 176 aa  52.8  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0496  transcriptional regulator  42.59 
 
 		 466 aa  52.4  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 261 aa  52.8  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0929  GntR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 232 aa  52.4  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0628731  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2915  GntR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 249 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  25.43 
 
 		 186 aa  52.4  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  49.02 
 
 		 273 aa  52.8  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  36.92 
 
 		 251 aa  52.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0708  transcriptional regulator, GntR family  37.97 
 
 		 466 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>