More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0267 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
248 aa  494  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1196  GntR family transcriptional regulator  81.45 
 
 
248 aa  411  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  40.33 
 
 
240 aa  157  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  35.25 
 
 
243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  41.25 
 
 
243 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  35.8 
 
 
247 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
248 aa  142  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
243 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
243 aa  143  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
243 aa  143  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
243 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
243 aa  142  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  37.71 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  37.71 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  39.18 
 
 
241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
225 aa  133  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2626  transcriptional regulator, GntR family  33.2 
 
 
256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000663973  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 
255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
247 aa  123  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  35.39 
 
 
245 aa  122  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3544  GntR family transcriptional regulator  33.74 
 
 
256 aa  122  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0335375  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05542  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  34.71 
 
 
273 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0364359  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0513  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0447  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.567966  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  33.74 
 
 
252 aa  117  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2176  GntR family transcriptional regulator  34.89 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2077  GntR family transcriptional regulator  34.89 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.340396  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3960  transcriptional regulator, GntR family  33.06 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130566  normal  0.0173208 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2284  GntR family transcriptional regulator  34.89 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  34.75 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3846  transcriptional regulator, GntR family  33.06 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00362277  normal  0.959313 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0791  transcriptional regulator, GntR family  35.12 
 
 
261 aa  116  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1857  transcriptional regulator, GntR family  33.61 
 
 
242 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  32.63 
 
 
247 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  32.1 
 
 
249 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  32.1 
 
 
249 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  34.16 
 
 
270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2509  GntR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.31596  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  30.25 
 
 
243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4060  transcriptional regulator, GntR family  35.68 
 
 
245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.533333 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1473  transcriptional regulator, GntR family  33.75 
 
 
285 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4840  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
270 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 
241 aa  113  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2751  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.63 
 
 
239 aa  112  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  26.81 
 
 
241 aa  112  6e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5389  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 
260 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  29.66 
 
 
244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  33.91 
 
 
244 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  32.1 
 
 
249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3508  GntR family transcriptional regulator  34.71 
 
 
246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2743  GntR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.927097  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4198  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5870  GntR family transcriptional regulator  37.55 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 
233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  32.39 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.76 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2648  transcriptional regulator, GntR family  32.2 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1074  transcriptional regulator, GntR family  29.51 
 
 
242 aa  110  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2885  GntR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
244 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.790974  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  32.51 
 
 
246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2836  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 
244 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2758  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.39 
 
 
240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  27.16 
 
 
239 aa  109  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4030  putative transcriptional regulator, GntR family  37.76 
 
 
246 aa  109  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000148337  normal  0.107748 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
258 aa  109  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  28.4 
 
 
252 aa  108  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  33.47 
 
 
269 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2212  GntR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
244 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189171  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2825  GntR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
244 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214074  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6155  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 
244 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272713  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  33.47 
 
 
246 aa  108  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0913  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 
241 aa  107  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1710  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 
245 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  34.82 
 
 
286 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2908  transcriptional regulator, GntR family  31.76 
 
 
254 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1454  GntR family transcriptional regulator  34.01 
 
 
255 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0754  GntR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
248 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304598  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  32.77 
 
 
269 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0856  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 
241 aa  107  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  32.63 
 
 
274 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  26.75 
 
 
239 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 
248 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0552  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 
248 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689242  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2257  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 
248 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1903  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.2 
 
 
266 aa  106  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.380423 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0478  GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 
244 aa  106  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0696996  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1100  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 
248 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.100378  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 
256 aa  106  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2130  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 
248 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0946  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 
248 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406281  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1730  GntR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
252 aa  106  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782156  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 
256 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
236 aa  106  3e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0949  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 
248 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  30.45 
 
 
256 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  30.45 
 
 
256 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  30.45 
 
 
256 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>